43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49009 on replicon NC_011688
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011688  PHATRDRAFT_49009  predicted protein  100 
 
 
1039 aa  2159    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49258  predicted protein  31.16 
 
 
1167 aa  242  2.9999999999999997e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43645  predicted protein  26.71 
 
 
862 aa  207  7e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0711576  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50515  predicted protein  25.87 
 
 
1010 aa  200  1.0000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43695  predicted protein  25.25 
 
 
1060 aa  197  6e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.044454  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47331  predicted protein  26.37 
 
 
879 aa  184  7e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.217105  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34060  predicted protein  27.29 
 
 
576 aa  184  9.000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50002  predicted protein  27.95 
 
 
1122 aa  171  7e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.736142  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45879  predicted protein  24.19 
 
 
1040 aa  164  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49851  predicted protein  28.81 
 
 
703 aa  161  6e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.165107  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41008  predicted protein  26.24 
 
 
823 aa  161  7e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33231  predicted protein  24.46 
 
 
918 aa  157  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43471  predicted protein  24.47 
 
 
785 aa  147  7.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47986  predicted protein  25 
 
 
712 aa  140  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50061  predicted protein  25.11 
 
 
886 aa  140  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.29853  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47265  predicted protein  24.19 
 
 
709 aa  133  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.285264  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45520  predicted protein  24.6 
 
 
860 aa  132  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.995437  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45435  predicted protein  24.82 
 
 
784 aa  123  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.347089  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47702  predicted protein  22.61 
 
 
994 aa  96.7  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45711  predicted protein  21.73 
 
 
775 aa  94.7  8e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00177654  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45149  predicted protein  25.06 
 
 
537 aa  94.4  9e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54064  predicted protein  25.68 
 
 
447 aa  92.4  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530235  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43575  predicted protein  23.15 
 
 
737 aa  82  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.835069  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49642  predicted protein  26.54 
 
 
705 aa  80.5  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43112  predicted protein  22.84 
 
 
708 aa  79.3  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45345  predicted protein  23.22 
 
 
575 aa  76.3  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.824285  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29142  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  24.69 
 
 
632 aa  69.3  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00572015  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_89032  predicted protein  24.21 
 
 
683 aa  67  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.356102  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19174  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  24.21 
 
 
629 aa  67.4  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0365143 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48215  predicted protein  23.21 
 
 
879 aa  67  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34138  predicted protein  22.53 
 
 
647 aa  64.3  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44671  predicted protein  23.2 
 
 
428 aa  60.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.364916  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_2458  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  25.22 
 
 
377 aa  57.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0995914 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44880  predicted protein  24.88 
 
 
717 aa  54.7  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42688  predicted protein  22.89 
 
 
700 aa  51.6  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29618  predicted protein  24.27 
 
 
744 aa  50.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14352  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  25.56 
 
 
444 aa  49.7  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.373458  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01190  conserved hypothetical protein  24.6 
 
 
1464 aa  49.7  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33495  hypothetical protein  26.34 
 
 
741 aa  46.6  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.375404  normal  0.0265895 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25918  predicted protein  20.37 
 
 
739 aa  45.1  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.304205  normal  0.0200478 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_25441  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  20.37 
 
 
739 aa  45.1  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.224466  normal  0.223836 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32043  predicted protein  24.59 
 
 
889 aa  45.1  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485159  normal  0.0952764 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06230  hypothetical protein  29.86 
 
 
900 aa  45.1  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>