77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0475 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0475  phosphomannose isomerase type I  100 
 
 
309 aa  631  1e-180  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.282321  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1708  mannose-6-phosphate isomerase  39.68 
 
 
315 aa  226  6e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.657704  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0249  phosphomannose isomerase  40.94 
 
 
322 aa  220  3e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.289498  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1688  mannose-6-phosphate isomerase, class I  40.62 
 
 
315 aa  219  3.9999999999999997e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.745586  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0819  mannose-6-phosphate isomerase  38.73 
 
 
315 aa  218  1e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1171  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.06 
 
 
314 aa  215  9e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1769  phosphomannose isomerase  36.31 
 
 
319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3397  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.24 
 
 
318 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0314  mannose-6-phosphate isomerase, class I  41.94 
 
 
336 aa  209  4e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000281347  normal  0.468377 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1263  phosphomannose isomerase  37.62 
 
 
321 aa  209  5e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000784939  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3377  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.58 
 
 
310 aa  207  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.308254  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2722  mannose-6-phosphate isomerase  37.82 
 
 
312 aa  206  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2666  mannose-6-phosphate isomerase  37.82 
 
 
312 aa  206  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3528  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.59 
 
 
320 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2261  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.91 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3117  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.33 
 
 
314 aa  193  4e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0284496  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2217  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.13 
 
 
312 aa  183  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.735941  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.13 
 
 
312 aa  183  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1681  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.07 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1752  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.44 
 
 
312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0921565  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2149  mannose-6-phosphate isomerase, class I  31.61 
 
 
329 aa  172  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0141  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.62 
 
 
318 aa  171  1e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1575  mannose-6-phosphate isomerase  43.85 
 
 
195 aa  171  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1319  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.88 
 
 
318 aa  169  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0119683  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1806  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.11 
 
 
319 aa  168  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1327  Mannose-6-phosphate isomerase  33.02 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21530  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.77 
 
 
353 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1391  mannose-6-phosphate isomerase, class I  31.06 
 
 
325 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1205  mannose-6-phosphate isomerase, class I  31.06 
 
 
325 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140202  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1081  mannose-6-phosphate isomerase  30.47 
 
 
369 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0458  mannose-6-phosphate isomerase, class I  31.63 
 
 
320 aa  145  9e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  31.27 
 
 
349 aa  145  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0511343  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12883  putative mannose-6-phosphate isomerase  33.08 
 
 
325 aa  142  7e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0465  Mannose-6-phosphate isomerase  35.75 
 
 
365 aa  138  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0468  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.37 
 
 
336 aa  137  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0309  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35 
 
 
326 aa  136  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0920  Mannose-6-phosphate isomerase  30.03 
 
 
321 aa  135  8e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0690486 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0321  mannose-6-phosphate isomerase  35 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000805309  hitchhiker  0.00737279 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0266  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.06 
 
 
322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0885  mannose-6-phosphate isomerase  30.86 
 
 
326 aa  133  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365127  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3802  mannose-6-phosphate isomerase  31.25 
 
 
353 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0191  mannose-6-phosphate isomerase type I  34.26 
 
 
278 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3116  mannose-6-phosphate isomerase, class I  31.74 
 
 
363 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1723  Mannose-6-phosphate isomerase  32.29 
 
 
344 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1535  mannose-6-phosphate isomerase, type I  33.33 
 
 
262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.480559  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0467  mannose-6-phosphate isomerase  36.32 
 
 
328 aa  126  5e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0457  mannose-6-phosphate isomerase type I  34.54 
 
 
271 aa  125  6e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0882  mannose-6-phosphate isomerase type I  31.17 
 
 
273 aa  125  8.000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240719  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0193  mannose-6-phosphate isomerase, type I  32.27 
 
 
278 aa  125  9e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3743  mannose-6-phosphate isomerase  30.67 
 
 
323 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.274174  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1245  Mannose-6-phosphate isomerase  26.69 
 
 
306 aa  123  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2595  Mannose-6-phosphate isomerase  33.57 
 
 
325 aa  118  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0569  mannose-6-phosphate isomerase  31.94 
 
 
325 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.114617 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1668  mannose-6-phosphate isomerase type I  28.72 
 
 
326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0844191  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2255  Mannose-6-phosphate isomerase  27.55 
 
 
323 aa  102  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0223155  hitchhiker  0.00489167 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0743  putative mannose-6-phosphate isomerase  32.39 
 
 
267 aa  87.8  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594978  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1059  mannose-6-phosphate isomerase  31.52 
 
 
315 aa  86.3  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191159 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1592  phosphomannose isomerase-like protein  33.82 
 
 
268 aa  85.1  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0924  mannose-6-phosphate isomerase  30.12 
 
 
307 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1783  hypothetical protein  26.84 
 
 
358 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.203269  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4499  phosphomannose isomerase-like protein  35.9 
 
 
294 aa  77  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1482  Phosphomannose isomerase-like protein  24.53 
 
 
505 aa  73.6  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2595  phosphomannose isomerase-like protein  24.38 
 
 
355 aa  65.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0506616  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0656  phosphomannose isomerase-like protein  27.23 
 
 
364 aa  63.5  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.189612  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3966  PfkB domain protein  25.77 
 
 
680 aa  60.5  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173743  normal  0.0415319 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3010  hypothetical protein  23.53 
 
 
587 aa  60.1  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020872  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28540  phosphomannose isomerase  26.83 
 
 
349 aa  57  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.188562 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6091  hypothetical protein  32.17 
 
 
339 aa  56.6  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0410  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.95 
 
 
372 aa  50.4  0.00004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2422  mannose-6-phosphate isomerase-like protein  20.52 
 
 
618 aa  50.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.167496 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0639  mannose-6-phosphate isomerase-like protein  19.86 
 
 
584 aa  49.7  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.459427  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3646  phosphomannose isomerase-like  22.44 
 
 
373 aa  47.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000088  mannose-6-phosphate isomerase  29.59 
 
 
411 aa  46.2  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2138  mannose-6-phosphate isomerase, class I  29.75 
 
 
394 aa  45.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.952255  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2266  hypothetical protein  22.37 
 
 
609 aa  43.5  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001304  mannose-6-phosphate isomerase  30.26 
 
 
410 aa  43.5  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.604165  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0895  mannose-6-phosphate isomerase  27.21 
 
 
405 aa  42.7  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0693206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>