74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0743 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0743  putative mannose-6-phosphate isomerase  100 
 
 
267 aa  541  1e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594978  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1592  phosphomannose isomerase-like protein  41.89 
 
 
268 aa  196  5.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4499  phosphomannose isomerase-like protein  43.68 
 
 
294 aa  195  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1059  mannose-6-phosphate isomerase  40.78 
 
 
315 aa  157  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191159 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0924  mannose-6-phosphate isomerase  41.78 
 
 
307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0569  mannose-6-phosphate isomerase  46.15 
 
 
325 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.114617 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1723  Mannose-6-phosphate isomerase  45.51 
 
 
344 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2666  mannose-6-phosphate isomerase  35.81 
 
 
312 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2722  mannose-6-phosphate isomerase  35.81 
 
 
312 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0321  mannose-6-phosphate isomerase  34.78 
 
 
316 aa  123  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000805309  hitchhiker  0.00737279 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3377  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.98 
 
 
310 aa  123  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.308254  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1263  phosphomannose isomerase  37.44 
 
 
321 aa  122  7e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000784939  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0465  Mannose-6-phosphate isomerase  48.85 
 
 
365 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3743  mannose-6-phosphate isomerase  42.36 
 
 
323 aa  119  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.274174  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3528  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.48 
 
 
320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0309  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.64 
 
 
326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0920  Mannose-6-phosphate isomerase  36.89 
 
 
321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0690486 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12883  putative mannose-6-phosphate isomerase  34.17 
 
 
325 aa  116  5e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21530  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.94 
 
 
353 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0458  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.41 
 
 
320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0467  mannose-6-phosphate isomerase  33.86 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1708  mannose-6-phosphate isomerase  36.99 
 
 
315 aa  113  3e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.657704  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3397  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.49 
 
 
318 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1688  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.07 
 
 
315 aa  112  6e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.745586  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0249  phosphomannose isomerase  36.9 
 
 
322 aa  111  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.289498  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.66 
 
 
349 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0511343  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0193  mannose-6-phosphate isomerase, type I  38.19 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2261  mannose-6-phosphate isomerase, class I  42.33 
 
 
316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1171  mannose-6-phosphate isomerase, class I  41.1 
 
 
314 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0468  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.89 
 
 
336 aa  109  4.0000000000000004e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1806  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.03 
 
 
319 aa  108  9.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2149  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.06 
 
 
329 aa  107  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1081  mannose-6-phosphate isomerase  43.31 
 
 
369 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1319  mannose-6-phosphate isomerase, class I  45.86 
 
 
318 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0119683  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0457  mannose-6-phosphate isomerase type I  34.55 
 
 
271 aa  107  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1535  mannose-6-phosphate isomerase, type I  29.78 
 
 
262 aa  107  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.480559  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0266  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.49 
 
 
322 aa  106  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1681  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.32 
 
 
312 aa  107  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0819  mannose-6-phosphate isomerase  42.07 
 
 
315 aa  106  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1575  mannose-6-phosphate isomerase  42.75 
 
 
195 aa  105  6e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2255  Mannose-6-phosphate isomerase  46.21 
 
 
323 aa  105  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0223155  hitchhiker  0.00489167 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0141  mannose-6-phosphate isomerase, class I  45.77 
 
 
318 aa  105  9e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0885  mannose-6-phosphate isomerase  38.46 
 
 
326 aa  104  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365127  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0882  mannose-6-phosphate isomerase type I  34.54 
 
 
273 aa  105  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240719  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0191  mannose-6-phosphate isomerase type I  36.18 
 
 
278 aa  103  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1752  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.48 
 
 
312 aa  103  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0921565  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1769  phosphomannose isomerase  35.63 
 
 
319 aa  102  6e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0314  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.18 
 
 
336 aa  101  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000281347  normal  0.468377 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.63 
 
 
312 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2595  Mannose-6-phosphate isomerase  39.72 
 
 
325 aa  100  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2217  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.63 
 
 
312 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.735941  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1205  mannose-6-phosphate isomerase, class I  42.96 
 
 
325 aa  99.4  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140202  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3802  mannose-6-phosphate isomerase  34.73 
 
 
353 aa  99.4  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1245  Mannose-6-phosphate isomerase  34.32 
 
 
306 aa  99.4  6e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1391  mannose-6-phosphate isomerase, class I  42.96 
 
 
325 aa  99.4  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3117  mannose-6-phosphate isomerase, class I  40.31 
 
 
314 aa  99  7e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0284496  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3116  mannose-6-phosphate isomerase, class I  40.88 
 
 
363 aa  98.2  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1668  mannose-6-phosphate isomerase type I  31.88 
 
 
326 aa  97.1  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0844191  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1327  Mannose-6-phosphate isomerase  35.76 
 
 
319 aa  91.7  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0475  phosphomannose isomerase type I  32.39 
 
 
309 aa  87.8  1e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.282321  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1783  hypothetical protein  37.9 
 
 
358 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.203269  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2595  phosphomannose isomerase-like protein  26.51 
 
 
355 aa  67  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0506616  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0656  phosphomannose isomerase-like protein  35.54 
 
 
364 aa  63.5  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.189612  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3646  phosphomannose isomerase-like  24.3 
 
 
373 aa  60.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28540  phosphomannose isomerase  36.36 
 
 
349 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.188562 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6091  hypothetical protein  34.15 
 
 
339 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3966  PfkB domain protein  32.85 
 
 
680 aa  58.9  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173743  normal  0.0415319 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1482  Phosphomannose isomerase-like protein  30.3 
 
 
505 aa  58.5  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2422  mannose-6-phosphate isomerase-like protein  28.47 
 
 
618 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.167496 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4282  hypothetical protein  31.62 
 
 
598 aa  52.8  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0756  hypothetical protein  28.86 
 
 
587 aa  52.8  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.31068  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2266  hypothetical protein  32.06 
 
 
609 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3010  hypothetical protein  29.85 
 
 
587 aa  49.7  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020872  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0639  mannose-6-phosphate isomerase-like protein  28.03 
 
 
584 aa  49.7  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.459427  normal  0.13799 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>