More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1569 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1569  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
616 aa  1233    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227711  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1380  sodium/hydrogen exchanger  40.54 
 
 
540 aa  387  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.034971  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1861  sodium/hydrogen exchanger family protein  38.02 
 
 
540 aa  378  1e-103  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1366  sodium/hydrogen exchanger family protein  36.59 
 
 
541 aa  367  1e-100  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.504538  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1245  sodium/hydrogen exchanger family protein  36.59 
 
 
541 aa  367  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00591583  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0494  sodium/hydrogen exchanger family protein  36.59 
 
 
541 aa  361  3e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.127513  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0767  sodium/hydrogen exchanger family protein  36.87 
 
 
539 aa  358  1.9999999999999998e-97  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000529307  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1067  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  37.59 
 
 
541 aa  356  8.999999999999999e-97  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000268693  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2079  Sodium/hydrogen exchanger  35.06 
 
 
539 aa  346  6e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0974  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.8 
 
 
543 aa  341  2.9999999999999998e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.705651  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0776  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.2 
 
 
541 aa  318  1e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2263  sodium/hydrogen exchanger  31.17 
 
 
544 aa  310  4e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1761  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  30.8 
 
 
534 aa  298  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.286891  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2626  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  31.59 
 
 
532 aa  295  2e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.279281  normal  0.575429 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  36.07 
 
 
648 aa  272  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  35.07 
 
 
650 aa  269  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  35.47 
 
 
648 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  35.47 
 
 
648 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  35.87 
 
 
649 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  33.1 
 
 
662 aa  267  5e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  36.33 
 
 
648 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  35.06 
 
 
648 aa  265  3e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  35.06 
 
 
648 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  35.06 
 
 
648 aa  265  3e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  34.4 
 
 
649 aa  264  4e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  35.45 
 
 
663 aa  262  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  33.47 
 
 
660 aa  259  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  34.81 
 
 
663 aa  259  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1593  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  34.68 
 
 
655 aa  258  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  35.19 
 
 
648 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  33.77 
 
 
649 aa  258  3e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  34.78 
 
 
669 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  33.52 
 
 
657 aa  258  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  34.84 
 
 
653 aa  257  4e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  34.78 
 
 
669 aa  257  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  34.78 
 
 
669 aa  257  5e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  34.78 
 
 
669 aa  257  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  34.78 
 
 
669 aa  257  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  34.78 
 
 
669 aa  257  5e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  33.54 
 
 
660 aa  256  7e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  34.43 
 
 
678 aa  254  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  33.95 
 
 
668 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  34.27 
 
 
661 aa  252  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000235169 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  34.27 
 
 
661 aa  252  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2796  sodium/hydrogen exchanger  33.75 
 
 
668 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0879164 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2171  sodium/hydrogen exchanger  33.75 
 
 
668 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  33.75 
 
 
668 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  34.79 
 
 
649 aa  251  4e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  32.92 
 
 
659 aa  250  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  33.04 
 
 
674 aa  250  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  35.03 
 
 
667 aa  250  7e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  34.6 
 
 
667 aa  249  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  35.03 
 
 
666 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  35.28 
 
 
666 aa  247  4e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  35.79 
 
 
648 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2845  sodium/hydrogen exchanger  33.88 
 
 
670 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0613147  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2703  sodium/hydrogen exchanger  33.68 
 
 
670 aa  243  6e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  33.94 
 
 
661 aa  240  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3810  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.87 
 
 
680 aa  238  3e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.162531 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2952  Sodium/hydrogen exchanger, TrkA-N  33.01 
 
 
568 aa  236  7e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4238  sodium/hydrogen exchanger  32.43 
 
 
656 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4900  potassium efflux system protein  32.85 
 
 
664 aa  234  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  33.66 
 
 
720 aa  234  5e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1249  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  31.28 
 
 
572 aa  232  1e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  29.8 
 
 
682 aa  232  1e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  30.51 
 
 
674 aa  231  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3340  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  33.03 
 
 
610 aa  230  6e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  32.04 
 
 
652 aa  230  6e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4133  potassium efflux system protein  33.76 
 
 
661 aa  229  8e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.477795 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0414  putative glutathione-regulated potassium-efflux system K+/H+ antiporter transmembrane protein  34.48 
 
 
659 aa  229  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4109  sodium/hydrogen exchanger  33.2 
 
 
661 aa  228  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324646  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  32.55 
 
 
666 aa  227  4e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.26 
 
 
697 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0095  TrkA-N  31.15 
 
 
569 aa  227  5.0000000000000005e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0146  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  31.54 
 
 
568 aa  227  6e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  30.3 
 
 
654 aa  227  6e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0296  sodium/hydrogen exchanger  34.91 
 
 
659 aa  225  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  33.15 
 
 
658 aa  224  3e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0802  sodium/hydrogen exchanger  32.63 
 
 
583 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0254  sodium/hydrogen exchanger  34.16 
 
 
595 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.711555  normal  0.0321516 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  33.2 
 
 
672 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1457  K+ efflux antiporter, putative (KEA1)  31.2 
 
 
583 aa  222  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  32.53 
 
 
658 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1735  sodium/hydrogen exchanger  34.44 
 
 
593 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  32.06 
 
 
670 aa  221  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5097  sodium/hydrogen exchanger  32.42 
 
 
630 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1943  sodium/hydrogen exchanger  33.11 
 
 
629 aa  220  6e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409828  normal  0.0242024 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4634  sodium/hydrogen exchanger  32.34 
 
 
630 aa  219  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0136405 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3825  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  30.33 
 
 
601 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.450061  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1519  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.65 
 
 
579 aa  218  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.49267  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0269  sodium/hydrogen exchanger  34.91 
 
 
659 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3654  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  30.61 
 
 
601 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0814431  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3762  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  30.61 
 
 
601 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.581986  normal  0.282948 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3734  sodium/hydrogen exchanger  33.78 
 
 
591 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4786  potassium efflux system protein  31.29 
 
 
661 aa  217  4e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0155  sodium/hydrogen exchanger  32.29 
 
 
661 aa  218  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  30.42 
 
 
601 aa  217  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.538189  normal  0.242525 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3653  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  30.42 
 
 
601 aa  216  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155191  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  30.61 
 
 
775 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02890  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  30.96 
 
 
605 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>