100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2030 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B1707  mannose-6-phosphate isomerase, class I  86.45 
 
 
391 aa  699    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.104692  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1876  mannose-6-phosphate isomerase, class I  86.45 
 
 
391 aa  697    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1821  mannose-6-phosphate isomerase  99.74 
 
 
391 aa  796    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.280304  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1688  mannose-6-phosphate isomerase  99.49 
 
 
391 aa  795    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2323  mannose-6-phosphate isomerase, class I  99.49 
 
 
391 aa  796    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.734399  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1830  mannose-6-phosphate isomerase  84.4 
 
 
391 aa  687    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00725153 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2017  mannose-6-phosphate isomerase, class I  99.49 
 
 
391 aa  795    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1586  mannose-6-phosphate isomerase, class I  98.72 
 
 
391 aa  789    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.762503  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01572  hypothetical protein  99.74 
 
 
391 aa  797    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1635  mannose-6-phosphate isomerase, class I  85.93 
 
 
391 aa  695    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1566  mannose-6-phosphate isomerase, class I  86.19 
 
 
391 aa  698    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.368763  normal  0.0569701 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01582  mannose-6-phosphate isomerase  99.74 
 
 
391 aa  797    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2030  mannose-6-phosphate isomerase, class I  100 
 
 
391 aa  800    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0478981  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1576  mannose-6-phosphate isomerase, class I  86.45 
 
 
391 aa  697    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.714022  normal  0.668804 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1799  mannose-6-phosphate isomerase, class I  99.49 
 
 
391 aa  795    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2277  mannose-6-phosphate isomerase, class I  74.68 
 
 
392 aa  598  1e-170  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.106024 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2039  mannose-6-phosphate isomerase, class I  71.79 
 
 
390 aa  595  1e-169  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2340  mannose-6-phosphate isomerase, class I  71.03 
 
 
390 aa  580  1e-164  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2138  mannose-6-phosphate isomerase, class I  71.28 
 
 
394 aa  566  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.952255  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1874  mannose-6-phosphate isomerase, class I  70.84 
 
 
391 aa  565  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0430449  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2269  mannose-6-phosphate isomerase  70.59 
 
 
391 aa  563  1.0000000000000001e-159  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1902  mannose-6-phosphate isomerase, class I  68.46 
 
 
394 aa  550  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.706948  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1986  mannose-6-phosphate isomerase, class I  71.59 
 
 
359 aa  522  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1422  mannose-6-phosphate isomerase  48.46 
 
 
388 aa  353  2.9999999999999997e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001304  mannose-6-phosphate isomerase  47.55 
 
 
410 aa  352  5.9999999999999994e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.604165  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05183  mannose-6-phosphate isomerase  47.29 
 
 
410 aa  349  5e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000088  mannose-6-phosphate isomerase  43.89 
 
 
411 aa  341  1e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00704  phosphomannose isomerase  46.87 
 
 
405 aa  340  2.9999999999999998e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0895  mannose-6-phosphate isomerase  45.9 
 
 
405 aa  339  5e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0693206  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2647  mannose-6-phosphate isomerase  46.65 
 
 
399 aa  337  1.9999999999999998e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2015  mannose-6-phosphate isomerase, class I  40.69 
 
 
401 aa  270  5e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000590051  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4724  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.34 
 
 
408 aa  268  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal  0.477393 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6324  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.45 
 
 
407 aa  260  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.199717  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1739  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.07 
 
 
408 aa  261  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13284  mannose-6-phosphate isomerase manA  37.78 
 
 
408 aa  258  1e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34249 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2543  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.81 
 
 
412 aa  253  3e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1330  mannose-6-phosphate isomerase  37.91 
 
 
409 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37283  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1347  mannose-6-phosphate isomerase  37.91 
 
 
409 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.46629 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1186  mannose-6-phosphate isomerase  40.75 
 
 
416 aa  251  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.215297  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4165  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.92 
 
 
406 aa  249  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.292455  normal  0.858964 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1993  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.92 
 
 
421 aa  249  4e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30820  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.56 
 
 
415 aa  248  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2387  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.04 
 
 
396 aa  248  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.318931  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4202  mannose-6-phosphate isomerase  36.41 
 
 
412 aa  247  3e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1189  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.59 
 
 
407 aa  246  6.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.816814  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1366  mannose-6-phosphate isomerase  37.15 
 
 
409 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.837438 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0016  mannose-6-phosphate isomerase  40.86 
 
