104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1391 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1391  mannose-6-phosphate isomerase, class I  100 
 
 		 325 aa  661    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1205  mannose-6-phosphate isomerase, class I  99.38 
 
 		 325 aa  657    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140202  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21530  mannose-6-phosphate isomerase, class I  44.92 
 
 		 353 aa  292  5e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  43.93 
 
 		 349 aa  279  4e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0511343  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1806  mannose-6-phosphate isomerase, class I  42.37 
 
 		 319 aa  248  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1171  mannose-6-phosphate isomerase, class I  42.32 
 
 		 314 aa  238  8e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0458  mannose-6-phosphate isomerase, class I  41.67 
 
 		 320 aa  236  3e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1319  mannose-6-phosphate isomerase, class I  40.18 
 
 		 318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0119683  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3397  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.31 
 
 		 318 aa  226  4e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0819  mannose-6-phosphate isomerase  36.62 
 
 		 315 aa  222  4.9999999999999996e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3528  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.36 
 
 		 320 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1708  mannose-6-phosphate isomerase  37.19 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.657704  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0314  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.24 
 
 		 336 aa  216  2.9999999999999998e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000281347  normal  0.468377 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2666  mannose-6-phosphate isomerase  34.95 
 
 		 312 aa  215  5.9999999999999996e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2722  mannose-6-phosphate isomerase  34.95 
 
 		 312 aa  215  5.9999999999999996e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1688  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.71 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.745586  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1327  Mannose-6-phosphate isomerase  40 
 
 		 319 aa  209  4e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0465  Mannose-6-phosphate isomerase  35.98 
 
 		 365 aa  209  4e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12883  putative mannose-6-phosphate isomerase  36.48 
 
 		 325 aa  209  6e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3116  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.22 
 
 		 363 aa  209  7e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3743  mannose-6-phosphate isomerase  36.53 
 
 		 323 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.274174  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0309  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.87 
 
 		 326 aa  204  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2149  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.44 
 
 		 329 aa  204  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3377  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.34 
 
 		 310 aa  202  6e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.308254  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2595  Mannose-6-phosphate isomerase  35.96 
 
 		 325 aa  200  3e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0266  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.92 
 
 		 322 aa  199  6e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0249  phosphomannose isomerase  33.75 
 
 		 322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.289498  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1081  mannose-6-phosphate isomerase  35.8 
 
 		 369 aa  195  9e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0467  mannose-6-phosphate isomerase  36.2 
 
 		 328 aa  193  3e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2261  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.8 
 
 		 316 aa  192  8e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1752  mannose-6-phosphate isomerase, class I  31.21 
 
 		 312 aa  191  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0921565  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0468  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.74 
 
 		 336 aa  189  5e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1263  phosphomannose isomerase  33.75 
 
 		 321 aa  189  5e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000784939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0885  mannose-6-phosphate isomerase  34.45 
 
 		 326 aa  188  9e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365127  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1769  phosphomannose isomerase  33.86 
 
 		 319 aa  183  3e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3802  mannose-6-phosphate isomerase  33.83 
 
 		 353 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1245  Mannose-6-phosphate isomerase  34.17 
 
 		 306 aa  175  9.999999999999999e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0321  mannose-6-phosphate isomerase  32.7 
 
 		 316 aa  173  3.9999999999999995e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000805309  hitchhiker  0.00737279 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1723  Mannose-6-phosphate isomerase  32.42 
 
 		 344 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.89 
 
 		 312 aa  169  6e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2217  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.89 
 
 		 312 aa  169  6e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.735941  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0920  Mannose-6-phosphate isomerase  34.18 
 
 		 321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0690486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0569  mannose-6-phosphate isomerase  31.8 
 
 		 325 aa  164  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114617 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0141  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.49 
 
 		 318 aa  163  3e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1668  mannose-6-phosphate isomerase type I  37.02 
 
 		 326 aa  160  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0844191  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3117  mannose-6-phosphate isomerase, class I  31.43 
 
 		 314 aa  160  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0284496  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1575  mannose-6-phosphate isomerase  42.62 
 
 		 195 aa  155  7e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0475  phosphomannose isomerase type I  31.06 
 
 		 309 aa  154  1e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.282321  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1681  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.67 
 
 		 312 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0193  mannose-6-phosphate isomerase, type I  39.56 
 
 		 278 aa  139  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0191  mannose-6-phosphate isomerase type I  37.14 
 
 		 278 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2595  phosphomannose isomerase-like protein  26.54 
 
 		 355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0506616  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1783  hypothetical protein  26.69 
 
 		 358 aa  127  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.203269  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2255  Mannose-6-phosphate isomerase  30.94 
 
