91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001304 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05183  mannose-6-phosphate isomerase  92.2 
 
 		 410 aa  785    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001304  mannose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 410 aa  843    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.604165  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1422  mannose-6-phosphate isomerase  68.48 
 
 		 388 aa  549  1e-155  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2647  mannose-6-phosphate isomerase  63.68 
 
 		 399 aa  498  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0895  mannose-6-phosphate isomerase  61.15 
 
 		 405 aa  492  9.999999999999999e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0693206  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000088  mannose-6-phosphate isomerase  60.2 
 
 		 411 aa  487  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00704  phosphomannose isomerase  59.4 
 
 		 405 aa  473  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1566  mannose-6-phosphate isomerase, class I  49.1 
 
 		 391 aa  356  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.368763  normal  0.0569701 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1707  mannose-6-phosphate isomerase, class I  48.84 
 
 		 391 aa  355  7.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.104692  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1635  mannose-6-phosphate isomerase, class I  48.84 
 
 		 391 aa  355  8.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1876  mannose-6-phosphate isomerase, class I  48.84 
 
 		 391 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1576  mannose-6-phosphate isomerase, class I  48.84 
 
 		 391 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.714022  normal  0.668804 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2323  mannose-6-phosphate isomerase, class I  47.55 
 
 		 391 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.734399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1688  mannose-6-phosphate isomerase  47.55 
 
 		 391 aa  353  4e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1799  mannose-6-phosphate isomerase, class I  47.55 
 
 		 391 aa  353  4e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2017  mannose-6-phosphate isomerase, class I  47.55 
 
 		 391 aa  353  4e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01582  mannose-6-phosphate isomerase  47.55 
 
 		 391 aa  352  5e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2039  mannose-6-phosphate isomerase, class I  49.74 
 
 		 390 aa  352  5e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01572  hypothetical protein  47.55 
 
 		 391 aa  352  5e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2030  mannose-6-phosphate isomerase, class I  47.55 
 
 		 391 aa  352  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0478981  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1586  mannose-6-phosphate isomerase, class I  47.29 
 
 		 391 aa  351  1e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.762503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2277  mannose-6-phosphate isomerase, class I  48.98 
 
 		 392 aa  351  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.106024 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1830  mannose-6-phosphate isomerase  48.33 
 
 		 391 aa  350  4e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00725153 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1821  mannose-6-phosphate isomerase  47.29 
 
 		 391 aa  348  1e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.280304  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1902  mannose-6-phosphate isomerase, class I  47.58 
 
 		 394 aa  347  2e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.706948  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2340  mannose-6-phosphate isomerase, class I  48.59 
 
 		 390 aa  342  9e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1874  mannose-6-phosphate isomerase, class I  48.47 
 
 		 391 aa  340  2.9999999999999998e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0430449  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2269  mannose-6-phosphate isomerase  47.57 
 
 		 391 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2138  mannose-6-phosphate isomerase, class I  47.7 
 
 		 394 aa  325  8.000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.952255  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1986  mannose-6-phosphate isomerase, class I  47.24 
 
 		 359 aa  296  5e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2015  mannose-6-phosphate isomerase, class I  41.88 
 
 		 401 aa  289  6e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000590051  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2253  mannose-6-phosphate isomerase, class I  40.85 
 
 		 419 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0483386  normal  0.187903 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4724  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.99 
 
 		 408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal  0.477393 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6324  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.28 
 
 		 407 aa  252  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.199717  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4165  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.24 
 
 		 406 aa  249  5e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.292455  normal  0.858964 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0016  mannose-6-phosphate isomerase  38.46 
 
 		 423 aa  247  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.976239  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1366  mannose-6-phosphate isomerase  39.29 
 
 		 409 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.837438 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1347  mannose-6-phosphate isomerase  37.37 
 
 		 409 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.46629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1330  mannose-6-phosphate isomerase  37.37 
 
 		 409 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37283  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30820  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.77 
 
 		 415 aa  245  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1739  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.11 
 
 		 408 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2543  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.32 
 
 		 412 aa  241  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30990  mannose-6-phosphate isomerase  39.43 
 
 		 411 aa  240  2.9999999999999997e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1186  mannose-6-phosphate isomerase  39.15 
 
