89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1688 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1688  mannose-6-phosphate isomerase, class I  100 
 
 
315 aa  650    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.745586  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1708  mannose-6-phosphate isomerase  69.68 
 
 
315 aa  468  1.0000000000000001e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.657704  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0819  mannose-6-phosphate isomerase  64.87 
 
 
315 aa  418  1e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3397  mannose-6-phosphate isomerase, class I  55.95 
 
 
318 aa  361  7.0000000000000005e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0249  phosphomannose isomerase  54.86 
 
 
322 aa  353  2e-96  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.289498  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2666  mannose-6-phosphate isomerase  55.34 
 
 
312 aa  338  5e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2722  mannose-6-phosphate isomerase  55.34 
 
 
312 aa  338  5e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3528  mannose-6-phosphate isomerase, class I  52.09 
 
 
320 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1171  mannose-6-phosphate isomerase, class I  53 
 
 
314 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2261  mannose-6-phosphate isomerase, class I  53.05 
 
 
316 aa  333  2e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3377  mannose-6-phosphate isomerase, class I  48.59 
 
 
310 aa  294  2e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.308254  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0314  mannose-6-phosphate isomerase, class I  46.98 
 
 
336 aa  290  2e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000281347  normal  0.468377 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0141  mannose-6-phosphate isomerase, class I  46.95 
 
 
318 aa  288  9e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  44.87 
 
 
312 aa  285  7e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2217  mannose-6-phosphate isomerase, class I  44.87 
 
 
312 aa  285  7e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.735941  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1752  mannose-6-phosphate isomerase, class I  43.27 
 
 
312 aa  279  4e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0921565  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1263  phosphomannose isomerase  46.39 
 
 
321 aa  275  8e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000784939  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1769  phosphomannose isomerase  45.69 
 
 
319 aa  254  2.0000000000000002e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1575  mannose-6-phosphate isomerase  61.75 
 
 
195 aa  244  9.999999999999999e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3117  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.69 
 
 
314 aa  240  2e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0284496  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21530  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.44 
 
 
353 aa  222  4.9999999999999996e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0475  phosphomannose isomerase type I  40.62 
 
 
309 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.282321  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1205  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.71 
 
 
325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140202  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1391  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.71 
 
 
325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1806  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.01 
 
 
319 aa  207  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2149  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.42 
 
 
329 aa  205  7e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1319  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.49 
 
 
318 aa  204  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0119683  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1681  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.03 
 
 
312 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1327  Mannose-6-phosphate isomerase  37.42 
 
 
319 aa  187  2e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.01 
 
 
349 aa  181  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0511343  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0458  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.6 
 
 
320 aa  180  2e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1081  mannose-6-phosphate isomerase  36.6 
 
 
369 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0309  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.01 
 
 
326 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12883  putative mannose-6-phosphate isomerase  33.12 
 
 
325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3116  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.54 
 
 
363 aa  172  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0266  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.54 
 
 
322 aa  172  5.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0467  mannose-6-phosphate isomerase  36.51 
 
 
328 aa  172  7.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1723  Mannose-6-phosphate isomerase  34.06 
 
 
344 aa  166  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3743  mannose-6-phosphate isomerase  32.79 
 
 
323 aa  165  9e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.274174  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0465  Mannose-6-phosphate isomerase  35 
 
 
365 aa  164  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1245  Mannose-6-phosphate isomerase  34.55 
 
 
306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2595  Mannose-6-phosphate isomerase  35.5 
 
 
325 aa  161  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0321  mannose-6-phosphate isomerase  41.52 
 
 
316 aa  160  4e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000805309  hitchhiker  0.00737279 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0569  mannose-6-phosphate isomerase  34.18 
 
 
325 aa  160  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.114617 
 
 
-
 
NC_002950  PG0468  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.57 
 
 
336 aa  157  2e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0885  mannose-6-phosphate isomerase  32.92 
 
 
326 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365127  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3802  mannose-6-phosphate isomerase  34.43 
 
 
353 aa  149  7e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0193  mannose-6-phosphate isomerase, type I  38.29 
 
 
278 aa  144  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1668  mannose-6-phosphate isomerase type I  34.6 
 
 
326 aa  139  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0844191  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0191  mannose-6-phosphate isomerase type I  36.49 
 
 
278 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0920  Mannose-6-phosphate isomerase  35 
 
 
321 aa  133  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0690486 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2255  Mannose-6-phosphate isomerase  34.53 
 
 
323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0223155  hitchhiker  0.00489167 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1535  mannose-6-phosphate isomerase, type I  35.24 
 
 
262 aa  124  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.480559  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0882  mannose-6-phosphate isomerase type I  35.15 
 
 
273 aa  120  3.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240719  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1592  phosphomannose isomerase-like protein  32.5 
 
 
268 aa  119  6e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0457  mannose-6-phosphate isomerase type I  34.86 
 
 
271 aa  115  6.9999999999999995e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1059  mannose-6-phosphate isomerase  35.23 
 
 
315 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191159 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4499  phosphomannose isomerase-like protein  33.93 
 
 
294 aa  112  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0743  putative mannose-6-phosphate isomerase  37.07 
 
 
267 aa  112  8.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594978  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2595  phosphomannose isomerase-like protein  26.44 
 
 
355 aa  105  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0506616  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0924  mannose-6-phosphate isomerase  35.84 
 
 
307 aa  105  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1482  Phosphomannose isomerase-like protein  29.43 
 
 
505 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1783  hypothetical protein  33.5 
 
 
358 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.203269  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3646  phosphomannose isomerase-like  29.82 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3966  PfkB domain protein  41.27 
 
 
680 aa  84.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173743  normal  0.0415319 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28540  phosphomannose isomerase  27.35 
 
 
349 aa  83.6  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.188562 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0656  phosphomannose isomerase-like protein  37.3 
 
 
364 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.189612  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6091  hypothetical protein  32.89 
 
 
339 aa  68.9  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4282  hypothetical protein  26.67 
 
 
598 aa  66.6  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1576  hypothetical protein  56 
 
 
59 aa  61.2  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0756  hypothetical protein  26.7 
 
 
587 aa  58.9  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.31068  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0639  mannose-6-phosphate isomerase-like protein  26.01 
 
 
584 aa  56.2  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.459427  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2422  mannose-6-phosphate isomerase-like protein  22.63 
 
 
618 aa  55.8  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.167496 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3010  hypothetical protein  24.19 
 
 
587 aa  55.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020872  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2323  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.19 
 
 
391 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.734399  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1821  mannose-6-phosphate isomerase  35.19 
 
 
391 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.280304  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2030  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.19 
 
 
391 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0478981  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01572  hypothetical protein  35.19 
 
 
391 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01582  mannose-6-phosphate isomerase  35.19 
 
 
391 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00704  phosphomannose isomerase  30.97 
 
 
405 aa  48.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2266  hypothetical protein  25.34 
 
 
609 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1688  mannose-6-phosphate isomerase  34.26 
 
 
391 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1799  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.26 
 
 
391 aa  46.2  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2017  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.26 
 
 
391 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0895  mannose-6-phosphate isomerase  30.91 
 
 
405 aa  46.2  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0693206  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1586  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.33 
 
 
391 aa  45.8  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.762503  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05183  mannose-6-phosphate isomerase  32.77 
 
 
410 aa  43.5  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2647  mannose-6-phosphate isomerase  36.84 
 
 
399 aa  43.1  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000088  mannose-6-phosphate isomerase  31.82 
 
 
411 aa  43.1  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>