87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4165 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4165  mannose-6-phosphate isomerase, class I  100 
 
 
406 aa  803    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.292455  normal  0.858964 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6324  mannose-6-phosphate isomerase, class I  58.39 
 
 
407 aa  439  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.199717  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30990  mannose-6-phosphate isomerase  54.48 
 
 
411 aa  419  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3297  mannose-6-phosphate isomerase, class I  54 
 
 
416 aa  395  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4724  mannose-6-phosphate isomerase, class I  56.06 
 
 
408 aa  389  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal  0.477393 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2253  mannose-6-phosphate isomerase, class I  53.69 
 
 
419 aa  390  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0483386  normal  0.187903 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1189  mannose-6-phosphate isomerase, class I  55.75 
 
 
407 aa  391  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.816814  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1330  mannose-6-phosphate isomerase  54.22 
 
 
409 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37283  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1347  mannose-6-phosphate isomerase  54.22 
 
 
409 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.46629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1366  mannose-6-phosphate isomerase  53.73 
 
 
409 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.837438 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1739  mannose-6-phosphate isomerase, class I  52.9 
 
 
408 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13284  mannose-6-phosphate isomerase manA  53.22 
 
 
408 aa  362  4e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34249 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6006  mannose-6-phosphate isomerase class I  45.91 
 
 
402 aa  322  9.000000000000001e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000013531  normal  0.0800927 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4295  mannose-6-phosphate isomerase, class I  47.54 
 
 
391 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1116  mannose-6-phosphate isomerase, class I  47.17 
 
 
394 aa  307  3e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0922592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2248  mannose-6-phosphate isomerase, class I  43.03 
 
 
400 aa  294  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163868 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1186  mannose-6-phosphate isomerase  44.63 
 
 
416 aa  293  4e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.215297  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1257  mannose-6-phosphate isomerase, class I  45.32 
 
 
425 aa  292  7e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000844984 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2015  mannose-6-phosphate isomerase, class I  43.41 
 
 
401 aa  290  3e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000590051  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30820  mannose-6-phosphate isomerase, class I  43.59 
 
 
415 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4995  Mannose-6-phosphate isomerase  45.64 
 
 
396 aa  283  6.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.549808  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1172  mannose-6-phosphate isomerase, class I  45.83 
 
 
399 aa  276  3e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0791265  normal  0.965156 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0016  mannose-6-phosphate isomerase  45.96 
 
 
423 aa  276  3e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.976239  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0965  mannose-6-phosphate isomerase, class I  45.16 
 
 
387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.857697  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000088  mannose-6-phosphate isomerase  39.59 
 
 
411 aa  270  4e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0860  mannose-6-phosphate isomerase, class I  41.71 
 
 
395 aa  264  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0895  mannose-6-phosphate isomerase  36.54 
 
 
405 aa  262  8.999999999999999e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0693206  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2543  mannose-6-phosphate isomerase, class I  40.79 
 
 
412 aa  261  1e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2269  mannose-6-phosphate isomerase  40.25 
 
 
391 aa  259  4e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1874  mannose-6-phosphate isomerase, class I  40.25 
 
 
391 aa  259  5.0000000000000005e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0430449  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4202  mannose-6-phosphate isomerase  42.07 
 
 
412 aa  258  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2039  mannose-6-phosphate isomerase, class I  40.05 
 
 
390 aa  257  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02540  mannose-6-phosphate isomerase, class I  40.9 
 
 
400 aa  257  2e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1993  mannose-6-phosphate isomerase, class I  42.14 
 
 
421 aa  258  2e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0902  mannose-6-phosphate isomerase, class I  43.49 
 
 
387 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.942803  normal  0.0915708 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3870  mannose-6-phosphate isomerase, class I  43.95 
 
 
402 aa  253  6e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0760248  decreased coverage  0.0014351 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1586  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.92 
 
 
391 aa  251  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.762503  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2323  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.92 
 
 
391 aa  250  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.734399  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2030  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.92 
 
 
391 aa  249  4e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0478981  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01572  hypothetical protein  38.92 
 
 
391 aa  250  4e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01582  mannose-6-phosphate isomerase  38.92 
 
