91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1422 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1422  mannose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 388 aa  797    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05183  mannose-6-phosphate isomerase  68.73 
 
 		 410 aa  556  1e-157  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001304  mannose-6-phosphate isomerase  68.48 
 
 		 410 aa  549  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.604165  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0895  mannose-6-phosphate isomerase  59.02 
 
 		 405 aa  472  1e-132  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0693206  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00704  phosphomannose isomerase  58.08 
 
 		 405 aa  460  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000088  mannose-6-phosphate isomerase  55.89 
 
 		 411 aa  455  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2647  mannose-6-phosphate isomerase  58.76 
 
 		 399 aa  451  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2323  mannose-6-phosphate isomerase, class I  48.46 
 
 		 391 aa  355  8.999999999999999e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.734399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2017  mannose-6-phosphate isomerase, class I  48.46 
 
 		 391 aa  353  2e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1799  mannose-6-phosphate isomerase, class I  48.46 
 
 		 391 aa  353  2e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2039  mannose-6-phosphate isomerase, class I  50.26 
 
 		 390 aa  353  2e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1688  mannose-6-phosphate isomerase  48.46 
 
 		 391 aa  353  2e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2030  mannose-6-phosphate isomerase, class I  48.46 
 
 		 391 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0478981  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1566  mannose-6-phosphate isomerase, class I  49.62 
 
 		 391 aa  351  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.368763  normal  0.0569701 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01572  hypothetical protein  48.21 
 
 		 391 aa  351  1e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01582  mannose-6-phosphate isomerase  48.21 
 
 		 391 aa  351  1e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1586  mannose-6-phosphate isomerase, class I  48.21 
 
 		 391 aa  351  1e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.762503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1707  mannose-6-phosphate isomerase, class I  49.37 
 
 		 391 aa  351  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.104692  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1635  mannose-6-phosphate isomerase, class I  49.87 
 
 		 391 aa  349  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1876  mannose-6-phosphate isomerase, class I  49.37 
 
 		 391 aa  349  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1821  mannose-6-phosphate isomerase  48.21 
 
 		 391 aa  349  6e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.280304  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1576  mannose-6-phosphate isomerase, class I  49.37 
 
 		 391 aa  348  7e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.714022  normal  0.668804 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2340  mannose-6-phosphate isomerase, class I  48.84 
 
 		 390 aa  347  3e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1830  mannose-6-phosphate isomerase  48.36 
 
 		 391 aa  346  3e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00725153 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1874  mannose-6-phosphate isomerase, class I  47.95 
 
 		 391 aa  334  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0430449  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2269  mannose-6-phosphate isomerase  47.83 
 
 		 391 aa  334  2e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1902  mannose-6-phosphate isomerase, class I  46.41 
 
 		 394 aa  333  4e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.706948  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2277  mannose-6-phosphate isomerase, class I  45.82 
 
 		 392 aa  332  8e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.106024 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2138  mannose-6-phosphate isomerase, class I  47.81 
 
 		 394 aa  322  9.000000000000001e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.952255  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1986  mannose-6-phosphate isomerase, class I  47.92 
 
 		 359 aa  302  5.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2015  mannose-6-phosphate isomerase, class I  43.43 
 
 		 401 aa  296  3e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000590051  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2253  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39 
 
 		 419 aa  263  4e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0483386  normal  0.187903 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6324  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.68 
 
 		 407 aa  260  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.199717  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02540  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.89 
 
 		 400 aa  251  1e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4165  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.47 
 
 		 406 aa  247  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.292455  normal  0.858964 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4724  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.02 
 
 		 408 aa  243  6e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal  0.477393 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30820  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.31 
 
 		 415 aa  241  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1993  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.04 
 
 		 421 aa  240  2.9999999999999997e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1330  mannose-6-phosphate isomerase  38.67 
 
 		 409 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37283  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1347  mannose-6-phosphate isomerase  38.67 
 
 		 409 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.46629 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3511  mannose-6-phosphate isomerase  35.43 
 
 		 369 aa  236  4e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1739  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.93 
 
 		 408 aa  236  7e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1186  mannose-6-phosphate isomerase  38.66 
 
 		 416 aa  235  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.215297  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1366  mannose-6-phosphate isomerase  38.37 
 
