110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0468 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0468  mannose-6-phosphate isomerase, class I  100 
 
 		 336 aa  696    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0458  mannose-6-phosphate isomerase, class I  49.54 
 
 		 320 aa  326  4.0000000000000003e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0309  mannose-6-phosphate isomerase, class I  48.93 
 
 		 326 aa  320  3e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0467  mannose-6-phosphate isomerase  48.78 
 
 		 328 aa  309  5e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12883  putative mannose-6-phosphate isomerase  45.22 
 
 		 325 aa  301  1e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0266  mannose-6-phosphate isomerase, class I  45.85 
 
 		 322 aa  298  1e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21530  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.64 
 
 		 353 aa  225  6e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0465  Mannose-6-phosphate isomerase  40.18 
 
 		 365 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.46 
 
 		 349 aa  200  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0511343  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1327  Mannose-6-phosphate isomerase  36.01 
 
 		 319 aa  199  7.999999999999999e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1319  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.89 
 
 		 318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0119683  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1806  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.97 
 
 		 319 aa  195  9e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1245  Mannose-6-phosphate isomerase  38.17 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2149  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.8 
 
 		 329 aa  193  4e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1391  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.74 
 
 		 325 aa  189  5e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1205  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.74 
 
 		 325 aa  189  5e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140202  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2595  Mannose-6-phosphate isomerase  35.62 
 
 		 325 aa  189  8e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1723  Mannose-6-phosphate isomerase  37.54 
 
 		 344 aa  184  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0885  mannose-6-phosphate isomerase  34.85 
 
 		 326 aa  182  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365127  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1263  phosphomannose isomerase  33.65 
 
 		 321 aa  182  9.000000000000001e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000784939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0314  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.68 
 
 		 336 aa  180  2e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000281347  normal  0.468377 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3743  mannose-6-phosphate isomerase  38.29 
 
 		 323 aa  179  7e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.274174  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3116  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.22 
 
 		 363 aa  179  9e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1081  mannose-6-phosphate isomerase  34.93 
 
 		 369 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1171  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.33 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0141  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.26 
 
 		 318 aa  169  5e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2666  mannose-6-phosphate isomerase  32.69 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2722  mannose-6-phosphate isomerase  32.69 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0569  mannose-6-phosphate isomerase  33.13 
 
 		 325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114617 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0819  mannose-6-phosphate isomerase  34.75 
 
 		 315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3802  mannose-6-phosphate isomerase  36.69 
 
 		 353 aa  166  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1752  mannose-6-phosphate isomerase, class I  40.27 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0921565  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3397  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.21 
 
 		 318 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2261  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.56 
 
 		 316 aa  159  6e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0321  mannose-6-phosphate isomerase  40.44 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000805309  hitchhiker  0.00737279 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1688  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.57 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.745586  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.39 
 
 		 312 aa  155  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2217  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.39 
 
 		 312 aa  155  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.735941  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1668  mannose-6-phosphate isomerase type I  34.16 
 
 		 326 aa  152  5.9999999999999996e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0844191  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3377  mannose-6-phosphate isomerase, class I  31.33 
 
 		 310 aa  149  7e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.308254  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3528  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.89 
 
 		 320 aa  149  7e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0249  phosphomannose isomerase  33.55 
 
 		 322 aa  149  8e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.289498  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1708  mannose-6-phosphate isomerase  32.04 
 
 		 315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.657704  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1769  phosphomannose isomerase  40.4 
 
 		 319 aa  142  6e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0475  phosphomannose isomerase type I  37.37 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.282321  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0920  Mannose-6-phosphate isomerase  39.91 
 
 		 321 aa  135  7.000000000000001e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0690486 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1681  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.61 
 
 		 312 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3117  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32 
 
 		 314 aa  130  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0284496  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1575  mannose-6-phosphate isomerase  37.57 
 
 		 195 aa  125  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0191  mannose-6-phosphate isomerase type I  34.39 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0193  mannose-6-phosphate isomerase, type I  34.54 
 
 		 278 aa  123  6e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2255  Mannose-6-phosphate isomerase  34.04 
 
 		 323 aa  116  6e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0223155  hitchhiker  0.00489167 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1059  mannose-6-phosphate isomerase  31.51 
 
