12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_25292 on replicon NC_009366
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009366  OSTLU_25292  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  100 
 
 
775 aa  1587    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.025628 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29618  predicted protein  26.63 
 
 
744 aa  57.8  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_2458  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  23.24 
 
 
377 aa  51.6  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0995914 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29142  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  24.52 
 
 
632 aa  50.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00572015  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29163  predicted protein  21.86 
 
 
505 aa  50.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0206016  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43446  predicted protein  40 
 
 
747 aa  47.8  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30981  predicted protein  24.42 
 
 
439 aa  47.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116585  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36970  predicted protein  28.3 
 
 
414 aa  46.6  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05560  conserved hypothetical protein  23.42 
 
 
1317 aa  45.4  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104177  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14352  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  22.09 
 
 
444 aa  45.1  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.373458  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1007  excinuclease ABC, A subunit  25.37 
 
 
958 aa  45.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32043  predicted protein  26.95 
 
 
889 aa  44.3  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485159  normal  0.0952764 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>