83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13284 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13284  mannose-6-phosphate isomerase manA  100 
 
 		 408 aa  808    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.34249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1739  mannose-6-phosphate isomerase, class I  72.3 
 
 		 408 aa  604  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4724  mannose-6-phosphate isomerase, class I  73.77 
 
 		 408 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal  0.477393 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1366  mannose-6-phosphate isomerase  73.84 
 
 		 409 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.837438 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1347  mannose-6-phosphate isomerase  74.08 
 
 		 409 aa  601  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.46629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1330  mannose-6-phosphate isomerase  74.08 
 
 		 409 aa  601  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37283  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1189  mannose-6-phosphate isomerase, class I  59.31 
 
 		 407 aa  447  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.816814  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6324  mannose-6-phosphate isomerase, class I  58.6 
 
 		 407 aa  425  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.199717  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3297  mannose-6-phosphate isomerase, class I  55.12 
 
 		 416 aa  415  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30990  mannose-6-phosphate isomerase  53.48 
 
 		 411 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4165  mannose-6-phosphate isomerase, class I  53.22 
 
 		 406 aa  362  4e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.292455  normal  0.858964 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6006  mannose-6-phosphate isomerase class I  48.45 
 
 		 402 aa  321  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000013531  normal  0.0800927 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2253  mannose-6-phosphate isomerase, class I  47.93 
 
 		 419 aa  317  3e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0483386  normal  0.187903 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2015  mannose-6-phosphate isomerase, class I  42.2 
 
 		 401 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000590051  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4295  mannose-6-phosphate isomerase, class I  45.34 
 
 		 391 aa  280  4e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1257  mannose-6-phosphate isomerase, class I  44.5 
 
 		 425 aa  278  1e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000844984 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1116  mannose-6-phosphate isomerase, class I  43.99 
 
 		 394 aa  276  4e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0922592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4995  Mannose-6-phosphate isomerase  47.41 
 
 		 396 aa  276  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.549808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0965  mannose-6-phosphate isomerase, class I  45.93 
 
 		 387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.857697  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1186  mannose-6-phosphate isomerase  43.14 
 
 		 416 aa  273  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.215297  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4202  mannose-6-phosphate isomerase  42.93 
 
 		 412 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0902  mannose-6-phosphate isomerase, class I  47.11 
 
 		 387 aa  268  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.942803  normal  0.0915708 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30820  mannose-6-phosphate isomerase, class I  42.54 
 
 		 415 aa  265  8e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2248  mannose-6-phosphate isomerase, class I  42.54 
 
 		 400 aa  263  6e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000163868 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2543  mannose-6-phosphate isomerase, class I  41.46 
 
 		 412 aa  262  1e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1566  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.29 
 
 		 391 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.368763  normal  0.0569701 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1707  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.05 
 
 		 391 aa  259  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.104692  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0860  mannose-6-phosphate isomerase, class I  42.13 
 
 		 395 aa  259  8e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2323  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.78 
 
 		 391 aa  259  8e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.734399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1876  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.29 
 
 		 391 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1586  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.78 
 
 		 391 aa  258  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.762503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1635  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.05 
 
 		 391 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1576  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.04 
 
 		 391 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.714022  normal  0.668804 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2030  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.78 
 
 		 391 aa  258  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0478981  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01582  mannose-6-phosphate isomerase  37.78 
 
 		 391 aa  258  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01572  hypothetical protein  37.78 
 
 		 391 aa  258  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2269  mannose-6-phosphate isomerase  37.41 
 
 		 391 aa  257  2e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1799  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.53 
 
 		 391 aa  256  5e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2017  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.53 
 
 		 391 aa  256  5e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1688  mannose-6-phosphate isomerase  37.53 
 
 		 391 aa  256  5e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1830  mannose-6-phosphate isomerase  38.02 
 
 		 391 aa  256  7e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00725153 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1874  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.19 
 
 		 391 aa  256  7e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0430449  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02540  mannose-6-phosphate isomerase, class I  41.79 
 
