81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0656 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0656  phosphomannose isomerase-like protein  100 
 
 		 364 aa  752    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.189612  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3646  phosphomannose isomerase-like  32.58 
 
 		 373 aa  188  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28540  phosphomannose isomerase  30.03 
 
 		 349 aa  166  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.188562 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6091  hypothetical protein  31.29 
 
 		 339 aa  164  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3966  PfkB domain protein  27.08 
 
 		 680 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173743  normal  0.0415319 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0458  mannose-6-phosphate isomerase, class I  31 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0468  mannose-6-phosphate isomerase, class I  26.37 
 
 		 336 aa  102  8e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0266  mannose-6-phosphate isomerase, class I  29.39 
 
 		 322 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12883  putative mannose-6-phosphate isomerase  27.95 
 
 		 325 aa  101  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21530  mannose-6-phosphate isomerase, class I  29.6 
 
 		 353 aa  98.2  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  29.41 
 
 		 349 aa  94.4  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0511343  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0314  mannose-6-phosphate isomerase, class I  25.89 
 
 		 336 aa  88.6  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000281347  normal  0.468377 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0309  mannose-6-phosphate isomerase, class I  25.34 
 
 		 326 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1319  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.65 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0119683  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0467  mannose-6-phosphate isomerase  27.08 
 
 		 328 aa  88.6  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3397  mannose-6-phosphate isomerase, class I  27.31 
 
 		 318 aa  86.7  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3528  mannose-6-phosphate isomerase, class I  26.67 
 
 		 320 aa  86.3  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2595  Mannose-6-phosphate isomerase  32.1 
 
 		 325 aa  85.5  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1752  mannose-6-phosphate isomerase, class I  26.56 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0921565  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3377  mannose-6-phosphate isomerase, class I  27.21 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.308254  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1171  mannose-6-phosphate isomerase, class I  27.48 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0569  mannose-6-phosphate isomerase  35.94 
 
 		 325 aa  82.8  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114617 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1205  mannose-6-phosphate isomerase, class I  28.83 
 
 		 325 aa  82.8  0.000000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140202  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1391  mannose-6-phosphate isomerase, class I  29.63 
 
 		 325 aa  82.8  0.000000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3116  mannose-6-phosphate isomerase, class I  29.27 
 
 		 363 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2666  mannose-6-phosphate isomerase  26.02 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2722  mannose-6-phosphate isomerase  26.02 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3743  mannose-6-phosphate isomerase  27.17 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.274174  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1708  mannose-6-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.657704  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0885  mannose-6-phosphate isomerase  21.74 
 
 		 326 aa  79.7  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365127  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  26.25 
 
 		 312 aa  79.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2217  mannose-6-phosphate isomerase, class I  26.25 
 
 		 312 aa  79.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.735941  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1327  Mannose-6-phosphate isomerase  25.47 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0920  Mannose-6-phosphate isomerase  32.16 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0690486 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0465  Mannose-6-phosphate isomerase  35.66 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0819  mannose-6-phosphate isomerase  27.11 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1806  mannose-6-phosphate isomerase, class I  29.06 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1688  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.3 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.745586  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1769  phosphomannose isomerase  29.63 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1723  Mannose-6-phosphate isomerase  33.09 
 
 		 344 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2149  mannose-6-phosphate isomerase, class I  25 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3802  mannose-6-phosphate isomerase  23.15 
 
 		 353 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1668  mannose-6-phosphate isomerase type I  29.41 
 
 		 326 aa  72.8  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0844191  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0321  mannose-6-phosphate isomerase  32.24 
 
 		 316 aa  72.4  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000805309  hitchhiker  0.00737279 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1081  mannose-6-phosphate isomerase  30.67 
 
 		 369 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0193  mannose-6-phosphate isomerase, type I  28.99 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0249  phosphomannose isomerase  25.68 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.289498  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0141  mannose-6-phosphate isomerase, class I  26.51 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1263  phosphomannose isomerase  24.9 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000784939  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2261  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.19 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1059  mannose-6-phosphate isomerase  31.97 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191159 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1783  hypothetical protein  30.39 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.203269  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0191  mannose-6-phosphate isomerase type I  35.25 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1575  mannose-6-phosphate isomerase  31.3 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0882  mannose-6-phosphate isomerase type I  29.03 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240719  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3117  mannose-6-phosphate isomerase, class I  29.35 
 
 		 314 aa  65.9  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0284496  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2255  Mannose-6-phosphate isomerase  30.77 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0223155  hitchhiker  0.00489167 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1535  mannose-6-phosphate isomerase, type I  26.21 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.480559  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0457  mannose-6-phosphate isomerase type I  31.45 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0743  putative mannose-6-phosphate isomerase  35.54 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594978  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0475  phosphomannose isomerase type I  27.23 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.282321  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4499  phosphomannose isomerase-like protein  31.41 
 
 		 294 aa  62.4  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2595  phosphomannose isomerase-like protein  20.53 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0506616  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0924  mannose-6-phosphate isomerase  35.34 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1245  Mannose-6-phosphate isomerase  28.4 
 
 		 306 aa  59.3  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1681  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.8 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2422  mannose-6-phosphate isomerase-like protein  23.77 
 
 		 618 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.167496 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1592  phosphomannose isomerase-like protein  33.33 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0756  hypothetical protein  28.57 
 
 		 587 aa  57  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.31068  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1608  hypothetical protein  24.71 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0639  mannose-6-phosphate isomerase-like protein  25 
 
 		 584 aa  50.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.459427  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4282  hypothetical protein  25.66 
 
 		 598 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3010  hypothetical protein  24.4 
 
 		 587 aa  48.5  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020872  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1876  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.21 
 
 		 391 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1635  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.21 
 
 		 391 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1566  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.21 
 
 		 391 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.368763  normal  0.0569701 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1707  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.21 
 
 		 391 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.104692  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1576  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.21 
 
 		 391 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.714022  normal  0.668804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2266  hypothetical protein  25.69 
 
 		 609 aa  47  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2248  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.19 
 
 		 400 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000163868 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2098  mannose-6-phosphate isomerase  31.25 
 
 		 398 aa  45.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.302925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>