More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2263 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1761  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  68.36 
 
 		 534 aa  755    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.286891  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2263  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 544 aa  1074    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2626  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  74.81 
 
 		 532 aa  756    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.279281  normal  0.575429 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2079  Sodium/hydrogen exchanger  47.46 
 
 		 539 aa  480  1e-134  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1861  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.75 
 
 		 540 aa  357  3.9999999999999996e-97  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0767  sodium/hydrogen exchanger family protein  37.11 
 
 		 539 aa  353  4e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000529307  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1067  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  35.73 
 
 		 541 aa  343  4e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000268693  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1380  sodium/hydrogen exchanger  36.51 
 
 		 540 aa  339  9.999999999999999e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.034971  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1366  sodium/hydrogen exchanger family protein  36.73 
 
 		 541 aa  337  1.9999999999999998e-91  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.504538  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1245  sodium/hydrogen exchanger family protein  36.73 
 
 		 541 aa  337  1.9999999999999998e-91  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00591583  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0494  sodium/hydrogen exchanger family protein  36.55 
 
 		 541 aa  333  5e-90  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.127513  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0776  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.15 
 
 		 541 aa  321  1.9999999999999998e-86  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0974  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.93 
 
 		 543 aa  315  1.9999999999999998e-84  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.705651  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1569  sodium/hydrogen exchanger  31.17 
 
 		 616 aa  303  7.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  31.91 
 
 		 662 aa  258  3e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  31.18 
 
 		 649 aa  252  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  30.98 
 
 		 649 aa  251  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  31.67 
 
 		 661 aa  246  8e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000235169 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  31.67 
 
 		 661 aa  246  8e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  30.97 
 
 		 720 aa  243  7e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  32.27 
 
 		 654 aa  242  1e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  31.03 
 
 		 648 aa  242  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  31.03 
 
 		 648 aa  240  4e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  31.03 
 
 		 648 aa  240  4e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  29.89 
 
 		 650 aa  240  4e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  30.84 
 
 		 649 aa  238  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  29.74 
 
 		 649 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  30.65 
 
 		 648 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  30.64 
 
 		 648 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  30.65 
 
 		 648 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  30.65 
 
 		 648 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  31.07 
 
 		 653 aa  231  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  28.63 
 
 		 652 aa  231  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  28.99 
 
 		 663 aa  229  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  30.65 
 
 		 648 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  29.5 
 
 		 668 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  30.25 
 
 		 667 aa  227  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5097  sodium/hydrogen exchanger  29.31 
 
 		 630 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4634  sodium/hydrogen exchanger  29.5 
 
 		 630 aa  226  7e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136405 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.8 
 
 		 669 aa  226  8e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  29.87 
 
 		 659 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.8 
 
 		 669 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.8 
 
 		 669 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  29.61 
 
 		 667 aa  225  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  28.8 
 
 		 669 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  28.88 
 
 		 663 aa  225  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.8 
 
 		 669 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.8 
 
 		 669 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  29.73 
 
 		 666 aa  225  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  29.7 
 
 		 678 aa  224  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2796  sodium/hydrogen exchanger  29.17 
 
 		 668 aa  224  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0879164 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  29.42 
 
 		 661 aa  224  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2171  sodium/hydrogen exchanger  29.17 
 
 		 668 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  29.17 
 
 		 668 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0802  sodium/hydrogen exchanger  29.55 
 
 		 583 aa  223  8e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1593  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  30.8 
 
 		 655 aa  222  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1249  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  30.8 
 
 		 572 aa  221  1.9999999999999999e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1943  sodium/hydrogen exchanger  28.97 
 
 		 629 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409828  normal  0.0242024 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  28.22 
 
 		 657 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  29.66 
 
 		 674 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  30.13 
 
 		 658 aa  220  5e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  28.05 
 
 		 671 aa  219  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  28.82 
 
 		 636 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1457  K+ efflux antiporter, putative (KEA1)  31.5 
 
 		 583 aa  217  4e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2703  sodium/hydrogen exchanger  29.9 
 
 		 670 aa  217  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  27.39 
 
 		 670 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  28.02 
 
 		 741 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4238  sodium/hydrogen exchanger  29.85 
 
 		 656 aa  216  7e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0904  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  30.75 
 
 		 608 aa  215  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1866  hypothetical protein  29.16 
 
 		 601 aa  214  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3734  sodium/hydrogen exchanger  31.76 
 
 		 591 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0146  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  31.87 
 
 		 568 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1861  hypothetical protein  29.24 
 
 		 601 aa  214  3.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3810  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.15 
 
 		 680 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.162531 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2845  sodium/hydrogen exchanger  29.7 
 
 		 670 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0613147  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0095  TrkA-N  31.95 
 
 		 569 aa  213  7e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  30.1 
 
 		 674 aa  213  7.999999999999999e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4163  potassium efflux system protein  27.91 
 
 		 597 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2361  potassium efflux system protein  29.33 
 
 		 618 aa  212  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00662139  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1735  sodium/hydrogen exchanger  31.31 
 
 		 593 aa  212  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5173  sodium/hydrogen exchanger  28.26 
 
 		 632 aa  211  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  29.69 
 
 		 648 aa  211  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05273  hypothetical protein  29.9 
 
 		 652 aa  210  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0528  potassium efflux system protein  28.71 
 
 		 604 aa  210  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.408395 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11843  predicted protein  28.69 
 
 		 533 aa  209  1e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4668  sodium/hydrogen exchanger  29.77 
 
 		 594 aa  208  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0852287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2945  potassium efflux system protein  28.48 
 
 		 589 aa  208  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2769  potassium efflux system protein  28.28 
 
 		 589 aa  208  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000462118  normal  0.230816 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1481  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  28.48 
 
 		 589 aa  207  4e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1761  potassium efflux system protein  28.38 
 
 		 616 aa  207  4e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00639423 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0406  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  28.82 
 
 		 638 aa  207  5e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0122767  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2847  potassium efflux system protein  28.28 
 
 		 589 aa  206  7e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.128131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1980  sodium/hydrogen exchanger  26.08 
 
 		 603 aa  206  8e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.846503  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4900  potassium efflux system protein  28.97 
 
 		 664 aa  206  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0301  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  27.92 
 
 		 604 aa  205  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.768293  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3407  potassium efflux system protein  27.97 
 
 		 624 aa  204  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0907  sodium/hydrogen exchanger  28.42 
 
 		 563 aa  204  3e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2011  potassium efflux system protein  27.04 
 
 		 628 aa  204  3e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.425988  normal  0.0999325 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3068  potassium efflux system protein  29.32 
 
 		 631 aa  204  5e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4171  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  29.02 
 
 		 613 aa  203  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>