 		 416 aa  238  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.215297  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02540  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.64 
 
 		 400 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1993  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.21 
 
 		 421 aa  234  3e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3297  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.62 
 
 		 416 aa  232  8.000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6006  mannose-6-phosphate isomerase class I  36.39 
 
 		 402 aa  231  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000013531  normal  0.0800927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2248  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.68 
 
 		 400 aa  232  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000163868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4035  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.6 
 
 		 408 aa  229  5e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0762844  normal  0.148973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0902  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.94 
 
 		 387 aa  229  7e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.942803  normal  0.0915708 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3511  mannose-6-phosphate isomerase  36.65 
 
 		 369 aa  228  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2387  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.71 
 
 		 396 aa  227  3e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.318931  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1116  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.75 
 
 		 394 aa  226  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0922592 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13284  mannose-6-phosphate isomerase manA  38.3 
 
 		 408 aa  226  6e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.34249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0965  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.15 
 
 		 387 aa  225  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.857697  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2098  mannose-6-phosphate isomerase  36.57 
 
 		 398 aa  224  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.302925 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4295  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.01 
 
 		 391 aa  223  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0860  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.83 
 
 		 395 aa  222  8e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4202  mannose-6-phosphate isomerase  35.89 
 
 		 412 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4995  Mannose-6-phosphate isomerase  34.85 
 
 		 396 aa  219  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.549808  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1189  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.49 
 
 		 407 aa  216  4e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.816814  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1257  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.53 
 
 		 425 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000844984 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1172  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.9 
 
 		 399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0791265  normal  0.965156 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3870  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.19 
 
 		 402 aa  210  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0760248  decreased coverage  0.0014351 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1613  mannose-6-phosphate isomerase (phosphomannose isomerase)  37.79 
 
 		 368 aa  211  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.194468  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4238  mannose-6-phosphate isomerase, class I  40.12 
 
 		 1553 aa  203  5e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0748  mannose-6-phosphate isomerase  33.18 
 
 		 433 aa  202  9e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5861  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.55 
 
 		 429 aa  200  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000549194  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0605  mannose-6-phosphate isomerase  33.76 
 
 		 401 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05210  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.41 
 
 		 414 aa  189  9e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.117407  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0410  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.38 
 
 		 372 aa  188  2e-46  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72090  mannose-6-phosphate isomerase  35.95 
 
 		 439 aa  177  4e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.800208 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3605  predicted protein  32.96 
 
 		 407 aa  172  6.999999999999999e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00667  Mannose-6-phosphate isomerase (EC 5.3.1.8)(Phosphomannose isomerase)(PMI)(Phosphohexomutase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P29951]  34.45 
 
 		 461 aa  171  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.354212 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02370  mannose-6-phosphate isomerase  34.66 
 
 		 434 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.943759  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44264  mannose-6-phosphate isomerase, type  34.09 
 
 		 527 aa  145  9e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.167153  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01715  mannose-6-phosphate isomerase, class I (AFU_orthologue; AFUA_4G08410)  32.83 
 
 		 404 aa  97.4  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.299956  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01750  mannose-6-phosphate isomerase, putative  28.27 
 
 		 456 aa  95.1  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.673433  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2149  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.74 
 
 		 329 aa  48.5  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0458  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.54 
 
 		 320 aa  45.8  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0314  mannose-6-phosphate isomerase, class I  29.1 
 
 		 336 aa  45.4  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000281347  normal  0.468377 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2261  mannose-6-phosphate isomerase, class I  25.85 
 
 		 316 aa  45.8  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  29.13 
 
 		 349 aa  44.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0511343  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0193  mannose-6-phosphate isomerase, type I  28.57 
 
 		 278 aa  44.3  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0475  phosphomannose isomerase type I  30.26 
 
 		 309 aa  43.5  0.007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.282321  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0468  mannose-6-phosphate isomerase, class I  22.51 
 
 		 336 aa  43.5  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0191  mannose-6-phosphate isomerase type I  28.28 
 
 		 278 aa  43.5  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3528  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.28 
 
 		 320 aa  43.1  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0819  mannose-6-phosphate isomerase  32.5 
 
 		 315 aa  43.1  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1806  mannose-6-phosphate isomerase, class I  31.07 
 
 		 319 aa  43.1  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>