80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0748 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0748  mannose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 433 aa  822    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5861  mannose-6-phosphate isomerase, class I  64.83 
 
 		 429 aa  465  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000549194  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2253  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.62 
 
 		 419 aa  232  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0483386  normal  0.187903 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6006  mannose-6-phosphate isomerase class I  38.94 
 
 		 402 aa  228  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000013531  normal  0.0800927 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000088  mannose-6-phosphate isomerase  35.02 
 
 		 411 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02540  mannose-6-phosphate isomerase, class I  40.69 
 
 		 400 aa  224  3e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6324  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.5 
 
 		 407 aa  219  6e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.199717  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0895  mannose-6-phosphate isomerase  31.02 
 
 		 405 aa  219  6e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0693206  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0860  mannose-6-phosphate isomerase, class I  42.56 
 
 		 395 aa  216  5.9999999999999996e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2543  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.82 
 
 		 412 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2387  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.43 
 
 		 396 aa  212  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.318931  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4165  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.72 
 
 		 406 aa  211  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.292455  normal  0.858964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1366  mannose-6-phosphate isomerase  39.46 
 
 		 409 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.837438 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3297  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.7 
 
 		 416 aa  207  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1116  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.82 
 
 		 394 aa  207  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0922592 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1347  mannose-6-phosphate isomerase  38.48 
 
 		 409 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.46629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1330  mannose-6-phosphate isomerase  38.48 
 
 		 409 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37283  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2248  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.1 
 
 		 400 aa  206  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000163868 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4724  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.29 
 
 		 408 aa  206  9e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal  0.477393 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30820  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.78 
 
 		 415 aa  206  9e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2015  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.32 
 
 		 401 aa  206  9e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000590051  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1739  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.45 
 
 		 408 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2647  mannose-6-phosphate isomerase  32.88 
 
 		 399 aa  204  3e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001304  mannose-6-phosphate isomerase  33.18 
 
 		 410 aa  202  8e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.604165  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1172  mannose-6-phosphate isomerase, class I  41.84 
 
 		 399 aa  202  9e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0791265  normal  0.965156 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1189  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.41 
 
 		 407 aa  201  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.816814  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00704  phosphomannose isomerase  31.89 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4202  mannose-6-phosphate isomerase  39.33 
 
 		 412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3870  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.53 
 
 		 402 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0760248  decreased coverage  0.0014351 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05183  mannose-6-phosphate isomerase  32.48 
 
 		 410 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30990  mannose-6-phosphate isomerase  36.1 
 
 		 411 aa  198  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13284  mannose-6-phosphate isomerase manA  36.76 
 
 		 408 aa  197  3e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.34249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0902  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.81 
 
 		 387 aa  195  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.942803  normal  0.0915708 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0016  mannose-6-phosphate isomerase  37.67 
 
 		 423 aa  193  5e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.976239  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0965  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.91 
 
 		 387 aa  192  7e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.857697  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2277  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.95 
 
 		 392 aa  186  6e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.106024 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1902  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.48 
 
 		 394 aa  186  8e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.706948  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4035  mannose-6-phosphate isomerase, class I  31.24 
 
 		 408 aa  186  9e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0762844  normal  0.148973 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0605  mannose-6-phosphate isomerase  30.63 
 
 		 401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4995  Mannose-6-phosphate isomerase  38.28 
 
 		 396 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.549808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1186  mannose-6-phosphate isomerase  40 
 
 		 416 aa  184  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.215297  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1707  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.33 
 
 		 391 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.104692  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2340  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.08 
 
 		 390 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4295  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.29 
 
 		 391 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1566  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.1 
 
 		 391 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.368763  normal  0.0569701 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2269  mannose-6-phosphate isomerase  32.18 
 
 		 391 aa  181  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1422  mannose-6-phosphate isomerase  30.05 
 
 		 388 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2039  mannose-6-phosphate isomerase, class I  31.15 
 
 		 390 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2138  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.33 
 
 		 394 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.952255  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1874  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.18 
 
 		 391 aa  180  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0430449  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1876  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.33 
 
 		 391 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1635  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.33 
 
 		 391 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1576  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.33 
 
 		 391 aa  180  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.714022  normal  0.668804 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1830  mannose-6-phosphate isomerase  31.7 
 
 		 391 aa  179  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00725153 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01572  hypothetical protein  29.91 
 
 		 391 aa  178  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01582  mannose-6-phosphate isomerase  29.91 
 
 		 391 aa  178  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2323  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.14 
 
 		 391 aa  178  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.734399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1688  mannose-6-phosphate isomerase  30.61 
 
 		 391 aa  178  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1799  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.61 
 
 		 391 aa  178  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1586  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.54 
 
 		 391 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.762503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2017  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.61 
 
 		 391 aa  178  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2030  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.61 
 
 		 391 aa  177  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0478981  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1993  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.28 
 
 		 421 aa  175  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1821  mannose-6-phosphate isomerase  30.37 
 
 		 391 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.280304  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4238  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.15 
 
 		 1553 aa  173  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05210  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.35 
 
 		 414 aa  169  8e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.117407  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2098  mannose-6-phosphate isomerase  34.64 
 
 		 398 aa  168  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.302925 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0410  mannose-6-phosphate isomerase, class I  27.53 
 
 		 372 aa  163  7e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3511  mannose-6-phosphate isomerase  38.24 
 
 		 369 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1986  mannose-6-phosphate isomerase, class I  31.76 
 
 		 359 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1613  mannose-6-phosphate isomerase (phosphomannose isomerase)  30.17 
 
 		 368 aa  160  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.194468  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44264  mannose-6-phosphate isomerase, type  32.61 
 
 		 527 aa  137  5e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.167153  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72090  mannose-6-phosphate isomerase  28.66 
 
 		 439 aa  137  5e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.800208 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00667  Mannose-6-phosphate isomerase (EC 5.3.1.8)(Phosphomannose isomerase)(PMI)(Phosphohexomutase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P29951]  34.98 
 
 		 461 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.354212 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3605  predicted protein  30.28 
 
 		 407 aa  124  4e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02370  mannose-6-phosphate isomerase  27.76 
 
 		 434 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.943759  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01715  mannose-6-phosphate isomerase, class I (AFU_orthologue; AFUA_4G08410)  29.64 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.299956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1257  mannose-6-phosphate isomerase, class I  57.32 
 
 		 425 aa  101  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000844984 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01750  mannose-6-phosphate isomerase, putative  23.8 
 
 		 456 aa  70.1  0.00000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.673433  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1535  mannose-6-phosphate isomerase, type I  29.79 
 
 		 262 aa  47.4  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.480559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>