17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_25441 on replicon NC_009367
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009367  OSTLU_25441  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  100 
 
 		 739 aa  1534    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.224466  normal  0.223836 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25918  predicted protein  100 
 
 		 739 aa  1534    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.304205  normal  0.0200478 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10285  pentatricopeptide repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_5G10660)  32 
 
 		 1272 aa  59.7  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49258  predicted protein  22.27 
 
 		 1167 aa  59.3  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32043  predicted protein  21.42 
 
 		 889 aa  58.5  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485159  normal  0.0952764 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14603  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  24.71 
 
 		 792 aa  57  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0183985 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29618  predicted protein  22.03 
 
 		 744 aa  53.9  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01190  conserved hypothetical protein  26.5 
 
 		 1464 aa  50.8  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2266  pentapeptide repeat-containing protein  24 
 
 		 1225 aa  50.8  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468941  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05560  conserved hypothetical protein  25.35 
 
 		 1317 aa  50.4  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104177  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29142  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  21.93 
 
 		 632 aa  50.4  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00572015  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01300  conserved hypothetical protein  26.05 
 
 		 760 aa  49.3  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00232907  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49009  predicted protein  20.37 
 
 		 1039 aa  48.9  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49642  predicted protein  34.04 
 
 		 705 aa  45.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_2458  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  21.25 
 
 		 377 aa  45.4  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0995914 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47986  predicted protein  22.59 
 
 		 712 aa  45.1  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42688  predicted protein  23.26 
 
 		 700 aa  44.7  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>