85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1993 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1993  mannose-6-phosphate isomerase, class I  100 
 
 		 421 aa  843    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30820  mannose-6-phosphate isomerase, class I  55.9 
 
 		 415 aa  422  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2543  mannose-6-phosphate isomerase, class I  46.64 
 
 		 412 aa  319  5e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1116  mannose-6-phosphate isomerase, class I  43.59 
 
 		 394 aa  278  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0922592 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1186  mannose-6-phosphate isomerase  44.52 
 
 		 416 aa  273  6e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.215297  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6324  mannose-6-phosphate isomerase, class I  44.61 
 
 		 407 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.199717  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2253  mannose-6-phosphate isomerase, class I  43.57 
 
 		 419 aa  267  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0483386  normal  0.187903 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4202  mannose-6-phosphate isomerase  41.15 
 
 		 412 aa  261  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1257  mannose-6-phosphate isomerase, class I  47.84 
 
 		 425 aa  258  1e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000844984 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4165  mannose-6-phosphate isomerase, class I  42.14 
 
 		 406 aa  258  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.292455  normal  0.858964 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2248  mannose-6-phosphate isomerase, class I  41.41 
 
 		 400 aa  257  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000163868 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0860  mannose-6-phosphate isomerase, class I  40.28 
 
 		 395 aa  256  5e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0016  mannose-6-phosphate isomerase  42.28 
 
 		 423 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.976239  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3297  mannose-6-phosphate isomerase, class I  41.59 
 
 		 416 aa  253  5.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2387  mannose-6-phosphate isomerase, class I  41.31 
 
 		 396 aa  253  6e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.318931  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2323  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.92 
 
 		 391 aa  250  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.734399  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2030  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.92 
 
 		 391 aa  249  5e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0478981  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01582  mannose-6-phosphate isomerase  38.92 
 
 		 391 aa  249  6e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01572  hypothetical protein  38.92 
 
 		 391 aa  249  6e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1830  mannose-6-phosphate isomerase  38 
 
 		 391 aa  247  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00725153 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1739  mannose-6-phosphate isomerase, class I  40.95 
 
 		 408 aa  247  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1799  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.68 
 
 		 391 aa  246  4e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2017  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.68 
 
 		 391 aa  246  4e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1688  mannose-6-phosphate isomerase  38.68 
 
 		 391 aa  246  4e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1821  mannose-6-phosphate isomerase  38.68 
 
 		 391 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.280304  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1586  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.44 
 
 		 391 aa  245  9e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.762503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00704  phosphomannose isomerase  36 
 
 		 405 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4724  mannose-6-phosphate isomerase, class I  40.81 
 
 		 408 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal  0.477393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1330  mannose-6-phosphate isomerase  39.81 
 
 		 409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37283  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1347  mannose-6-phosphate isomerase  39.81 
 
 		 409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.46629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1366  mannose-6-phosphate isomerase  39.26 
 
 		 409 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.837438 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02540  mannose-6-phosphate isomerase, class I  40.37 
 
 		 400 aa  241  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1422  mannose-6-phosphate isomerase  36.04 
 
 		 388 aa  240  2.9999999999999997e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1172  mannose-6-phosphate isomerase, class I  40.43 
 
 		 399 aa  240  2.9999999999999997e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0791265  normal  0.965156 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13284  mannose-6-phosphate isomerase manA  41.22 
 
 		 408 aa  239  5e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.34249 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30990  mannose-6-phosphate isomerase  38.48 
 
 		 411 aa  239  6.999999999999999e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4995  Mannose-6-phosphate isomerase  42.28 
 
 		 396 aa  239  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.549808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2015  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.3 
 
 		 401 aa  237  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000590051  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05183  mannose-6-phosphate isomerase  36.28 
 
 		 410 aa  237  4e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6006  mannose-6-phosphate isomerase class I  39.29 
 
 		 402 aa  236  7e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000013531  normal  0.0800927 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3870  mannose-6-phosphate isomerase, class I  40.09 
 
