74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0924 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0924  mannose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 307 aa  597  1e-170  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1059  mannose-6-phosphate isomerase  54.98 
 
 		 315 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191159 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4499  phosphomannose isomerase-like protein  44.84 
 
 		 294 aa  192  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1592  phosphomannose isomerase-like protein  46.15 
 
 		 268 aa  158  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0743  putative mannose-6-phosphate isomerase  42.59 
 
 		 267 aa  151  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594978  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0569  mannose-6-phosphate isomerase  34.38 
 
 		 325 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114617 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  40.68 
 
 		 349 aa  136  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0511343  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1723  Mannose-6-phosphate isomerase  48.55 
 
 		 344 aa  135  9e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3743  mannose-6-phosphate isomerase  35.86 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.274174  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0885  mannose-6-phosphate isomerase  37.61 
 
 		 326 aa  129  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365127  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0465  Mannose-6-phosphate isomerase  39.53 
 
 		 365 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0920  Mannose-6-phosphate isomerase  37.5 
 
 		 321 aa  126  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0690486 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1081  mannose-6-phosphate isomerase  45.14 
 
 		 369 aa  126  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0458  mannose-6-phosphate isomerase, class I  28.93 
 
 		 320 aa  122  7e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0309  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.58 
 
 		 326 aa  122  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21530  mannose-6-phosphate isomerase, class I  40 
 
 		 353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12883  putative mannose-6-phosphate isomerase  38.55 
 
 		 325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2255  Mannose-6-phosphate isomerase  44.63 
 
 		 323 aa  119  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0223155  hitchhiker  0.00489167 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0467  mannose-6-phosphate isomerase  36.47 
 
 		 328 aa  119  9e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1263  phosphomannose isomerase  31.34 
 
 		 321 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000784939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0321  mannose-6-phosphate isomerase  42.6 
 
 		 316 aa  116  3.9999999999999997e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000805309  hitchhiker  0.00737279 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0266  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.91 
 
 		 322 aa  115  8.999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3802  mannose-6-phosphate isomerase  45.81 
 
 		 353 aa  115  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2261  mannose-6-phosphate isomerase, class I  31.93 
 
 		 316 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2595  Mannose-6-phosphate isomerase  41.3 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0468  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.44 
 
 		 336 aa  113  3e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1688  mannose-6-phosphate isomerase, class I  31.5 
 
 		 315 aa  112  6e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.745586  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2149  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.99 
 
 		 329 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0819  mannose-6-phosphate isomerase  37.63 
 
 		 315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1752  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.77 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0921565  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1205  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.99 
 
 		 325 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140202  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1391  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.99 
 
 		 325 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1708  mannose-6-phosphate isomerase  32.91 
 
 		 315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.657704  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2666  mannose-6-phosphate isomerase  29 
 
 		 312 aa  109  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2722  mannose-6-phosphate isomerase  29 
 
 		 312 aa  109  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1319  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.43 
 
 		 318 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0119683  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0249  phosphomannose isomerase  34.95 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.289498  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3116  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.94 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1327  Mannose-6-phosphate isomerase  31.25 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1575  mannose-6-phosphate isomerase  37.87 
 
 		 195 aa  107  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3117  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.93 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0284496  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3377  mannose-6-phosphate isomerase, class I  29.58 
 
 		 310 aa  106  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.308254  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2217  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.25 
 
 		 312 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.735941  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.25 
 
 		 312 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1806  mannose-6-phosphate isomerase, class I  29.77 
 
 		 319 aa  102  8e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1769  phosphomannose isomerase  37.65 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1245  Mannose-6-phosphate isomerase  37.57 
 
 		 306 aa  100  4e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1535  mannose-6-phosphate isomerase, type I  30.32 
 
 		 262 aa  99  9e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.480559  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1681  mannose-6-phosphate isomerase, class I  44.27 
 
 		 312 aa  97.4  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0141  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.85 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1171  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.5 
 
 		 314 aa  96.7  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0314  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.09 
 
 		 336 aa  95.1  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000281347  normal  0.468377 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3397  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.51 
 
 		 318 aa  92  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3528  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.51 
 
 		 320 aa  92  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0193  mannose-6-phosphate isomerase, type I  32.95 
 
 		 278 aa  92.4  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0457  mannose-6-phosphate isomerase type I  32.97 
 
 		 271 aa  90.9  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0191  mannose-6-phosphate isomerase type I  34.05 
 
 		 278 aa  90.5  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1668  mannose-6-phosphate isomerase type I  40.43 
 
 		 326 aa  88.2  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0844191  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0475  phosphomannose isomerase type I  30.29 
 
 		 309 aa  86.7  5e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.282321  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0882  mannose-6-phosphate isomerase type I  32.32 
 
 		 273 aa  85.5  9e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240719  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3966  PfkB domain protein  36.96 
 
 		 680 aa  75.1  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173743  normal  0.0415319 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1783  hypothetical protein  39.09 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.203269  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2595  phosphomannose isomerase-like protein  31.1 
 
 		 355 aa  72.4  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0506616  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0756  hypothetical protein  33.62 
 
 		 587 aa  63.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.31068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4282  hypothetical protein  31.78 
 
 		 598 aa  63.5  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0656  phosphomannose isomerase-like protein  34.4 
 
 		 364 aa  62.8  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.189612  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28540  phosphomannose isomerase  33.05 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.188562 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6091  hypothetical protein  34.45 
 
 		 339 aa  57  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2266  hypothetical protein  31.5 
 
 		 609 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3010  hypothetical protein  29.13 
 
 		 587 aa  52.8  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020872  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2422  mannose-6-phosphate isomerase-like protein  30.77 
 
 		 618 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.167496 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3646  phosphomannose isomerase-like  32.8 
 
 		 373 aa  50.8  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0639  mannose-6-phosphate isomerase-like protein  28.46 
 
 		 584 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.459427  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1482  Phosphomannose isomerase-like protein  28.04 
 
 		 505 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>