93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0309 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0309  mannose-6-phosphate isomerase, class I  100 
 
 		 326 aa  675    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0467  mannose-6-phosphate isomerase  54.94 
 
 		 328 aa  360  2e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12883  putative mannose-6-phosphate isomerase  50.78 
 
 		 325 aa  326  3e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0468  mannose-6-phosphate isomerase, class I  48.93 
 
 		 336 aa  320  3e-86  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0266  mannose-6-phosphate isomerase, class I  49.69 
 
 		 322 aa  311  1e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0458  mannose-6-phosphate isomerase, class I  47.85 
 
 		 320 aa  310  2e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21530  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.97 
 
 		 353 aa  236  5.0000000000000005e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0465  Mannose-6-phosphate isomerase  40.48 
 
 		 365 aa  228  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.55 
 
 		 349 aa  222  7e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0511343  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1806  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.42 
 
 		 319 aa  219  7e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1319  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.74 
 
 		 318 aa  210  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0119683  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1391  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.87 
 
 		 325 aa  204  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1205  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.87 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140202  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1081  mannose-6-phosphate isomerase  36.78 
 
 		 369 aa  200  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3802  mannose-6-phosphate isomerase  39.21 
 
 		 353 aa  199  5e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0885  mannose-6-phosphate isomerase  35.67 
 
 		 326 aa  196  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365127  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1327  Mannose-6-phosphate isomerase  37.18 
 
 		 319 aa  196  3e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1263  phosphomannose isomerase  36.53 
 
 		 321 aa  196  6e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000784939  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2595  Mannose-6-phosphate isomerase  35.45 
 
 		 325 aa  191  1e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2149  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.65 
 
 		 329 aa  191  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3743  mannose-6-phosphate isomerase  34.45 
 
 		 323 aa  189  7e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.274174  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1723  Mannose-6-phosphate isomerase  35.63 
 
 		 344 aa  187  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1245  Mannose-6-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 306 aa  179  4e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3397  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.17 
 
 		 318 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0249  phosphomannose isomerase  34.23 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.289498  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1688  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.01 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.745586  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3116  mannose-6-phosphate isomerase, class I  41.13 
 
 		 363 aa  176  6e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1708  mannose-6-phosphate isomerase  36.51 
 
 		 315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.657704  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0819  mannose-6-phosphate isomerase  33.75 
 
 		 315 aa  169  6e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1171  mannose-6-phosphate isomerase, class I  42.15 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3528  mannose-6-phosphate isomerase, class I  41.74 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0314  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.64 
 
 		 336 aa  166  4e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000281347  normal  0.468377 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1668  mannose-6-phosphate isomerase type I  38.94 
 
 		 326 aa  162  8.000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0844191  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0141  mannose-6-phosphate isomerase, class I  43.38 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0321  mannose-6-phosphate isomerase  34.56 
 
 		 316 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000805309  hitchhiker  0.00737279 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2261  mannose-6-phosphate isomerase, class I  40 
 
 		 316 aa  159  6e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0569  mannose-6-phosphate isomerase  30.06 
 
 		 325 aa  159  8e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114617 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3377  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.63 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.308254  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2722  mannose-6-phosphate isomerase  33.92 
 
 		 312 aa  156  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2666  mannose-6-phosphate isomerase  33.92 
 
 		 312 aa  156  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1769  phosphomannose isomerase  33.74 
 
 		 319 aa  156  6e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1752  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.41 
 
 		 312 aa  153  4e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0921565  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0920  Mannose-6-phosphate isomerase  31.02 
 
 		 321 aa  145  9e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0690486 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2217  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.44 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.735941  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1681  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.4 
 
 		 312 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.44 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1783  hypothetical protein  30.51 
 
 		 358 aa  139  8.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.203269  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1575  mannose-6-phosphate isomerase  39.46 
 
 		 195 aa  137  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3117  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.71 
 
 		 314 aa  136  5e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0284496  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0475  phosphomannose isomerase type I  35 
 
