14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNN01800 on replicon NC_006683
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006683  CNN01800  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 551 aa  1148    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42688  predicted protein  23.91 
 
 		 700 aa  58.5  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29618  predicted protein  22.78 
 
 		 744 aa  55.1  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10784  pentatricopeptide repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_2G12010)  19.08 
 
 		 535 aa  54.3  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.228035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_2458  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  23.12 
 
 		 377 aa  53.5  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0995914 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29142  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  23.58 
 
 		 632 aa  52.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00572015  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01190  conserved hypothetical protein  23.38 
 
 		 1464 aa  50.4  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04706  putative PPR repeats containing protein  26.32 
 
 		 1373 aa  48.9  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.380322 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2266  pentapeptide repeat-containing protein  21.81 
 
 		 1225 aa  49.3  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31465  predicted protein  24.37 
 
 		 580 aa  47.4  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10285  pentatricopeptide repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_5G10660)  22.4 
 
 		 1272 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32043  predicted protein  26.23 
 
 		 889 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485159  normal  0.0952764 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_89032  predicted protein  24.82 
 
 		 683 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.356102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19174  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  24.82 
 
 		 629 aa  45.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0365143 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>