24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH01190 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006693  CNH01190  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 1464 aa  3014    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10285  pentatricopeptide repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_5G10660)  33.84 
 
 		 1272 aa  239  4e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29142  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  26.89 
 
 		 632 aa  80.5  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00572015  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31572  predicted protein  26.02 
 
 		 536 aa  72.4  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.314666  normal  0.270485 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_89032  predicted protein  23.99 
 
 		 683 aa  69.3  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.356102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19174  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  23.99 
 
 		 629 aa  68.9  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0365143 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_2458  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  23.62 
 
 		 377 aa  67.4  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0995914 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32043  predicted protein  19.91 
 
 		 889 aa  61.6  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485159  normal  0.0952764 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42688  predicted protein  27.59 
 
 		 700 aa  60.5  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49258  predicted protein  22.29 
 
 		 1167 aa  58.9  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04706  putative PPR repeats containing protein  29.3 
 
 		 1373 aa  56.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.380322 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29618  predicted protein  22.19 
 
 		 744 aa  56.2  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47986  predicted protein  23.9 
 
 		 712 aa  55.8  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2266  pentapeptide repeat-containing protein  22.71 
 
 		 1225 aa  55.5  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24879  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  36.62 
 
 		 424 aa  51.6  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_25441  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  26.5 
 
 		 739 aa  51.2  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.224466  normal  0.223836 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25918  predicted protein  26.5 
 
 		 739 aa  51.2  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.304205  normal  0.0200478 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54064  predicted protein  35.58 
 
 		 447 aa  50.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530235  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01800  conserved hypothetical protein  23.38 
 
 		 551 aa  50.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49009  predicted protein  24.6 
 
 		 1039 aa  49.7  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14352  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  22.97 
 
 		 444 aa  48.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.373458  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33231  predicted protein  20.3 
 
 		 918 aa  47.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34060  predicted protein  24.89 
 
 		 576 aa  47.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3124  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.38 
 
 		 609 aa  45.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>