28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS04706 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS04706  putative PPR repeats containing protein  100 
 
 		 1373 aa  2749    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.380322 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29618  predicted protein  32.22 
 
 		 744 aa  79.3  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42688  predicted protein  31.13 
 
 		 700 aa  77  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36970  predicted protein  34.23 
 
 		 414 aa  66.2  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_2458  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  28.32 
 
 		 377 aa  65.9  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0995914 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33231  predicted protein  32.43 
 
 		 918 aa  64.7  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24879  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  29.54 
 
 		 424 aa  63.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29142  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  28.57 
 
 		 632 aa  62.8  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00572015  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43645  predicted protein  27.75 
 
 		 862 aa  62  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0711576  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54064  predicted protein  29.3 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530235  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01190  conserved hypothetical protein  29.3 
 
 		 1464 aa  56.6  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49642  predicted protein  27.52 
 
 		 705 aa  54.7  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49258  predicted protein  27.41 
 
 		 1167 aa  54.3  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50515  predicted protein  30.32 
 
 		 1010 aa  52.4  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50411  predicted protein  37.12 
 
 		 423 aa  51.2  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.918794  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45435  predicted protein  24.66 
 
 		 784 aa  50.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.347089  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34060  predicted protein  25.51 
 
 		 576 aa  49.3  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14352  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  28.68 
 
 		 444 aa  48.9  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.373458  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01800  conserved hypothetical protein  26.32 
 
 		 551 aa  48.5  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_92797  predicted protein  29.25 
 
 		 837 aa  48.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.189677  normal  0.345791 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2266  pentapeptide repeat-containing protein  31.49 
 
 		 1225 aa  48.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50002  predicted protein  23.16 
 
 		 1122 aa  47.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.736142  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30981  predicted protein  22.77 
 
 		 439 aa  47.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116585  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44671  predicted protein  27.81 
 
 		 428 aa  47  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.364916  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31572  predicted protein  25.15 
 
 		 536 aa  45.8  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.314666  normal  0.270485 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45520  predicted protein  28.16 
 
 		 860 aa  45.4  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.995437  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50546  predicted protein  24.09 
 
 		 705 aa  45.4  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43695  predicted protein  22.96 
 
 		 1060 aa  45.4  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.044454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>