35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45879 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_45879  predicted protein  100 
 
 		 1040 aa  2169    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47331  predicted protein  23.97 
 
 		 879 aa  167  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.217105  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49009  predicted protein  24.19 
 
 		 1039 aa  164  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34060  predicted protein  26.11 
 
 		 576 aa  129  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43695  predicted protein  22.57 
 
 		 1060 aa  124  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.044454  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50515  predicted protein  24.07 
 
 		 1010 aa  121  7e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49258  predicted protein  22.94 
 
 		 1167 aa  120  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43645  predicted protein  24.01 
 
 		 862 aa  108  5e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0711576  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43471  predicted protein  22.54 
 
 		 785 aa  103  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49851  predicted protein  26.58 
 
 		 703 aa  100  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.165107  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50061  predicted protein  22.2 
 
 		 886 aa  85.1  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.29853  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33231  predicted protein  28.67 
 
 		 918 aa  84.3  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45520  predicted protein  21.5 
 
 		 860 aa  84  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.995437  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45149  predicted protein  31.75 
 
 		 537 aa  84  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50002  predicted protein  21.48 
 
 		 1122 aa  78.2  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.736142  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47702  predicted protein  25.31 
 
 		 994 aa  75.5  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45435  predicted protein  22.19 
 
 		 784 aa  74.3  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.347089  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43112  predicted protein  19.57 
 
 		 708 aa  71.6  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54064  predicted protein  22.89 
 
 		 447 aa  70.9  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530235  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49642  predicted protein  23.57 
 
 		 705 aa  70.5  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47265  predicted protein  25.44 
 
 		 709 aa  70.1  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.285264  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47986  predicted protein  22.39 
 
 		 712 aa  67  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34138  predicted protein  30.9 
 
 		 647 aa  62  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29142  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  24.37 
 
 		 632 aa  59.7  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00572015  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45345  predicted protein  21.93 
 
 		 575 aa  57.4  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.824285  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41008  predicted protein  23.99 
 
 		 823 aa  57.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44671  predicted protein  22.93 
 
 		 428 aa  52.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.364916  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29618  predicted protein  23.79 
 
 		 744 aa  52  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19174  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  27.13 
 
 		 629 aa  50.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0365143 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_89032  predicted protein  27.13 
 
 		 683 aa  50.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.356102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45711  predicted protein  19.14 
 
 		 775 aa  49.3  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00177654  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43575  predicted protein  20.38 
 
 		 737 aa  47  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.835069  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14352  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  23.27 
 
 		 444 aa  45.8  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.373458  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48215  predicted protein  23.64 
 
 		 879 aa  45.4  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04706  putative PPR repeats containing protein  24.44 
 
 		 1373 aa  44.7  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.380322 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>