 		 400 aa  256  7e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1172  mannose-6-phosphate isomerase, class I  44.86 
 
 		 399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0791265  normal  0.965156 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1821  mannose-6-phosphate isomerase  37.53 
 
 		 391 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.280304  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2387  mannose-6-phosphate isomerase, class I  41.75 
 
 		 396 aa  253  6e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.318931  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2039  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.01 
 
 		 390 aa  251  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0016  mannose-6-phosphate isomerase  42.3 
 
 		 423 aa  250  3e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.976239  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000088  mannose-6-phosphate isomerase  36.1 
 
 		 411 aa  249  5e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2138  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.08 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.952255  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1902  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.59 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.706948  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2277  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.25 
 
 		 392 aa  247  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.106024 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2340  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.27 
 
 		 390 aa  241  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1993  mannose-6-phosphate isomerase, class I  41.22 
 
 		 421 aa  239  5e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3511  mannose-6-phosphate isomerase  41.92 
 
 		 369 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3870  mannose-6-phosphate isomerase, class I  42.33 
 
 		 402 aa  238  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0760248  decreased coverage  0.0014351 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05210  mannose-6-phosphate isomerase, class I  41 
 
 		 414 aa  236  4e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.117407  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1986  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.33 
 
 		 359 aa  233  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00704  phosphomannose isomerase  35.79 
 
 		 405 aa  231  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2098  mannose-6-phosphate isomerase  40.1 
 
 		 398 aa  228  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.302925 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0895  mannose-6-phosphate isomerase  33.42 
 
 		 405 aa  228  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0693206  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001304  mannose-6-phosphate isomerase  38.3 
 
 		 410 aa  226  6e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.604165  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05183  mannose-6-phosphate isomerase  37.69 
 
 		 410 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2647  mannose-6-phosphate isomerase  33.67 
 
 		 399 aa  218  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1422  mannose-6-phosphate isomerase  35.99 
 
 		 388 aa  216  4e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4035  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.49 
 
 		 408 aa  209  7e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0762844  normal  0.148973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5861  mannose-6-phosphate isomerase, class I  40.63 
 
 		 429 aa  206  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000549194  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0605  mannose-6-phosphate isomerase  32.48 
 
 		 401 aa  200  3.9999999999999996e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0748  mannose-6-phosphate isomerase  36.76 
 
 		 433 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4238  mannose-6-phosphate isomerase, class I  41.54 
 
 		 1553 aa  191  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1613  mannose-6-phosphate isomerase (phosphomannose isomerase)  35.06 
 
 		 368 aa  174  3.9999999999999995e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.194468  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0410  mannose-6-phosphate isomerase, class I  27.86 
 
 		 372 aa  160  5e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00667  Mannose-6-phosphate isomerase (EC 5.3.1.8)(Phosphomannose isomerase)(PMI)(Phosphohexomutase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P29951]  28.93 
 
 		 461 aa  157  3e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.354212 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3605  predicted protein  34.44 
 
 		 407 aa  152  1e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44264  mannose-6-phosphate isomerase, type  32.24 
 
 		 527 aa  152  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.167153  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02370  mannose-6-phosphate isomerase  31.17 
 
 		 434 aa  144  3e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.943759  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72090  mannose-6-phosphate isomerase  29 
 
 		 439 aa  141  1.9999999999999998e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.800208 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01715  mannose-6-phosphate isomerase, class I (AFU_orthologue; AFUA_4G08410)  30.83 
 
 		 404 aa  123  7e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.299956  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01750  mannose-6-phosphate isomerase, putative  27.74 
 
 		 456 aa  88.2  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.673433  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3802  mannose-6-phosphate isomerase  28.9 
 
 		 353 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1081  mannose-6-phosphate isomerase  28.9 
 
 		 369 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1806  mannose-6-phosphate isomerase, class I  23.81 
 
 		 319 aa  44.3  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0266  mannose-6-phosphate isomerase, class I  28.57 
 
 		 322 aa  43.9  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>