11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_92797 on replicon NC_009359
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009359  OSTLU_92797  predicted protein  100 
 
 		 837 aa  1694    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.189677  normal  0.345791 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29142  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  28.26 
 
 		 632 aa  60.1  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00572015  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29618  predicted protein  19.85 
 
 		 744 aa  48.5  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04706  putative PPR repeats containing protein  29.25 
 
 		 1373 aa  48.1  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.380322 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50546  predicted protein  34.15 
 
 		 705 aa  47.8  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2266  pentapeptide repeat-containing protein  28.1 
 
 		 1225 aa  47.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24879  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  26.14 
 
 		 424 aa  45.8  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42688  predicted protein  28.75 
 
 		 700 aa  46.2  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_2458  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  21.25 
 
 		 377 aa  45.4  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0995914 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10285  pentatricopeptide repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_5G10660)  25 
 
 		 1272 aa  44.3  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30981  predicted protein  24.32 
 
 		 439 aa  44.3  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>