32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44671 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_44671  predicted protein  100 
 
 
428 aa  882    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.364916  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34060  predicted protein  27.02 
 
 
576 aa  114  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49258  predicted protein  27.54 
 
 
1167 aa  99.4  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54064  predicted protein  31.88 
 
 
447 aa  99.4  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530235  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43471  predicted protein  30.58 
 
 
785 aa  90.9  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45435  predicted protein  28.3 
 
 
784 aa  86.7  8e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.347089  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49642  predicted protein  28.4 
 
 
705 aa  85.5  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43695  predicted protein  32.85 
 
 
1060 aa  75.9  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.044454  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45345  predicted protein  28.5 
 
 
575 aa  71.6  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.824285  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47331  predicted protein  23.77 
 
 
879 aa  71.2  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.217105  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47702  predicted protein  23.73 
 
 
994 aa  68.6  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34138  predicted protein  24.92 
 
 
647 aa  67.8  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45149  predicted protein  24.46 
 
 
537 aa  65.9  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33231  predicted protein  28.74 
 
 
918 aa  64.3  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47265  predicted protein  25.31 
 
 
709 aa  64.3  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.285264  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_2458  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  33.57 
 
 
377 aa  63.2  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0995914 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47986  predicted protein  21.5 
 
 
712 aa  61.6  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49009  predicted protein  23.2 
 
 
1039 aa  60.5  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43645  predicted protein  22.66 
 
 
862 aa  58.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0711576  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45520  predicted protein  28.57 
 
 
860 aa  58.2  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.995437  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19174  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  24.14 
 
 
629 aa  55.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0365143 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50061  predicted protein  25.21 
 
 
886 aa  55.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.29853  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_89032  predicted protein  24.14 
 
 
683 aa  55.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.356102  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45879  predicted protein  22.93 
 
 
1040 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50002  predicted protein  25 
 
 
1122 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.736142  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49851  predicted protein  24.46 
 
 
703 aa  50.4  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.165107  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29618  predicted protein  29.29 
 
 
744 aa  49.7  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50515  predicted protein  23.88 
 
 
1010 aa  47.8  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04706  putative PPR repeats containing protein  27.81 
 
 
1373 aa  46.6  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.380322 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45711  predicted protein  23.04 
 
 
775 aa  46.6  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00177654  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31572  predicted protein  25.19 
 
 
536 aa  44.3  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.314666  normal  0.270485 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42688  predicted protein  27.13 
 
 
700 aa  43.9  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>