20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_10285 on replicon BN001307
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001307  ANIA_10285  pentatricopeptide repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_5G10660)  100 
 
 
1272 aa  2635    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01190  conserved hypothetical protein  33.84 
 
 
1464 aa  253  1e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_2458  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  24.74 
 
 
377 aa  77.4  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0995914 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29142  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  28.1 
 
 
632 aa  71.2  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00572015  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29618  predicted protein  27.17 
 
 
744 aa  65.5  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32043  predicted protein  26.12 
 
 
889 aa  63.2  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485159  normal  0.0952764 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25918  predicted protein  26.11 
 
 
739 aa  61.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.304205  normal  0.0200478 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_25441  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  26.11 
 
 
739 aa  61.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.224466  normal  0.223836 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31572  predicted protein  22.67 
 
 
536 aa  53.9  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.314666  normal  0.270485 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34060  predicted protein  21.91 
 
 
576 aa  53.1  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2266  pentapeptide repeat-containing protein  26.02 
 
 
1225 aa  53.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468941  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14352  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  22.19 
 
 
444 aa  50.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.373458  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_89032  predicted protein  22.64 
 
 
683 aa  48.9  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.356102  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19174  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  22.64 
 
 
629 aa  48.9  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0365143 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45520  predicted protein  24.79 
 
 
860 aa  46.6  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.995437  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30981  predicted protein  23.14 
 
 
439 aa  46.6  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116585  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01800  conserved hypothetical protein  22.7 
 
 
551 aa  45.8  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42688  predicted protein  20.37 
 
 
700 aa  45.4  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02170  expressed protein  37.5 
 
 
787 aa  45.4  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853246  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33231  predicted protein  24.39 
 
 
918 aa  45.1  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>