 		 409 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.837438 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1116  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.76 
 
 		 394 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0922592 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0902  mannose-6-phosphate isomerase, class I  40.4 
 
 		 387 aa  232  7.000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.942803  normal  0.0915708 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3297  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.96 
 
 		 416 aa  230  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6006  mannose-6-phosphate isomerase class I  35.71 
 
 		 402 aa  229  7e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000013531  normal  0.0800927 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0860  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.77 
 
 		 395 aa  228  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4035  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.57 
 
 		 408 aa  228  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0762844  normal  0.148973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2248  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.53 
 
 		 400 aa  227  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000163868 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2387  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.32 
 
 		 396 aa  226  6e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.318931  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4202  mannose-6-phosphate isomerase  34.89 
 
 		 412 aa  225  8e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30990  mannose-6-phosphate isomerase  35.28 
 
 		 411 aa  225  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0016  mannose-6-phosphate isomerase  36.69 
 
 		 423 aa  223  4e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.976239  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4995  Mannose-6-phosphate isomerase  35.99 
 
 		 396 aa  222  8e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.549808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0965  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.18 
 
 		 387 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.857697  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2543  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.16 
 
 		 412 aa  220  3e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2098  mannose-6-phosphate isomerase  35.4 
 
 		 398 aa  220  3e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.302925 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3870  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.34 
 
 		 402 aa  219  8.999999999999998e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0760248  decreased coverage  0.0014351 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1172  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.6 
 
 		 399 aa  218  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0791265  normal  0.965156 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4295  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.51 
 
 		 391 aa  217  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13284  mannose-6-phosphate isomerase manA  35.99 
 
 		 408 aa  216  4e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.34249 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1189  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.12 
 
 		 407 aa  214  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.816814  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1613  mannose-6-phosphate isomerase (phosphomannose isomerase)  37.02 
 
 		 368 aa  213  4.9999999999999996e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.194468  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1257  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.88 
 
 		 425 aa  208  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000844984 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0605  mannose-6-phosphate isomerase  33.94 
 
 		 401 aa  204  2e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0410  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.63 
 
 		 372 aa  202  9.999999999999999e-51  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5861  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.33 
 
 		 429 aa  189  8e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000549194  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4238  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.02 
 
 		 1553 aa  187  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05210  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.32 
 
 		 414 aa  185  9e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.117407  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0748  mannose-6-phosphate isomerase  30.05 
 
 		 433 aa  179  5.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72090  mannose-6-phosphate isomerase  35.19 
 
 		 439 aa  175  9.999999999999999e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.800208 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02370  mannose-6-phosphate isomerase  31.22 
 
 		 434 aa  172  1e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.943759  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00667  Mannose-6-phosphate isomerase (EC 5.3.1.8)(Phosphomannose isomerase)(PMI)(Phosphohexomutase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P29951]  36.66 
 
 		 461 aa  171  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.354212 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3605  predicted protein  32.07 
 
 		 407 aa  169  7e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44264  mannose-6-phosphate isomerase, type  36.54 
 
 		 527 aa  154  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.167153  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01715  mannose-6-phosphate isomerase, class I (AFU_orthologue; AFUA_4G08410)  30.63 
 
 		 404 aa  113  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.299956  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01750  mannose-6-phosphate isomerase, putative  28.62 
 
 		 456 aa  91.3  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.673433  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2149  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.62 
 
 		 329 aa  53.1  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1769  phosphomannose isomerase  37.74 
 
 		 319 aa  52.4  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21530  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.11 
 
 		 353 aa  51.2  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.17 
 
 		 312 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2217  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.17 
 
 		 312 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.735941  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0266  mannose-6-phosphate isomerase, class I  29.55 
 
 		 322 aa  47.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0458  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.38 
 
 		 320 aa  47.4  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.64 
 
 		 349 aa  47.4  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0511343  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0249  phosphomannose isomerase  36.79 
 
 		 322 aa  46.2  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.289498  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0468  mannose-6-phosphate isomerase, class I  24.22 
 
 		 336 aa  44.3  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1708  mannose-6-phosphate isomerase  33.91 
 
 		 315 aa  43.9  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.657704  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3117  mannose-6-phosphate isomerase, class I  31.96 
 
 		 314 aa  42.7  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0284496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>