34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_31572 on replicon NC_009359
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009359  OSTLU_31572  predicted protein  100 
 
 
536 aa  1110    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.314666  normal  0.270485 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14352  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  25.35 
 
 
444 aa  86.3  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.373458  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29618  predicted protein  25.28 
 
 
744 aa  85.5  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29142  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  27.17 
 
 
632 aa  80.5  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00572015  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_2458  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  23.96 
 
 
377 aa  79  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0995914 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2266  pentapeptide repeat-containing protein  23.86 
 
 
1225 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468941  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42688  predicted protein  27.78 
 
 
700 aa  72.8  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01190  conserved hypothetical protein  26.02 
 
 
1464 aa  72.4  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50411  predicted protein  26.88 
 
 
423 aa  64.3  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.918794  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_89032  predicted protein  25.4 
 
 
683 aa  61.6  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.356102  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19174  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  25.4 
 
 
629 aa  62  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0365143 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32043  predicted protein  23.92 
 
 
889 aa  60.1  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485159  normal  0.0952764 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30981  predicted protein  26.27 
 
 
439 aa  59.3  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116585  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47986  predicted protein  25.31 
 
 
712 aa  59.3  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45520  predicted protein  23.67 
 
 
860 aa  57.4  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.995437  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34060  predicted protein  22.99 
 
 
576 aa  54.7  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45345  predicted protein  28.46 
 
 
575 aa  53.9  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.824285  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01300  conserved hypothetical protein  23.35 
 
 
760 aa  53.1  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00232907  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_9534  predicted protein  28.43 
 
 
101 aa  52  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33231  predicted protein  24.88 
 
 
918 aa  51.6  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36970  predicted protein  26.13 
 
 
414 aa  51.2  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43865  predicted protein  25.27 
 
 
1224 aa  51.2  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0745753  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10285  pentatricopeptide repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_5G10660)  22.67 
 
 
1272 aa  50.8  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47331  predicted protein  23.12 
 
 
879 aa  50.4  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.217105  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49258  predicted protein  24.23 
 
 
1167 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49642  predicted protein  26.53 
 
 
705 aa  47  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04706  putative PPR repeats containing protein  25.15 
 
 
1373 aa  45.8  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.380322 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05560  conserved hypothetical protein  22.29 
 
 
1317 aa  45.8  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104177  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29163  predicted protein  24.38 
 
 
505 aa  45.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0206016  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50002  predicted protein  30.06 
 
 
1122 aa  45.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.736142  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49851  predicted protein  25.19 
 
 
703 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.165107  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44671  predicted protein  25.19 
 
 
428 aa  44.3  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.364916  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45435  predicted protein  22.53 
 
 
784 aa  43.9  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.347089  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39052  predicted protein  22.8 
 
 
481 aa  43.5  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>