66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2266 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2266  hypothetical protein  100 
 
 
609 aa  1238    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4282  hypothetical protein  55.57 
 
 
598 aa  626  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3010  hypothetical protein  50.34 
 
 
587 aa  611  9.999999999999999e-175  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020872  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0639  mannose-6-phosphate isomerase-like protein  53.21 
 
 
584 aa  601  1e-170  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.459427  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0756  hypothetical protein  49.64 
 
 
587 aa  524  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.31068  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2422  mannose-6-phosphate isomerase-like protein  38.43 
 
 
618 aa  325  1e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.167496 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21530  mannose-6-phosphate isomerase, class I  29.17 
 
 
353 aa  97.8  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0266  mannose-6-phosphate isomerase, class I  28.27 
 
 
322 aa  93.6  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0468  mannose-6-phosphate isomerase, class I  29.02 
 
 
336 aa  85.5  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1245  Mannose-6-phosphate isomerase  31.33 
 
 
306 aa  85.5  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2595  Mannose-6-phosphate isomerase  25.83 
 
 
325 aa  84.3  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1081  mannose-6-phosphate isomerase  27.92 
 
 
369 aa  82  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3802  mannose-6-phosphate isomerase  29.13 
 
 
353 aa  82  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12883  putative mannose-6-phosphate isomerase  26.25 
 
 
325 aa  81.6  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0467  mannose-6-phosphate isomerase  31.3 
 
 
328 aa  79.3  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1806  mannose-6-phosphate isomerase, class I  26.1 
 
 
319 aa  79.3  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2149  mannose-6-phosphate isomerase, class I  28.82 
 
 
329 aa  77.8  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0458  mannose-6-phosphate isomerase, class I  28.52 
 
 
320 aa  77  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  25.83 
 
 
349 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0511343  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1327  Mannose-6-phosphate isomerase  24.47 
 
 
319 aa  76.3  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1723  Mannose-6-phosphate isomerase  28.57 
 
 
344 aa  75.1  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1668  mannose-6-phosphate isomerase type I  30.77 
 
 
326 aa  75.1  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0844191  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0314  mannose-6-phosphate isomerase, class I  23.15 
 
 
336 aa  74.7  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000281347  normal  0.468377 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  24.26 
 
 
312 aa  74.7  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2217  mannose-6-phosphate isomerase, class I  24.26 
 
 
312 aa  74.7  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.735941  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0465  Mannose-6-phosphate isomerase  28.48 
 
 
365 aa  73.6  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3397  mannose-6-phosphate isomerase, class I  24.11 
 
 
318 aa  69.7  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3743  mannose-6-phosphate isomerase  29 
 
 
323 aa  70.1  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.274174  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3116  mannose-6-phosphate isomerase, class I  22.71 
 
 
363 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3528  mannose-6-phosphate isomerase, class I  25.11 
 
 
320 aa  67.8  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1263  phosphomannose isomerase  26.81 
 
 
321 aa  67  0.0000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000784939  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2261  mannose-6-phosphate isomerase, class I  25.69 
 
 
316 aa  66.2  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1319  mannose-6-phosphate isomerase, class I  22.03 
 
 
318 aa  66.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0119683  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1171  mannose-6-phosphate isomerase, class I  22.02 
 
 
314 aa  64.3  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0141  mannose-6-phosphate isomerase, class I  26.36 
 
 
318 aa  64.3  0.000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1752  mannose-6-phosphate isomerase, class I  24.78 
 
 
312 aa  63.9  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0921565  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3117  mannose-6-phosphate isomerase, class I  24.89 
 
 
314 aa  63.9  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0284496  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3377  mannose-6-phosphate isomerase, class I  24.78 
 
 
310 aa  63.5  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.308254  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0321  mannose-6-phosphate isomerase  27.16 
 
 
316 aa  63.2  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000805309  hitchhiker  0.00737279 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0885  mannose-6-phosphate isomerase  28.05 
 
 
326 aa  62.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365127  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0309  mannose-6-phosphate isomerase, class I  27.47 
 
 
326 aa  62.4  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2666  mannose-6-phosphate isomerase  25.45 
 
 
312 aa  62.4  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2722  mannose-6-phosphate isomerase  25.45 
 
 
312 aa  62.4  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1681  mannose-6-phosphate isomerase, class I  31.41 
 
 
312 aa  61.2  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0882  mannose-6-phosphate isomerase type I  25.22 
 
 
273 aa  60.1  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240719  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1769  phosphomannose isomerase  30.88 
 
 
319 aa  58.5  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0249  phosphomannose isomerase  24.78 
 
 
322 aa  57.8  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.289498  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0569  mannose-6-phosphate isomerase  27.48 
 
 
325 aa  57.8  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.114617 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0920  Mannose-6-phosphate isomerase  30.14 
 
 
321 aa  57.4  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0690486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1783  hypothetical protein  27.49 
 
 
358 aa  57.4  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.203269  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1535  mannose-6-phosphate isomerase, type I  24.67 
 
 
262 aa  57  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.480559  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0457  mannose-6-phosphate isomerase type I  22.65 
 
 
271 aa  56.2  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0924  mannose-6-phosphate isomerase  29.92 
 
 
307 aa  54.3  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1708  mannose-6-phosphate isomerase  28.77 
 
 
315 aa  53.9  0.000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.657704  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1059  mannose-6-phosphate isomerase  30.06 
 
 
315 aa  52.8  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191159 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0743  putative mannose-6-phosphate isomerase  32.06 
 
 
267 aa  52  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594978  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1205  mannose-6-phosphate isomerase, class I  25.32 
 
 
325 aa  50.8  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140202  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1592  phosphomannose isomerase-like protein  31.97 
 
 
268 aa  50.8  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1391  mannose-6-phosphate isomerase, class I  25.32 
 
 
325 aa  50.8  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28540  phosphomannose isomerase  25.25 
 
 
349 aa  48.9  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.188562 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2255  Mannose-6-phosphate isomerase  28.18 
 
 
323 aa  48.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0223155  hitchhiker  0.00489167 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1688  mannose-6-phosphate isomerase, class I  25.34 
 
 
315 aa  47.8  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.745586  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0819  mannose-6-phosphate isomerase  23.14 
 
 
315 aa  47.8  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2595  phosphomannose isomerase-like protein  27.14 
 
 
355 aa  47.4  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0506616  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4499  phosphomannose isomerase-like protein  29.29 
 
 
294 aa  47.4  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0656  phosphomannose isomerase-like protein  25.69 
 
 
364 aa  47  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.189612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>