14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB05560 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006684  CNB05560  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 1317 aa  2740    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104177  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_2458  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  27.05 
 
 		 377 aa  74.3  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0995914 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29142  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  25.42 
 
 		 632 aa  68.2  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00572015  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29618  predicted protein  22.75 
 
 		 744 aa  52.4  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2266  pentapeptide repeat-containing protein  24.32 
 
 		 1225 aa  50.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_25441  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  25.35 
 
 		 739 aa  50.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.224466  normal  0.223836 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25918  predicted protein  25.35 
 
 		 739 aa  50.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.304205  normal  0.0200478 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01300  conserved hypothetical protein  23.73 
 
 		 760 aa  50.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00232907  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32043  predicted protein  21.87 
 
 		 889 aa  50.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485159  normal  0.0952764 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_89032  predicted protein  29.35 
 
 		 683 aa  50.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.356102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19174  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  29.35 
 
 		 629 aa  50.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0365143 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30981  predicted protein  22.81 
 
 		 439 aa  47  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116585  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10498  translation regulator (Cya5), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03930)  21.02 
 
 		 1240 aa  45.8  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31572  predicted protein  22.29 
 
 		 536 aa  45.8  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.314666  normal  0.270485 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>