 		 309 aa  136  5e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.282321  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2595  phosphomannose isomerase-like protein  28.18 
 
 		 355 aa  134  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0506616  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0193  mannose-6-phosphate isomerase, type I  35.86 
 
 		 278 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2255  Mannose-6-phosphate isomerase  30.69 
 
 		 323 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0223155  hitchhiker  0.00489167 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0924  mannose-6-phosphate isomerase  32.55 
 
 		 307 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0743  putative mannose-6-phosphate isomerase  32.64 
 
 		 267 aa  117  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594978  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0191  mannose-6-phosphate isomerase type I  34.47 
 
 		 278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1592  phosphomannose isomerase-like protein  42.36 
 
 		 268 aa  112  7.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1059  mannose-6-phosphate isomerase  41.61 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191159 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0457  mannose-6-phosphate isomerase type I  33.19 
 
 		 271 aa  109  5e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4499  phosphomannose isomerase-like protein  33.49 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3966  PfkB domain protein  29.75 
 
 		 680 aa  106  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173743  normal  0.0415319 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1535  mannose-6-phosphate isomerase, type I  31.28 
 
 		 262 aa  98.2  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.480559  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28540  phosphomannose isomerase  27.34 
 
 		 349 aa  95.1  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.188562 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0882  mannose-6-phosphate isomerase type I  29.31 
 
 		 273 aa  92.8  7e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240719  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0656  phosphomannose isomerase-like protein  25.34 
 
 		 364 aa  89.4  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.189612  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1482  Phosphomannose isomerase-like protein  28.92 
 
 		 505 aa  85.1  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6091  hypothetical protein  26.49 
 
 		 339 aa  81.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3646  phosphomannose isomerase-like  30.36 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4282  hypothetical protein  25.58 
 
 		 598 aa  73.9  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2422  mannose-6-phosphate isomerase-like protein  24.32 
 
 		 618 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.167496 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3010  hypothetical protein  29.39 
 
 		 587 aa  67.8  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020872  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0639  mannose-6-phosphate isomerase-like protein  23.1 
 
 		 584 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.459427  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2266  hypothetical protein  27.47 
 
 		 609 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0756  hypothetical protein  21.76 
 
 		 587 aa  56.2  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.31068  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1608  hypothetical protein  25.52 
 
 		 407 aa  48.5  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0965  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.32 
 
 		 387 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.857697  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0902  mannose-6-phosphate isomerase, class I  31.68 
 
 		 387 aa  47.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.942803  normal  0.0915708 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1993  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.41 
 
 		 421 aa  47  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1186  mannose-6-phosphate isomerase  29.57 
 
 		 416 aa  47  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.215297  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3511  mannose-6-phosphate isomerase  27.43 
 
 		 369 aa  46.2  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1257  mannose-6-phosphate isomerase, class I  28.7 
 
 		 425 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000844984 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1172  mannose-6-phosphate isomerase, class I  29.29 
 
 		 399 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0791265  normal  0.965156 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4202  mannose-6-phosphate isomerase  30 
 
 		 412 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3297  mannose-6-phosphate isomerase, class I  25 
 
 		 416 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4165  mannose-6-phosphate isomerase, class I  28.95 
 
 		 406 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.292455  normal  0.858964 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0968  hypothetical protein  21.88 
 
 		 405 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0260855 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1830  mannose-6-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 391 aa  44.3  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00725153 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3169  hypothetical protein  26.32 
 
 		 404 aa  43.5  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02540  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.89 
 
 		 400 aa  43.5  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4995  Mannose-6-phosphate isomerase  38 
 
 		 396 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.549808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72090  mannose-6-phosphate isomerase  34.85 
 
 		 439 aa  42.7  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.800208 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0860  mannose-6-phosphate isomerase, class I  25.29 
 
 		 395 aa  43.1  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2098  mannose-6-phosphate isomerase  37.25 
 
 		 398 aa  42.7  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.302925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>