 
423 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.976239  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3297  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.89 
 
 
416 aa  241  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30990  mannose-6-phosphate isomerase  37.38 
 
 
411 aa  241  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2253  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.89 
 
 
419 aa  240  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0483386  normal  0.187903 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0860  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.09 
 
 
395 aa  238  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1116  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.8 
 
 
394 aa  237  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0922592 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1257  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.94 
 
 
425 aa  232  9e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000844984 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6006  mannose-6-phosphate isomerase class I  36.09 
 
 
402 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000013531  normal  0.0800927 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4035  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.17 
 
 
408 aa  226  8e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0762844  normal  0.148973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2248  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.66 
 
 
400 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4995  Mannose-6-phosphate isomerase  36.73 
 
 
396 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.549808  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3870  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.44 
 
 
402 aa  223  4e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0760248  decreased coverage  0.0014351 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02540  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.24 
 
 
400 aa  223  4.9999999999999996e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4295  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.16 
 
 
391 aa  220  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05210  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.58 
 
 
414 aa  217  2.9999999999999998e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.117407  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0965  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.69 
 
 
387 aa  216  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.857697  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3511  mannose-6-phosphate isomerase  35.75 
 
 
369 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0902  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.76 
 
 
387 aa  212  9e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.942803  normal  0.0915708 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0605  mannose-6-phosphate isomerase  35.58 
 
 
401 aa  212  1e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1172  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.56 
 
 
399 aa  208  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0791265  normal  0.965156 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2098  mannose-6-phosphate isomerase  35.57 
 
 
398 aa  207  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.302925 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1613  mannose-6-phosphate isomerase (phosphomannose isomerase)  36.34 
 
 
368 aa  204  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.194468  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5861  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.57 
 
 
429 aa  192  6e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000549194  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4238  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.58 
 
 
1553 aa  189  8e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0748  mannose-6-phosphate isomerase  30.77 
 
 
433 aa  178  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0410  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.63 
 
 
372 aa  177  2e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72090  mannose-6-phosphate isomerase  33.01 
 
 
439 aa  165  1.0000000000000001e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.800208 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02370  mannose-6-phosphate isomerase  32.33 
 
 
434 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.943759  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00667  Mannose-6-phosphate isomerase (EC 5.3.1.8)(Phosphomannose isomerase)(PMI)(Phosphohexomutase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P29951]  32.03 
 
 
461 aa  161  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.354212 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44264  mannose-6-phosphate isomerase, type  31.54 
 
 
527 aa  155  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.167153  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3605  predicted protein  28.3 
 
 
407 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01715  mannose-6-phosphate isomerase, class I (AFU_orthologue; AFUA_4G08410)  31.45 
 
 
404 aa  107  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.299956  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01750  mannose-6-phosphate isomerase, putative  29.97 
 
 
456 aa  106  8e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.673433  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1806  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.95 
 
 
319 aa  55.8  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1171  mannose-6-phosphate isomerase, class I  42.22 
 
 
314 aa  51.6  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1688  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.19 
 
 
315 aa  49.3  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.745586  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0458  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.62 
 
 
320 aa  48.9  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0314  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.11 
 
 
336 aa  48.1  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000281347  normal  0.468377 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2149  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.96 
 
 
329 aa  48.9  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0266  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.25 
 
 
322 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1327  Mannose-6-phosphate isomerase  32.71 
 
 
319 aa  48.1  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21530  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.07 
 
 
353 aa  47.4  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12883  putative mannose-6-phosphate isomerase  31.09 
 
 
325 aa  47  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  31.62 
 
 
349 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0511343  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0885  mannose-6-phosphate isomerase  39.34 
 
 
326 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365127  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1708  mannose-6-phosphate isomerase  35.29 
 
 
315 aa  45.1  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.657704  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1319  mannose-6-phosphate isomerase, class I  28.16 
 
 
318 aa  45.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0119683  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3528  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.94 
 
 
320 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1081  mannose-6-phosphate isomerase  29.73 
 
 
369 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3397  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.64 
 
 
318 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2261  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.91 
 
 
316 aa  44.3  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1205  mannose-6-phosphate isomerase, class I  22.64 
 
 
325 aa  43.5  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140202  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1391  mannose-6-phosphate isomerase, class I  22.64 
 
 
325 aa  43.5  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3117  mannose-6-phosphate isomerase, class I  29.67 
 
 
314 aa  43.1  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0284496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>