39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_33231 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_33231  predicted protein  100 
 
 
918 aa  1915    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49009  predicted protein  22.77 
 
 
1039 aa  157  7e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49258  predicted protein  25.04 
 
 
1167 aa  153  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43695  predicted protein  22.95 
 
 
1060 aa  139  4e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.044454  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50515  predicted protein  24.8 
 
 
1010 aa  126  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49851  predicted protein  23.82 
 
 
703 aa  124  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.165107  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45520  predicted protein  25.11 
 
 
860 aa  115  5e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.995437  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47331  predicted protein  23.15 
 
 
879 aa  109  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.217105  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34060  predicted protein  26.17 
 
 
576 aa  107  9e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47986  predicted protein  23.81 
 
 
712 aa  106  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50061  predicted protein  21.55 
 
 
886 aa  99  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.29853  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50002  predicted protein  22.34 
 
 
1122 aa  94.7  7e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.736142  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43645  predicted protein  21.63 
 
 
862 aa  93.6  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0711576  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43471  predicted protein  21.14 
 
 
785 aa  91.7  6e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47265  predicted protein  23.19 
 
 
709 aa  91.3  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.285264  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45879  predicted protein  28.67 
 
 
1040 aa  84.3  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19174  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  24.35 
 
 
629 aa  77.8  0.0000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0365143 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_89032  predicted protein  24.35 
 
 
683 aa  77.4  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.356102  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_2458  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  24.16 
 
 
377 aa  75.9  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0995914 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45435  predicted protein  21.93 
 
 
784 aa  73.6  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.347089  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41008  predicted protein  21.96 
 
 
823 aa  71.6  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49642  predicted protein  22.81 
 
 
705 aa  69.3  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45711  predicted protein  24.33 
 
 
775 aa  67  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00177654  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43112  predicted protein  20.82 
 
 
708 aa  66.6  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45345  predicted protein  23.11 
 
 
575 aa  65.5  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.824285  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04706  putative PPR repeats containing protein  32.43 
 
 
1373 aa  64.3  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.380322 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44671  predicted protein  28.74 
 
 
428 aa  64.3  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.364916  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47702  predicted protein  22.04 
 
 
994 aa  63.5  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45149  predicted protein  26.73 
 
 
537 aa  62.4  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54064  predicted protein  27.54 
 
 
447 aa  62.4  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530235  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29142  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  24.15 
 
 
632 aa  58.5  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00572015  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29618  predicted protein  25 
 
 
744 aa  53.9  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31572  predicted protein  24.88 
 
 
536 aa  51.6  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.314666  normal  0.270485 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48215  predicted protein  23.08 
 
 
879 aa  49.7  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14352  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  21.71 
 
 
444 aa  50.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.373458  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01190  conserved hypothetical protein  20.91 
 
 
1464 aa  47.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30981  predicted protein  26.7 
 
 
439 aa  45.1  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116585  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50411  predicted protein  23.21 
 
 
423 aa  45.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.918794  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32043  predicted protein  19.31 
 
 
889 aa  44.3  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485159  normal  0.0952764 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>