 		 315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191159 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0743  putative mannose-6-phosphate isomerase  38.89 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594978  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0924  mannose-6-phosphate isomerase  36.78 
 
 		 307 aa  106  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1592  phosphomannose isomerase-like protein  40.44 
 
 		 268 aa  106  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1783  hypothetical protein  32.56 
 
 		 358 aa  106  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.203269  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1535  mannose-6-phosphate isomerase, type I  34.42 
 
 		 262 aa  103  5e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.480559  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0882  mannose-6-phosphate isomerase type I  32.09 
 
 		 273 aa  102  7e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240719  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0656  phosphomannose isomerase-like protein  26.37 
 
 		 364 aa  102  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.189612  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4499  phosphomannose isomerase-like protein  40.29 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0457  mannose-6-phosphate isomerase type I  28.95 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2595  phosphomannose isomerase-like protein  26.73 
 
 		 355 aa  99.8  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0506616  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28540  phosphomannose isomerase  33.07 
 
 		 349 aa  98.2  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.188562 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6091  hypothetical protein  31.52 
 
 		 339 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4282  hypothetical protein  24.29 
 
 		 598 aa  90.1  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3010  hypothetical protein  28.21 
 
 		 587 aa  85.9  9e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020872  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2266  hypothetical protein  29.02 
 
 		 609 aa  85.5  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3966  PfkB domain protein  30.29 
 
 		 680 aa  82.8  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173743  normal  0.0415319 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1482  Phosphomannose isomerase-like protein  28.67 
 
 		 505 aa  82.4  0.000000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0756  hypothetical protein  26.97 
 
 		 587 aa  80.5  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.31068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2422  mannose-6-phosphate isomerase-like protein  25.55 
 
 		 618 aa  74.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.167496 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3646  phosphomannose isomerase-like  24.86 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0639  mannose-6-phosphate isomerase-like protein  26.75 
 
 		 584 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.459427  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1172  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.67 
 
 		 399 aa  56.2  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0791265  normal  0.965156 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1116  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.33 
 
 		 394 aa  52.8  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0922592 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0860  mannose-6-phosphate isomerase, class I  31 
 
 		 395 aa  50.8  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3511  mannose-6-phosphate isomerase  34.29 
 
 		 369 aa  49.7  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4165  mannose-6-phosphate isomerase, class I  26.78 
 
 		 406 aa  49.7  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.292455  normal  0.858964 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2253  mannose-6-phosphate isomerase, class I  26.04 
 
 		 419 aa  49.7  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0483386  normal  0.187903 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2387  mannose-6-phosphate isomerase, class I  28.23 
 
 		 396 aa  49.7  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.318931  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4035  mannose-6-phosphate isomerase, class I  25.45 
 
 		 408 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0762844  normal  0.148973 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30820  mannose-6-phosphate isomerase, class I  31.75 
 
 		 415 aa  48.9  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2098  mannose-6-phosphate isomerase  32.41 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.302925 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72090  mannose-6-phosphate isomerase  32.53 
 
 		 439 aa  48.1  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.800208 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2543  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.33 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6006  mannose-6-phosphate isomerase class I  28.97 
 
 		 402 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000013531  normal  0.0800927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6324  mannose-6-phosphate isomerase, class I  29.27 
 
 		 407 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.199717  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4202  mannose-6-phosphate isomerase  30.85 
 
 		 412 aa  46.6  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1739  mannose-6-phosphate isomerase, class I  26.39 
 
 		 408 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0016  mannose-6-phosphate isomerase  29.47 
 
 		 423 aa  46.2  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.976239  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4295  mannose-6-phosphate isomerase, class I  29.7 
 
 		 391 aa  46.2  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05183  mannose-6-phosphate isomerase  23.04 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1330  mannose-6-phosphate isomerase  25.12 
 
 		 409 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37283  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1347  mannose-6-phosphate isomerase  25.12 
 
 		 409 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.46629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1366  mannose-6-phosphate isomerase  25.12 
 
 		 409 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.837438 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0965  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.67 
 
 		 387 aa  44.3  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.857697  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1422  mannose-6-phosphate isomerase  24.22 
 
 		 388 aa  44.3  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02540  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.29 
 
 		 400 aa  43.9  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1186  mannose-6-phosphate isomerase  31.25 
 
 		 416 aa  43.9  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.215297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>