91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2039 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2340  mannose-6-phosphate isomerase, class I  92.31 
 
 		 390 aa  747    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2039  mannose-6-phosphate isomerase, class I  100 
 
 		 390 aa  807    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1586  mannose-6-phosphate isomerase, class I  72.31 
 
 		 391 aa  599  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.762503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2323  mannose-6-phosphate isomerase, class I  72.05 
 
 		 391 aa  597  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.734399  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2030  mannose-6-phosphate isomerase, class I  71.79 
 
 		 391 aa  595  1e-169  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0478981  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1688  mannose-6-phosphate isomerase  71.54 
 
 		 391 aa  594  1e-169  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1799  mannose-6-phosphate isomerase, class I  71.54 
 
 		 391 aa  594  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2017  mannose-6-phosphate isomerase, class I  71.54 
 
 		 391 aa  594  1e-169  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1821  mannose-6-phosphate isomerase  71.79 
 
 		 391 aa  595  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.280304  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01572  hypothetical protein  71.54 
 
 		 391 aa  593  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1874  mannose-6-phosphate isomerase, class I  72.56 
 
 		 391 aa  594  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0430449  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2269  mannose-6-phosphate isomerase  72.49 
 
 		 391 aa  592  1e-168  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01582  mannose-6-phosphate isomerase  71.54 
 
 		 391 aa  593  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2277  mannose-6-phosphate isomerase, class I  72.75 
 
 		 392 aa  589  1e-167  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.106024 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1830  mannose-6-phosphate isomerase  71.54 
 
 		 391 aa  588  1e-167  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00725153 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1876  mannose-6-phosphate isomerase, class I  70.77 
 
 		 391 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1576  mannose-6-phosphate isomerase, class I  70.77 
 
 		 391 aa  581  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.714022  normal  0.668804 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1566  mannose-6-phosphate isomerase, class I  71.03 
 
 		 391 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.368763  normal  0.0569701 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1707  mannose-6-phosphate isomerase, class I  70.77 
 
 		 391 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.104692  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1635  mannose-6-phosphate isomerase, class I  70.51 
 
 		 391 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2138  mannose-6-phosphate isomerase, class I  70.77 
 
 		 394 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.952255  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1902  mannose-6-phosphate isomerase, class I  67.18 
 
 		 394 aa  558  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.706948  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1986  mannose-6-phosphate isomerase, class I  73.95 
 
 		 359 aa  550  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1422  mannose-6-phosphate isomerase  50.26 
 
 		 388 aa  353  2e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001304  mannose-6-phosphate isomerase  49.74 
 
 		 410 aa  352  5e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.604165  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05183  mannose-6-phosphate isomerase  48.97 
 
 		 410 aa  351  1e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0895  mannose-6-phosphate isomerase  47.57 
 
 		 405 aa  350  2e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0693206  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000088  mannose-6-phosphate isomerase  46.77 
 
 		 411 aa  345  6e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00704  phosphomannose isomerase  48.37 
 
 		 405 aa  345  1e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2647  mannose-6-phosphate isomerase  47.95 
 
 		 399 aa  341  1e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2015  mannose-6-phosphate isomerase, class I  41.27 
 
 		 401 aa  278  1e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000590051  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4724  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.06 
 
 		 408 aa  265  8e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal  0.477393 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6324  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.95 
 
 		 407 aa  260  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.199717  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4165  mannose-6-phosphate isomerase, class I  40.05 
 
 		 406 aa  257  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.292455  normal  0.858964 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1186  mannose-6-phosphate isomerase  40.7 
 
 		 416 aa  257  3e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.215297  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1739  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.98 
 
 		 408 aa  256  6e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13284  mannose-6-phosphate isomerase manA  37.01 
 
 		 408 aa  251  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.34249 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2253  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.6 
 
 		 419 aa  248  9e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0483386  normal  0.187903 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1347  mannose-6-phosphate isomerase  37.78 
 
 		 409 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.46629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1330  mannose-6-phosphate isomerase  37.78 
 
 		 409 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37283  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2387  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.54 
 
 		 396 aa  245  8e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.318931  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1189  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.25 
 
 		 407 aa  244  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.816814  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02540  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.94 
 
 		 400 aa  243  3e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3297  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.11 
 
