34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45345 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_45345  predicted protein  100 
 
 
575 aa  1205    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.824285  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34060  predicted protein  24.1 
 
 
576 aa  136  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47331  predicted protein  23.99 
 
 
879 aa  132  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.217105  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49258  predicted protein  23.47 
 
 
1167 aa  130  6e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43695  predicted protein  22.99 
 
 
1060 aa  109  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.044454  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43471  predicted protein  22.12 
 
 
785 aa  107  5e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45435  predicted protein  25.34 
 
 
784 aa  97.1  7e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.347089  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49642  predicted protein  21.45 
 
 
705 aa  94.4  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54064  predicted protein  24.64 
 
 
447 aa  88.2  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530235  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47265  predicted protein  21.91 
 
 
709 aa  86.7  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.285264  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45149  predicted protein  24.42 
 
 
537 aa  81.6  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49009  predicted protein  23.22 
 
 
1039 aa  76.3  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50515  predicted protein  24.6 
 
 
1010 aa  73.9  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44671  predicted protein  27.49 
 
 
428 aa  71.6  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.364916  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47702  predicted protein  20.6 
 
 
994 aa  69.3  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43575  predicted protein  21.53 
 
 
737 aa  66.2  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.835069  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33231  predicted protein  23.11 
 
 
918 aa  65.5  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34138  predicted protein  22.79 
 
 
647 aa  64.3  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47986  predicted protein  21.55 
 
 
712 aa  61.2  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29618  predicted protein  25 
 
 
744 aa  57.8  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45879  predicted protein  21.93 
 
 
1040 aa  57  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50061  predicted protein  21.2 
 
 
886 aa  55.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.29853  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43645  predicted protein  18.73 
 
 
862 aa  55.1  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0711576  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_2458  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  21.27 
 
 
377 aa  54.7  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0995914 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45711  predicted protein  23.2 
 
 
775 aa  53.9  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00177654  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31572  predicted protein  28.46 
 
 
536 aa  54.3  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.314666  normal  0.270485 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49851  predicted protein  24.14 
 
 
703 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.165107  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45520  predicted protein  21.98 
 
 
860 aa  52  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.995437  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_89032  predicted protein  30.3 
 
 
683 aa  49.7  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.356102  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19174  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  28.79 
 
 
629 aa  49.7  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0365143 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29142  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  26.73 
 
 
632 aa  45.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00572015  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42688  predicted protein  25 
 
 
700 aa  44.3  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32043  predicted protein  24.53 
 
 
889 aa  43.9  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485159  normal  0.0952764 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50002  predicted protein  20.59 
 
 
1122 aa  43.9  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.736142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>