35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42688 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42688  predicted protein  100 
 
 		 700 aa  1443    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29618  predicted protein  25 
 
 		 744 aa  90.9  8e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29142  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  24.51 
 
 		 632 aa  85.9  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00572015  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30981  predicted protein  25.93 
 
 		 439 aa  83.6  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116585  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04706  putative PPR repeats containing protein  31.13 
 
 		 1373 aa  77.4  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.380322 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36970  predicted protein  28.71 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50411  predicted protein  32.94 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.918794  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31572  predicted protein  27.78 
 
 		 536 aa  72.8  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.314666  normal  0.270485 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14352  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  25.36 
 
 		 444 aa  72  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.373458  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_2458  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  21.85 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0995914 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49258  predicted protein  26.22 
 
 		 1167 aa  69.7  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01190  conserved hypothetical protein  27.59 
 
 		 1464 aa  60.5  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01800  conserved hypothetical protein  23.91 
 
 		 551 aa  58.5  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50546  predicted protein  26.49 
 
 		 705 aa  56.2  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19174  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  21.79 
 
 		 629 aa  55.5  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0365143 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24879  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  32.98 
 
 		 424 aa  55.8  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_89032  predicted protein  21.79 
 
 		 683 aa  55.1  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.356102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34060  predicted protein  26.7 
 
 		 576 aa  54.3  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31465  predicted protein  26.47 
 
 		 580 aa  52  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49009  predicted protein  22.89 
 
 		 1039 aa  51.6  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54064  predicted protein  25.7 
 
 		 447 aa  51.2  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530235  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50515  predicted protein  28.14 
 
 		 1010 aa  50.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50002  predicted protein  25.65 
 
 		 1122 aa  49.7  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.736142  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47986  predicted protein  20.6 
 
 		 712 aa  49.3  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43695  predicted protein  21.04 
 
 		 1060 aa  48.5  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.044454  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43865  predicted protein  23.96 
 
 		 1224 aa  48.5  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0745753  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32043  predicted protein  21.67 
 
 		 889 aa  47.4  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485159  normal  0.0952764 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49851  predicted protein  27.33 
 
 		 703 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.165107  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_92797  predicted protein  29.27 
 
 		 837 aa  46.2  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.189677  normal  0.345791 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49367  predicted protein  21.32 
 
 		 896 aa  44.7  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.40946  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50061  predicted protein  23.36 
 
 		 886 aa  44.7  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.29853  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25918  predicted protein  22.48 
 
 		 739 aa  44.7  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.304205  normal  0.0200478 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_25441  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  22.48 
 
 		 739 aa  44.7  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.224466  normal  0.223836 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45345  predicted protein  25 
 
 		 575 aa  44.3  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.824285  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33231  predicted protein  24.67 
 
 		 918 aa  44.3  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>