60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1482 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1482  Phosphomannose isomerase-like protein  100 
 
 		 505 aa  1028    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12883  putative mannose-6-phosphate isomerase  25.55 
 
 		 325 aa  108  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1688  mannose-6-phosphate isomerase, class I  29.43 
 
 		 315 aa  105  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.745586  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1806  mannose-6-phosphate isomerase, class I  25.58 
 
 		 319 aa  103  8e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21530  mannose-6-phosphate isomerase, class I  23.95 
 
 		 353 aa  99.4  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0465  Mannose-6-phosphate isomerase  26.78 
 
 		 365 aa  98.2  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0458  mannose-6-phosphate isomerase, class I  28.52 
 
 		 320 aa  96.3  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1327  Mannose-6-phosphate isomerase  23.9 
 
 		 319 aa  94.4  4e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1081  mannose-6-phosphate isomerase  29.33 
 
 		 369 aa  94  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0266  mannose-6-phosphate isomerase, class I  24.13 
 
 		 322 aa  91.3  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0467  mannose-6-phosphate isomerase  24.37 
 
 		 328 aa  91.3  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2722  mannose-6-phosphate isomerase  27.12 
 
 		 312 aa  90.9  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2666  mannose-6-phosphate isomerase  27.12 
 
 		 312 aa  90.9  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1171  mannose-6-phosphate isomerase, class I  26.03 
 
 		 314 aa  90.9  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0819  mannose-6-phosphate isomerase  25.83 
 
 		 315 aa  90.9  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1708  mannose-6-phosphate isomerase  28.22 
 
 		 315 aa  90.9  5e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.657704  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  22.99 
 
 		 312 aa  87.8  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2217  mannose-6-phosphate isomerase, class I  22.99 
 
 		 312 aa  87.8  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.735941  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3117  mannose-6-phosphate isomerase, class I  25.33 
 
 		 314 aa  85.9  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0284496  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1668  mannose-6-phosphate isomerase type I  27.34 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0844191  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0309  mannose-6-phosphate isomerase, class I  28.92 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2261  mannose-6-phosphate isomerase, class I  25.09 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0314  mannose-6-phosphate isomerase, class I  27.3 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000281347  normal  0.468377 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1263  phosphomannose isomerase  25.75 
 
 		 321 aa  82.8  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000784939  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0468  mannose-6-phosphate isomerase, class I  28.67 
 
 		 336 aa  83.2  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3397  mannose-6-phosphate isomerase, class I  26.76 
 
 		 318 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2595  Mannose-6-phosphate isomerase  24.91 
 
 		 325 aa  82  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2149  mannose-6-phosphate isomerase, class I  25.77 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3377  mannose-6-phosphate isomerase, class I  24.07 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.308254  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1752  mannose-6-phosphate isomerase, class I  23.76 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0921565  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1391  mannose-6-phosphate isomerase, class I  25.7 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1205  mannose-6-phosphate isomerase, class I  25.7 
 
 		 325 aa  77.8  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140202  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1319  mannose-6-phosphate isomerase, class I  22.02 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0119683  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0885  mannose-6-phosphate isomerase  24.87 
 
 		 326 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365127  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3743  mannose-6-phosphate isomerase  26.69 
 
 		 323 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.274174  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0249  phosphomannose isomerase  24.77 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.289498  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3116  mannose-6-phosphate isomerase, class I  26.24 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0475  phosphomannose isomerase type I  24.53 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.282321  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3802  mannose-6-phosphate isomerase  27.34 
 
 		 353 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1723  Mannose-6-phosphate isomerase  26.32 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  23.55 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0511343  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0141  mannose-6-phosphate isomerase, class I  26.95 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0321  mannose-6-phosphate isomerase  26.04 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000805309  hitchhiker  0.00737279 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3528  mannose-6-phosphate isomerase, class I  26.33 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0920  Mannose-6-phosphate isomerase  27.44 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0690486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0569  mannose-6-phosphate isomerase  25.75 
 
 		 325 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114617 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1681  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.51 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1245  Mannose-6-phosphate isomerase  25 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1769  phosphomannose isomerase  26.05 
 
 		 319 aa  62.4  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0193  mannose-6-phosphate isomerase, type I  28.57 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0191  mannose-6-phosphate isomerase type I  29.28 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0743  putative mannose-6-phosphate isomerase  30.3 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594978  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1575  mannose-6-phosphate isomerase  27.03 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2255  Mannose-6-phosphate isomerase  29.14 
 
 		 323 aa  55.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0223155  hitchhiker  0.00489167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4499  phosphomannose isomerase-like protein  32 
 
 		 294 aa  51.6  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1059  mannose-6-phosphate isomerase  24.32 
 
 		 315 aa  51.6  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191159 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0882  mannose-6-phosphate isomerase type I  24.54 
 
 		 273 aa  48.1  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240719  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1535  mannose-6-phosphate isomerase, type I  27.04 
 
 		 262 aa  45.4  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.480559  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0924  mannose-6-phosphate isomerase  28.04 
 
 		 307 aa  44.7  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0457  mannose-6-phosphate isomerase type I  21.67 
 
 		 271 aa  43.9  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>