43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_34060 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_34060  predicted protein  100 
 
 
576 aa  1206    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49258  predicted protein  36.12 
 
 
1167 aa  309  1.0000000000000001e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47331  predicted protein  27.45 
 
 
879 aa  226  1e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.217105  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43695  predicted protein  30.12 
 
 
1060 aa  223  6e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.044454  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54064  predicted protein  34.33 
 
 
447 aa  215  1.9999999999999998e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530235  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50515  predicted protein  33.6 
 
 
1010 aa  191  2.9999999999999997e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49009  predicted protein  27.29 
 
 
1039 aa  184  5.0000000000000004e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45435  predicted protein  27.59 
 
 
784 aa  172  1e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.347089  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43471  predicted protein  25 
 
 
785 aa  167  5.9999999999999996e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45149  predicted protein  30.88 
 
 
537 aa  150  5e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47702  predicted protein  25.2 
 
 
994 aa  144  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49851  predicted protein  27.57 
 
 
703 aa  143  7e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.165107  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49642  predicted protein  25.52 
 
 
705 aa  140  4.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47265  predicted protein  24.42 
 
 
709 aa  140  7.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.285264  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45345  predicted protein  26 
 
 
575 aa  135  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.824285  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45879  predicted protein  26.11 
 
 
1040 aa  129  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45520  predicted protein  27.94 
 
 
860 aa  128  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.995437  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47986  predicted protein  27.74 
 
 
712 aa  122  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43645  predicted protein  26.84 
 
 
862 aa  119  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0711576  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44671  predicted protein  27.02 
 
 
428 aa  114  5e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.364916  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50061  predicted protein  27.15 
 
 
886 aa  109  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.29853  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34138  predicted protein  26.38 
 
 
647 aa  107  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33231  predicted protein  26.17 
 
 
918 aa  108  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41008  predicted protein  23.43 
 
 
823 aa  99.8  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43575  predicted protein  21.71 
 
 
737 aa  97.8  5e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.835069  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50002  predicted protein  25.67 
 
 
1122 aa  93.2  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.736142  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45711  predicted protein  25.32 
 
 
775 aa  80.1  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00177654  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48455  predicted protein  23.43 
 
 
614 aa  77.8  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43112  predicted protein  24.13 
 
 
708 aa  77.4  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_2458  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  20.8 
 
 
377 aa  68.6  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0995914 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19174  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  25.99 
 
 
629 aa  67.4  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0365143 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_89032  predicted protein  25.99 
 
 
683 aa  67.4  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.356102  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48215  predicted protein  21.23 
 
 
879 aa  66.6  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29618  predicted protein  23.08 
 
 
744 aa  55.5  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31572  predicted protein  22.99 
 
 
536 aa  54.3  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.314666  normal  0.270485 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42688  predicted protein  26.7 
 
 
700 aa  53.9  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29142  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  24 
 
 
632 aa  53.9  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00572015  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04706  putative PPR repeats containing protein  25.51 
 
 
1373 aa  50.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.380322 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01190  conserved hypothetical protein  24.89 
 
 
1464 aa  47  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44221  predicted protein  27.64 
 
 
249 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44880  predicted protein  22.13 
 
 
717 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42432  predicted protein  32.93 
 
 
409 aa  45.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10285  pentatricopeptide repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_5G10660)  20.68 
 
 
1272 aa  44.7  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>