 		 416 aa  243  5e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2543  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.12 
 
 		 412 aa  241  1e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1366  mannose-6-phosphate isomerase  37.28 
 
 		 409 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.837438 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6006  mannose-6-phosphate isomerase class I  38.04 
 
 		 402 aa  240  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000013531  normal  0.0800927 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1116  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.75 
 
 		 394 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0922592 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30990  mannose-6-phosphate isomerase  36.93 
 
 		 411 aa  240  2.9999999999999997e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1257  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.61 
 
 		 425 aa  240  4e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000844984 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4202  mannose-6-phosphate isomerase  35.19 
 
 		 412 aa  236  7e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0860  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37 
 
 		 395 aa  235  8e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0016  mannose-6-phosphate isomerase  40.61 
 
 		 423 aa  233  5e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.976239  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2248  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.63 
 
 		 400 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000163868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4035  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.87 
 
 		 408 aa  227  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0762844  normal  0.148973 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3870  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.78 
 
 		 402 aa  224  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0760248  decreased coverage  0.0014351 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0605  mannose-6-phosphate isomerase  36.05 
 
 		 401 aa  217  2e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30820  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.17 
 
 		 415 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05210  mannose-6-phosphate isomerase, class I  40.1 
 
 		 414 aa  216  5e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.117407  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1172  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.27 
 
 		 399 aa  215  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0791265  normal  0.965156 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1993  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.68 
 
 		 421 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1613  mannose-6-phosphate isomerase (phosphomannose isomerase)  36.84 
 
 		 368 aa  212  7.999999999999999e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.194468  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4995  Mannose-6-phosphate isomerase  36.83 
 
 		 396 aa  212  7.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.549808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4295  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.68 
 
 		 391 aa  211  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3511  mannose-6-phosphate isomerase  36.2 
 
 		 369 aa  209  9e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0965  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.57 
 
 		 387 aa  207  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.857697  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2098  mannose-6-phosphate isomerase  35.26 
 
 		 398 aa  207  3e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.302925 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0902  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.62 
 
 		 387 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.942803  normal  0.0915708 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0410  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.68 
 
 		 372 aa  192  1e-47  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4238  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.85 
 
 		 1553 aa  191  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5861  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.59 
 
 		 429 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000549194  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0748  mannose-6-phosphate isomerase  30.91 
 
 		 433 aa  179  4.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44264  mannose-6-phosphate isomerase, type  31.77 
 
 		 527 aa  162  8.000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.167153  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02370  mannose-6-phosphate isomerase  31.28 
 
 		 434 aa  158  1e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.943759  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72090  mannose-6-phosphate isomerase  34.85 
 
 		 439 aa  158  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.800208 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00667  Mannose-6-phosphate isomerase (EC 5.3.1.8)(Phosphomannose isomerase)(PMI)(Phosphohexomutase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P29951]  35.29 
 
 		 461 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.354212 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3605  predicted protein  28.47 
 
 		 407 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01715  mannose-6-phosphate isomerase, class I (AFU_orthologue; AFUA_4G08410)  31.19 
 
 		 404 aa  113  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.299956  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01750  mannose-6-phosphate isomerase, putative  30.58 
 
 		 456 aa  91.7  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.673433  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2149  mannose-6-phosphate isomerase, class I  29.82 
 
 		 329 aa  46.2  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.84 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0511343  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1205  mannose-6-phosphate isomerase, class I  21.66 
 
 		 325 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140202  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1391  mannose-6-phosphate isomerase, class I  21.66 
 
 		 325 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0465  Mannose-6-phosphate isomerase  31.3 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0885  mannose-6-phosphate isomerase  27.73 
 
 		 326 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365127  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2261  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.35 
 
 		 316 aa  45.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21530  mannose-6-phosphate isomerase, class I  31.06 
 
 		 353 aa  44.3  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0920  Mannose-6-phosphate isomerase  30.47 
 
 		 321 aa  44.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0690486 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0266  mannose-6-phosphate isomerase, class I  44.23 
 
 		 322 aa  43.5  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1806  mannose-6-phosphate isomerase, class I  31.58 
 
 		 319 aa  43.1  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1319  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.48 
 
 		 318 aa  43.1  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0119683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>