 		 323 aa  127  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0223155  hitchhiker  0.00489167 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1535  mannose-6-phosphate isomerase, type I  36.36 
 
 		 262 aa  122  6e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.480559  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1059  mannose-6-phosphate isomerase  31.9 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191159 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0882  mannose-6-phosphate isomerase type I  32.77 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240719  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0924  mannose-6-phosphate isomerase  30.39 
 
 		 307 aa  103  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0457  mannose-6-phosphate isomerase type I  27.87 
 
 		 271 aa  103  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0743  putative mannose-6-phosphate isomerase  42.96 
 
 		 267 aa  99.4  8e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594978  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4499  phosphomannose isomerase-like protein  28.57 
 
 		 294 aa  96.3  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1592  phosphomannose isomerase-like protein  37.21 
 
 		 268 aa  95.5  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28540  phosphomannose isomerase  26.43 
 
 		 349 aa  94  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.188562 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3966  PfkB domain protein  25.39 
 
 		 680 aa  89  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173743  normal  0.0415319 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6091  hypothetical protein  27.31 
 
 		 339 aa  86.7  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0656  phosphomannose isomerase-like protein  29.63 
 
 		 364 aa  82.8  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.189612  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1482  Phosphomannose isomerase-like protein  25.7 
 
 		 505 aa  77.8  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4282  hypothetical protein  24.47 
 
 		 598 aa  68.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2422  mannose-6-phosphate isomerase-like protein  23.27 
 
 		 618 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.167496 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3646  phosphomannose isomerase-like  23.17 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1993  mannose-6-phosphate isomerase, class I  25.51 
 
 		 421 aa  63.2  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1172  mannose-6-phosphate isomerase, class I  23.95 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0791265  normal  0.965156 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30820  mannose-6-phosphate isomerase, class I  22.22 
 
 		 415 aa  56.2  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2277  mannose-6-phosphate isomerase, class I  25.16 
 
 		 392 aa  54.7  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.106024 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02540  mannose-6-phosphate isomerase, class I  23.35 
 
 		 400 aa  55.1  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3010  hypothetical protein  24.32 
 
 		 587 aa  53.5  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020872  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2387  mannose-6-phosphate isomerase, class I  25.45 
 
 		 396 aa  53.5  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.318931  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000088  mannose-6-phosphate isomerase  25.62 
 
 		 411 aa  51.2  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1874  mannose-6-phosphate isomerase, class I  26.53 
 
 		 391 aa  50.4  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0430449  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2269  mannose-6-phosphate isomerase  26.53 
 
 		 391 aa  50.4  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2266  hypothetical protein  25.32 
 
 		 609 aa  50.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2015  mannose-6-phosphate isomerase, class I  25.77 
 
 		 401 aa  49.7  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000590051  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0860  mannose-6-phosphate isomerase, class I  22.5 
 
 		 395 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6324  mannose-6-phosphate isomerase, class I  25.66 
 
 		 407 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.199717  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1116  mannose-6-phosphate isomerase, class I  21.95 
 
 		 394 aa  46.6  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0922592 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2039  mannose-6-phosphate isomerase, class I  21.66 
 
 		 390 aa  46.2  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1830  mannose-6-phosphate isomerase  22.93 
 
 		 391 aa  43.9  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00725153 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1635  mannose-6-phosphate isomerase, class I  25.79 
 
 		 391 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1876  mannose-6-phosphate isomerase, class I  25.79 
 
 		 391 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01582  mannose-6-phosphate isomerase  22.64 
 
 		 391 aa  43.5  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2030  mannose-6-phosphate isomerase, class I  22.64 
 
 		 391 aa  43.5  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0478981  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1688  mannose-6-phosphate isomerase  22.64 
 
 		 391 aa  43.5  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2017  mannose-6-phosphate isomerase, class I  22.64 
 
 		 391 aa  43.5  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1586  mannose-6-phosphate isomerase, class I  22.64 
 
 		 391 aa  43.5  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.762503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1799  mannose-6-phosphate isomerase, class I  22.64 
 
 		 391 aa  43.5  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01572  hypothetical protein  22.64 
 
 		 391 aa  43.5  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30990  mannose-6-phosphate isomerase  26.67 
 
 		 411 aa  43.5  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1821  mannose-6-phosphate isomerase  22.64 
 
 		 391 aa  43.1  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.280304  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2323  mannose-6-phosphate isomerase, class I  22.64 
 
 		 391 aa  43.1  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.734399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1707  mannose-6-phosphate isomerase, class I  21.43 
 
 		 391 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.104692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>