297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44889 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_44889  predicted protein  100 
 
 
892 aa  1833    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.423509  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50516  predicted protein  36.91 
 
 
806 aa  361  4e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44149  predicted protein  36.49 
 
 
459 aa  282  2e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104122  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  26.37 
 
 
399 aa  99  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  25.2 
 
 
423 aa  95.9  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  23.56 
 
 
396 aa  94.7  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  22.7 
 
 
412 aa  93.6  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  23.8 
 
 
399 aa  92.4  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  26.57 
 
 
385 aa  91.7  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  24.87 
 
 
375 aa  85.1  0.000000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  25.89 
 
 
397 aa  85.1  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  25.07 
 
 
386 aa  83.2  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  22.84 
 
 
398 aa  81.6  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0868  hypothetical protein  23.96 
 
 
479 aa  81.3  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  25.58 
 
 
400 aa  80.5  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0839  hypothetical protein  23.67 
 
 
479 aa  79.7  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  25.19 
 
 
399 aa  79.7  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  23.51 
 
 
387 aa  79  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  21.89 
 
 
395 aa  79.3  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A26  Kef-type K+ transport systems, membrane component  28.89 
 
 
320 aa  79.3  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  23.65 
 
 
387 aa  78.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  23.65 
 
 
387 aa  78.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  22.47 
 
 
379 aa  78.6  0.0000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  23.17 
 
 
749 aa  78.6  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  24.3 
 
 
445 aa  77  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  23.51 
 
 
387 aa  77  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  23.51 
 
 
387 aa  76.3  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  23.51 
 
 
387 aa  76.3  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  23.51 
 
 
387 aa  76.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  23.27 
 
 
387 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  23.51 
 
 
387 aa  75.9  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  25.86 
 
 
404 aa  74.3  0.000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  23.27 
 
 
387 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  24.02 
 
 
352 aa  74.3  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2667  sodium/hydrogen exchanger  23.14 
 
 
767 aa  73.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6352  sodium/hydrogen exchanger  25.31 
 
 
436 aa  72.8  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105497 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  23.16 
 
 
474 aa  73.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1412  sodium/hydrogen exchanger  24.48 
 
 
395 aa  72.8  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.179509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  22.67 
 
 
460 aa  69.3  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  28 
 
 
388 aa  68.6  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  23.31 
 
 
382 aa  68.2  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01670  potassium:hydrogen antiporter, putative  20.46 
 
 
951 aa  67.8  0.0000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3964  sodium/hydrogen exchanger  22.68 
 
 
402 aa  67.4  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0770173  normal  0.0859803 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25931  putative Na+/H+ antiporter, CPA2 family  26.24 
 
 
457 aa  67.4  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  21.24 
 
 
385 aa  67  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  21.19 
 
 
389 aa  67  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  22 
 
 
416 aa  67.4  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0711  sodium/hydrogen exchanger  22.75 
 
 
581 aa  67.4  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1081  sodium/hydrogen exchanger  23.16 
 
 
386 aa  67.4  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  23.13 
 
 
389 aa  66.2  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3668  Sodium/hydrogen exchanger  32.28 
 
 
415 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  27.6 
 
 
469 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0988  sodium/hydrogen exchanger  24.54 
 
 
676 aa  66.6  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4159  sodium/hydrogen exchanger  23.39 
 
 
446 aa  65.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0754  sodium/hydrogen exchanger  24.35 
 
 
598 aa  65.9  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835162  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  22.51 
 
 
684 aa  65.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0433  sodium/hydrogen exchanger  22.89 
 
 
387 aa  65.5  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.129504  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  26.92 
 
 
388 aa  65.5  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00390  sodium-hydrogen antiporter  30.86 
 
 
533 aa  65.1  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  28 
 
 
388 aa  65.1  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  27.78 
 
 
388 aa  65.1  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  21.99 
 
 
650 aa  65.1  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  20.57 
 
 
748 aa  64.7  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  22.87 
 
 
715 aa  64.7  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  28.07 
 
 
750 aa  64.7  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  22.55 
 
 
764 aa  64.3  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  24.28 
 
 
567 aa  63.5  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0261  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.34 
 
 
588 aa  63.5  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1464  Sodium/hydrogen exchanger  25.21 
 
 
485 aa  63.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000329156  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  21.12 
 
 
390 aa  63.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  23.32 
 
 
567 aa  62.4  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1107  sodium/hydrogen exchanger  21.92 
 
 
775 aa  62  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112633  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0454  Na+/H+ antiporter  22.79 
 
 
701 aa  62  0.00000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.809076  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  23.5 
 
 
375 aa  62  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3029  Sodium/hydrogen exchanger  35.65 
 
 
453 aa  62  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75325  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2594  sodium/hydrogen exchanger  21.33 
 
 
491 aa  62.4  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0543  sodium/hydrogen exchanger  22.43 
 
 
631 aa  62.4  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.015433 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17921  CPA2 family Na+/H+ antiporter  24.4 
 
 
455 aa  62  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  24.65 
 
 
636 aa  62  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.8 
 
 
567 aa  61.6  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0258  sodium/hydrogen exchanger  23.61 
 
 
573 aa  61.6  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1692  CPA2 family Na+/H+ antiporter  24.4 
 
 
455 aa  61.6  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18091  CPA2 family Na+/H+ antiporter  24.4 
 
 
455 aa  61.6  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.85 
 
 
418 aa  61.2  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3175  putative cation:proton antiport protein  23.4 
 
 
563 aa  61.2  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.47283  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2667  sodium/hydrogen exchanger  30.23 
 
 
435 aa  60.8  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  24.94 
 
 
773 aa  60.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  23.23 
 
 
720 aa  60.5  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3809  sodium/hydrogen exchanger  24.56 
 
 
413 aa  60.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  22.52 
 
 
414 aa  60.8  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17871  CPA2 family Na+/H+ antiporter  24.4 
 
 
455 aa  60.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.95 
 
 
587 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.37 
 
 
587 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2295  sodium/hydrogen exchanger  31.06 
 
 
386 aa  59.7  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.784703 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  23.04 
 
 
482 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0183  CPA2 family Na+/H+ antiporter  24.09 
 
 
458 aa  60.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3726  sodium/hydrogen exchanger  31.82 
 
 
413 aa  60.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2263  sodium/hydrogen exchanger  21.99 
 
 
544 aa  59.7  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4724  sodium/hydrogen exchanger  23.73 
 
 
473 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0547  Kef-type K+ transport systems, membrane component  22.47 
 
 
318 aa  59.7  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.013509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>