11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_24879 on replicon NC_009361
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009361  OSTLU_24879  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  100 
 
 		 424 aa  837    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29618  predicted protein  28.81 
 
 		 744 aa  65.5  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04706  putative PPR repeats containing protein  29.54 
 
 		 1373 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.380322 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36970  predicted protein  27.27 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29142  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  36.9 
 
 		 632 aa  56.2  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00572015  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42688  predicted protein  32.98 
 
 		 700 aa  55.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01190  conserved hypothetical protein  36.62 
 
 		 1464 aa  51.2  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32043  predicted protein  27.56 
 
 		 889 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485159  normal  0.0952764 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_92797  predicted protein  26.14 
 
 		 837 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.189677  normal  0.345791 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30981  predicted protein  27.33 
 
 		 439 aa  45.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116585  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50546  predicted protein  28.75 
 
 		 705 aa  43.5  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>