 		 402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0760248  decreased coverage  0.0014351 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001304  mannose-6-phosphate isomerase  36.21 
 
 		 410 aa  234  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.604165  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0895  mannose-6-phosphate isomerase  34.82 
 
 		 405 aa  233  4.0000000000000004e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0693206  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000088  mannose-6-phosphate isomerase  35.67 
 
 		 411 aa  232  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1902  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.71 
 
 		 394 aa  232  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.706948  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1566  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.2 
 
 		 391 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.368763  normal  0.0569701 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1707  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.2 
 
 		 391 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.104692  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1876  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.2 
 
 		 391 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1576  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.2 
 
 		 391 aa  229  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.714022  normal  0.668804 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4295  mannose-6-phosphate isomerase, class I  42.82 
 
 		 391 aa  228  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1635  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.97 
 
 		 391 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2138  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.65 
 
 		 394 aa  224  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.952255  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05210  mannose-6-phosphate isomerase, class I  41.06 
 
 		 414 aa  224  2e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.117407  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1874  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.94 
 
 		 391 aa  223  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0430449  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3511  mannose-6-phosphate isomerase  37.8 
 
 		 369 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2269  mannose-6-phosphate isomerase  35.71 
 
 		 391 aa  222  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2277  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.38 
 
 		 392 aa  220  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.106024 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1189  mannose-6-phosphate isomerase, class I  40.44 
 
 		 407 aa  218  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.816814  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2039  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.68 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0902  mannose-6-phosphate isomerase, class I  41.03 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.942803  normal  0.0915708 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2647  mannose-6-phosphate isomerase  33.41 
 
 		 399 aa  207  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2098  mannose-6-phosphate isomerase  35.7 
 
 		 398 aa  207  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.302925 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2340  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.25 
 
 		 390 aa  207  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0965  mannose-6-phosphate isomerase, class I  40.33 
 
 		 387 aa  207  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.857697  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1986  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.66 
 
 		 359 aa  197  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4035  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.27 
 
 		 408 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0762844  normal  0.148973 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4238  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.94 
 
 		 1553 aa  178  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0410  mannose-6-phosphate isomerase, class I  28.57 
 
 		 372 aa  175  1.9999999999999998e-42  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0748  mannose-6-phosphate isomerase  34.92 
 
 		 433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5861  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.26 
 
 		 429 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000549194  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1613  mannose-6-phosphate isomerase (phosphomannose isomerase)  32.3 
 
 		 368 aa  170  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.194468  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0605  mannose-6-phosphate isomerase  30.47 
 
 		 401 aa  170  6e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72090  mannose-6-phosphate isomerase  28.11 
 
 		 439 aa  132  7.999999999999999e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.800208 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3605  predicted protein  28.77 
 
 		 407 aa  124  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00667  Mannose-6-phosphate isomerase (EC 5.3.1.8)(Phosphomannose isomerase)(PMI)(Phosphohexomutase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P29951]  28.4 
 
 		 461 aa  125  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.354212 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02370  mannose-6-phosphate isomerase  27.79 
 
 		 434 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.943759  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44264  mannose-6-phosphate isomerase, type  27.32 
 
 		 527 aa  119  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.167153  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01715  mannose-6-phosphate isomerase, class I (AFU_orthologue; AFUA_4G08410)  30.63 
 
 		 404 aa  89.7  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.299956  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01750  mannose-6-phosphate isomerase, putative  31.43 
 
 		 456 aa  75.5  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.673433  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1391  mannose-6-phosphate isomerase, class I  25.51 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1205  mannose-6-phosphate isomerase, class I  25.51 
 
 		 325 aa  62.8  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140202  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0309  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.41 
 
 		 326 aa  47  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0321  mannose-6-phosphate isomerase  30.86 
 
 		 316 aa  45.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000805309  hitchhiker  0.00737279 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0266  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.06 
 
 		 322 aa  43.5  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1319  mannose-6-phosphate isomerase, class I  22.98 
 
 		 318 aa  43.1  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0119683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>