31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_32043 on replicon NC_009360
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009360  OSTLU_32043  predicted protein  100 
 
 
889 aa  1846    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485159  normal  0.0952764 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29142  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  22.37 
 
 
632 aa  95.9  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00572015  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2266  pentapeptide repeat-containing protein  24.86 
 
 
1225 aa  90.1  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468941  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29618  predicted protein  23.6 
 
 
744 aa  79  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_2458  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  24.08 
 
 
377 aa  75.9  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0995914 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19174  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  23.44 
 
 
629 aa  62.4  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0365143 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_89032  predicted protein  23.44 
 
 
683 aa  62.4  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.356102  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31572  predicted protein  23.92 
 
 
536 aa  60.5  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.314666  normal  0.270485 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01190  conserved hypothetical protein  19.5 
 
 
1464 aa  58.2  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39052  predicted protein  33.33 
 
 
481 aa  55.5  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10285  pentatricopeptide repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_5G10660)  25.44 
 
 
1272 aa  53.9  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30981  predicted protein  33.7 
 
 
439 aa  53.9  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116585  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_25441  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  21.38 
 
 
739 aa  53.1  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.224466  normal  0.223836 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25918  predicted protein  21.38 
 
 
739 aa  53.1  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.304205  normal  0.0200478 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14352  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  20.59 
 
 
444 aa  52.8  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.373458  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49258  predicted protein  25.33 
 
 
1167 aa  52.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24879  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  27.56 
 
 
424 aa  49.7  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05560  conserved hypothetical protein  21.87 
 
 
1317 aa  50.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104177  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50002  predicted protein  22.32 
 
 
1122 aa  49.3  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.736142  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_9534  predicted protein  29.11 
 
 
101 aa  47.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44446  predicted protein  25.17 
 
 
1354 aa  47.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42688  predicted protein  21.67 
 
 
700 aa  47.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43471  predicted protein  26.63 
 
 
785 aa  46.2  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44794  predicted protein  23.9 
 
 
973 aa  46.2  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10784  pentatricopeptide repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_2G12010)  23.14 
 
 
535 aa  46.2  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.228035  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47986  predicted protein  18.93 
 
 
712 aa  45.8  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01800  conserved hypothetical protein  31.87 
 
 
551 aa  45.8  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14603  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  21.59 
 
 
792 aa  45.4  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0183985 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36970  predicted protein  27.54 
 
 
414 aa  45.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49009  predicted protein  24.59 
 
 
1039 aa  45.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33231  predicted protein  19.31 
 
 
918 aa  44.7  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>