25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_14352 on replicon NC_009356
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009356  OSTLU_14352  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  100 
 
 		 444 aa  922    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.373458  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31572  predicted protein  28.08 
 
 		 536 aa  92.8  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.314666  normal  0.270485 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30981  predicted protein  27.27 
 
 		 439 aa  88.2  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116585  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29142  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  28.34 
 
 		 632 aa  80.9  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00572015  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29618  predicted protein  28.21 
 
 		 744 aa  79.3  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42688  predicted protein  25.36 
 
 		 700 aa  75.9  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_2458  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  23.55 
 
 		 377 aa  66.6  0.0000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0995914 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36970  predicted protein  25.32 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19174  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  24.33 
 
 		 629 aa  63.5  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0365143 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_89032  predicted protein  24.4 
 
 		 683 aa  63.2  0.000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.356102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2266  pentapeptide repeat-containing protein  25.27 
 
 		 1225 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50515  predicted protein  31.87 
 
 		 1010 aa  61.6  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32043  predicted protein  20.59 
 
 		 889 aa  58.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485159  normal  0.0952764 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47986  predicted protein  26.02 
 
 		 712 aa  57.4  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33231  predicted protein  21.93 
 
 		 918 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50411  predicted protein  24.76 
 
 		 423 aa  51.6  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.918794  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01190  conserved hypothetical protein  22.97 
 
 		 1464 aa  50.4  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49009  predicted protein  25.56 
 
 		 1039 aa  49.7  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04706  putative PPR repeats containing protein  28.68 
 
 		 1373 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.380322 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05560  conserved hypothetical protein  20.11 
 
 		 1317 aa  45.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104177  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45879  predicted protein  23.27 
 
 		 1040 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10285  pentatricopeptide repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_5G10660)  22.19 
 
 		 1272 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34060  predicted protein  23.26 
 
 		 576 aa  44.3  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47331  predicted protein  23.79 
 
 		 879 aa  44.3  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.217105  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  32.73 
 
 		 402 aa  43.9  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>