 
391 aa  250  4e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2277  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.24 
 
 
392 aa  249  5e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.106024 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001304  mannose-6-phosphate isomerase  38.24 
 
 
410 aa  249  5e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.604165  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2340  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.25 
 
 
390 aa  249  6e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00704  phosphomannose isomerase  36.8 
 
 
405 aa  249  7e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05183  mannose-6-phosphate isomerase  37.31 
 
 
410 aa  248  9e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1688  mannose-6-phosphate isomerase  38.67 
 
 
391 aa  248  1e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2017  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.67 
 
 
391 aa  248  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1799  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.67 
 
 
391 aa  248  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1576  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.67 
 
 
391 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.714022  normal  0.668804 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1422  mannose-6-phosphate isomerase  37.47 
 
 
388 aa  247  3e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1830  mannose-6-phosphate isomerase  39.24 
 
 
391 aa  247  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00725153 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1566  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.92 
 
 
391 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.368763  normal  0.0569701 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1707  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.67 
 
 
391 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.104692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1821  mannose-6-phosphate isomerase  38.67 
 
 
391 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.280304  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1902  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.55 
 
 
394 aa  245  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.706948  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1876  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.67 
 
 
391 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1635  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.67 
 
 
391 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2138  mannose-6-phosphate isomerase, class I  40.34 
 
 
394 aa  243  3e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.952255  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2387  mannose-6-phosphate isomerase, class I  40.35 
 
 
396 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.318931  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2647  mannose-6-phosphate isomerase  37.53 
 
 
399 aa  241  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1986  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.73 
 
 
359 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3511  mannose-6-phosphate isomerase  40.25 
 
 
369 aa  229  5e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05210  mannose-6-phosphate isomerase, class I  43.27 
 
 
414 aa  221  1.9999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.117407  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4035  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.99 
 
 
408 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0762844  normal  0.148973 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2098  mannose-6-phosphate isomerase  40.15 
 
 
398 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.302925 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5861  mannose-6-phosphate isomerase, class I  43.67 
 
 
429 aa  219  6e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000549194  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0748  mannose-6-phosphate isomerase  37.72 
 
 
433 aa  211  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4238  mannose-6-phosphate isomerase, class I  44.84 
 
 
1553 aa  207  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0605  mannose-6-phosphate isomerase  32.57 
 
 
401 aa  197  4.0000000000000005e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1613  mannose-6-phosphate isomerase (phosphomannose isomerase)  33.5 
 
 
368 aa  189  5e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.194468  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0410  mannose-6-phosphate isomerase, class I  29.93 
 
 
372 aa  179  9e-44  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3605  predicted protein  33.58 
 
 
407 aa  158  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44264  mannose-6-phosphate isomerase, type  33.16 
 
 
527 aa  152  7e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.167153  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02370  mannose-6-phosphate isomerase  30.45 
 
 
434 aa  150  5e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.943759  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72090  mannose-6-phosphate isomerase  29.6 
 
 
439 aa  144  4e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.800208 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00667  Mannose-6-phosphate isomerase (EC 5.3.1.8)(Phosphomannose isomerase)(PMI)(Phosphohexomutase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P29951]  32.05 
 
 
461 aa  138  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.354212 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01715  mannose-6-phosphate isomerase, class I (AFU_orthologue; AFUA_4G08410)  29.5 
 
 
404 aa  125  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.299956  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01750  mannose-6-phosphate isomerase, putative  27.96 
 
 
456 aa  83.2  0.000000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.673433  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0266  mannose-6-phosphate isomerase, class I  29.84 
 
 
322 aa  53.9  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0458  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.77 
 
 
320 aa  51.6  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0468  mannose-6-phosphate isomerase, class I  26.78 
 
 
336 aa  49.7  0.00008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0467  mannose-6-phosphate isomerase  28.7 
 
 
328 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0309  mannose-6-phosphate isomerase, class I  28.95 
 
 
326 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1081  mannose-6-phosphate isomerase  26.22 
 
 
369 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0885  mannose-6-phosphate isomerase  31.25 
 
 
326 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365127  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12883  putative mannose-6-phosphate isomerase  38.46 
 
 
325 aa  43.9  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>