91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3802 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3802  mannose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 353 aa  706    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1081  mannose-6-phosphate isomerase  77.27 
 
 		 369 aa  548  1e-155  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1723  Mannose-6-phosphate isomerase  58.36 
 
 		 344 aa  376  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0885  mannose-6-phosphate isomerase  53.68 
 
 		 326 aa  343  2e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365127  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3743  mannose-6-phosphate isomerase  49.85 
 
 		 323 aa  311  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.274174  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0465  Mannose-6-phosphate isomerase  42.6 
 
 		 365 aa  238  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21530  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.65 
 
 		 353 aa  226  4e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0920  Mannose-6-phosphate isomerase  40.06 
 
 		 321 aa  225  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0690486 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2255  Mannose-6-phosphate isomerase  44.1 
 
 		 323 aa  212  5.999999999999999e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0223155  hitchhiker  0.00489167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0309  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.21 
 
 		 326 aa  210  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1319  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.61 
 
 		 318 aa  209  5e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0119683  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0321  mannose-6-phosphate isomerase  41.21 
 
 		 316 aa  193  3e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000805309  hitchhiker  0.00737279 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.24 
 
 		 349 aa  191  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0511343  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1806  mannose-6-phosphate isomerase, class I  31.78 
 
 		 319 aa  191  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1205  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.62 
 
 		 325 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140202  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1391  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.83 
 
 		 325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12883  putative mannose-6-phosphate isomerase  32.8 
 
 		 325 aa  188  1e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2261  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.39 
 
 		 316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0458  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.74 
 
 		 320 aa  182  6e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1263  phosphomannose isomerase  34.94 
 
 		 321 aa  181  2e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000784939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2149  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.01 
 
 		 329 aa  181  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0266  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.44 
 
 		 322 aa  180  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0314  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.53 
 
 		 336 aa  179  7e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000281347  normal  0.468377 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3116  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.17 
 
 		 363 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1752  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.64 
 
 		 312 aa  176  5e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0921565  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0569  mannose-6-phosphate isomerase  36.39 
 
 		 325 aa  176  8e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114617 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0467  mannose-6-phosphate isomerase  36.34 
 
 		 328 aa  175  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0468  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.69 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3397  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.83 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2595  Mannose-6-phosphate isomerase  32.09 
 
 		 325 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.06 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2217  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.06 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.735941  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3528  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.14 
 
 		 320 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0249  phosphomannose isomerase  33.33 
 
 		 322 aa  169  6e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.289498  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1171  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.33 
 
 		 314 aa  169  6e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2722  mannose-6-phosphate isomerase  35.31 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2666  mannose-6-phosphate isomerase  35.31 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0819  mannose-6-phosphate isomerase  34.6 
 
 		 315 aa  166  8e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1688  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.43 
 
 		 315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.745586  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1708  mannose-6-phosphate isomerase  34.75 
 
 		 315 aa  160  3e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.657704  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3377  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.84 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.308254  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1769  phosphomannose isomerase  32.81 
 
 		 319 aa  156  5.0000000000000005e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1327  Mannose-6-phosphate isomerase  29.9 
 
 		 319 aa  152  8.999999999999999e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1668  mannose-6-phosphate isomerase type I  34.94 
 
 		 326 aa  150  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0844191  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3117  mannose-6-phosphate isomerase, class I  40.36 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0284496  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0475  phosphomannose isomerase type I  31.25 
 
 		 309 aa  143  4e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.282321  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2595  phosphomannose isomerase-like protein  34.97 
 
 		 355 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0506616  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0141  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.67 
 
 		 318 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1783  hypothetical protein  32.17 
 
 		 358 aa  129  8.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.203269  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1575  mannose-6-phosphate isomerase  41.24 
 
 		 195 aa  129  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1059  mannose-6-phosphate isomerase  35.88 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191159 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1681  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.99 
 
 		 312 aa  126  5e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0457  mannose-6-phosphate isomerase type I  33.92 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0924  mannose-6-phosphate isomerase  47.02 
 
 		 307 aa  124  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1245  Mannose-6-phosphate isomerase  30.74 
 
 		 306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4499  phosphomannose isomerase-like protein  36.82 
 
 		 294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3966  PfkB domain protein  37.14 
 
 		 680 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173743  normal  0.0415319 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0193  mannose-6-phosphate isomerase, type I  33.47 
 
 		 278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1535  mannose-6-phosphate isomerase, type I  34.26 
 
 		 262 aa  114  3e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.480559  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0191  mannose-6-phosphate isomerase type I  35.94 
 
 		 278 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0743  putative mannose-6-phosphate isomerase  34.73 
 
 		 267 aa  109  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594978  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0882  mannose-6-phosphate isomerase type I  33.94 
 
 		 273 aa  109  7.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240719  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1592  phosphomannose isomerase-like protein  38.25 
 
 		 268 aa  107  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6091  hypothetical protein  33.21 
 
 		 339 aa  100  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2266  hypothetical protein  29.57 
 
 		 609 aa  87.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1482  Phosphomannose isomerase-like protein  28.42 
 
 		 505 aa  86.7  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28540  phosphomannose isomerase  31.34 
 
 		 349 aa  86.7  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.188562 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4282  hypothetical protein  23.84 
 
 		 598 aa  84.3  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3646  phosphomannose isomerase-like  28.72 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0756  hypothetical protein  23.96 
 
 		 587 aa  80.1  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.31068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0656  phosphomannose isomerase-like protein  23.15 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.189612  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0639  mannose-6-phosphate isomerase-like protein  24.27 
 
 		 584 aa  77  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.459427  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3010  hypothetical protein  26.63 
 
 		 587 aa  67.8  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020872  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2422  mannose-6-phosphate isomerase-like protein  22.87 
 
 		 618 aa  60.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.167496 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6324  mannose-6-phosphate isomerase, class I  29.74 
 
 		 407 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.199717  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13284  mannose-6-phosphate isomerase manA  28.9 
 
 		 408 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.34249 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0860  mannose-6-phosphate isomerase, class I  29.65 
 
 		 395 aa  51.2  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4724  mannose-6-phosphate isomerase, class I  26.59 
 
 		 408 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal  0.477393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1739  mannose-6-phosphate isomerase, class I  27.75 
 
 		 408 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0605  mannose-6-phosphate isomerase  31 
 
 		 401 aa  47.8  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02540  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.56 
 
 		 400 aa  47.4  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2253  mannose-6-phosphate isomerase, class I  27.15 
 
 		 419 aa  47  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0483386  normal  0.187903 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4295  mannose-6-phosphate isomerase, class I  23.14 
 
 		 391 aa  46.2  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3870  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.72 
 
 		 402 aa  46.2  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0760248  decreased coverage  0.0014351 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2015  mannose-6-phosphate isomerase, class I  27.53 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000590051  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4165  mannose-6-phosphate isomerase, class I  22.68 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.292455  normal  0.858964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4995  Mannose-6-phosphate isomerase  23.8 
 
 		 396 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.549808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2647  mannose-6-phosphate isomerase  24.86 
 
 		 399 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3605  predicted protein  51.28 
 
 		 407 aa  43.9  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00704  phosphomannose isomerase  29.51 
 
 		 405 aa  43.1  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3511  mannose-6-phosphate isomerase  31.19 
 
 		 369 aa  42.7  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>