44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47986 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_47986  predicted protein  100 
 
 
712 aa  1471    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49258  predicted protein  27.25 
 
 
1167 aa  144  5e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49009  predicted protein  25 
 
 
1039 aa  140  7e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47331  predicted protein  22.13 
 
 
879 aa  123  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.217105  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34060  predicted protein  27.74 
 
 
576 aa  121  3.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43695  predicted protein  24.21 
 
 
1060 aa  111  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.044454  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33231  predicted protein  23.92 
 
 
918 aa  105  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43471  predicted protein  23.26 
 
 
785 aa  103  7e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50515  predicted protein  24.24 
 
 
1010 aa  99.8  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49851  predicted protein  27.27 
 
 
703 aa  99.4  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.165107  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45520  predicted protein  23.77 
 
 
860 aa  98.6  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.995437  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43645  predicted protein  25 
 
 
862 aa  95.1  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0711576  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47265  predicted protein  19.51 
 
 
709 aa  85.5  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.285264  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_2458  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  24.36 
 
 
377 aa  77  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0995914 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50061  predicted protein  25.19 
 
 
886 aa  77  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.29853  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50002  predicted protein  21.18 
 
 
1122 aa  75.9  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.736142  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2266  pentapeptide repeat-containing protein  24.42 
 
 
1225 aa  71.6  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468941  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45435  predicted protein  27.35 
 
 
784 aa  70.9  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.347089  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49642  predicted protein  21.48 
 
 
705 aa  69.7  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41008  predicted protein  21.79 
 
 
823 aa  68.9  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_89032  predicted protein  28 
 
 
683 aa  68.9  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.356102  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19174  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  28 
 
 
629 aa  68.6  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0365143 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47702  predicted protein  18.51 
 
 
994 aa  66.2  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43112  predicted protein  23.4 
 
 
708 aa  65.1  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45879  predicted protein  23.16 
 
 
1040 aa  64.7  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29618  predicted protein  20.57 
 
 
744 aa  62.8  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45345  predicted protein  21.69 
 
 
575 aa  61.2  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.824285  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44671  predicted protein  21.5 
 
 
428 aa  60.8  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.364916  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45149  predicted protein  21.97 
 
 
537 aa  60.8  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31572  predicted protein  25.31 
 
 
536 aa  59.3  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.314666  normal  0.270485 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54064  predicted protein  24.93 
 
 
447 aa  57  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530235  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01190  conserved hypothetical protein  23.9 
 
 
1464 aa  56.2  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14352  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  25.65 
 
 
444 aa  55.1  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.373458  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29142  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  25.93 
 
 
632 aa  55.1  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00572015  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48215  predicted protein  25.12 
 
 
879 aa  53.5  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43575  predicted protein  23.38 
 
 
737 aa  50.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.835069  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45711  predicted protein  20.61 
 
 
775 aa  49.7  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00177654  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42688  predicted protein  20.6 
 
 
700 aa  49.3  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31465  predicted protein  27.07 
 
 
580 aa  48.1  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01300  conserved hypothetical protein  21.62 
 
 
760 aa  47.8  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00232907  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34138  predicted protein  22.76 
 
 
647 aa  46.6  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32043  predicted protein  18.93 
 
 
889 aa  45.8  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485159  normal  0.0952764 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_25441  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  22.59 
 
 
739 aa  45.1  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.224466  normal  0.223836 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25918  predicted protein  22.59 
 
 
739 aa  45.1  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.304205  normal  0.0200478 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>