80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0321 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0321  mannose-6-phosphate isomerase  100 
 
 
316 aa  624  1e-178  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000805309  hitchhiker  0.00737279 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3743  mannose-6-phosphate isomerase  41.67 
 
 
323 aa  202  9e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.274174  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0465  Mannose-6-phosphate isomerase  38.39 
 
 
365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0885  mannose-6-phosphate isomerase  40.07 
 
 
326 aa  193  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365127  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0920  Mannose-6-phosphate isomerase  42.9 
 
 
321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0690486 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21530  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.26 
 
 
353 aa  189  7e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.84 
 
 
349 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0511343  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3802  mannose-6-phosphate isomerase  41.21 
 
 
353 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1319  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.29 
 
 
318 aa  187  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0119683  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1081  mannose-6-phosphate isomerase  40.37 
 
 
369 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1723  Mannose-6-phosphate isomerase  39.2 
 
 
344 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2149  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.1 
 
 
329 aa  177  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0458  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.31 
 
 
320 aa  177  3e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3116  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.12 
 
 
363 aa  176  5e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1205  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.12 
 
 
325 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140202  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1391  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.7 
 
 
325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0819  mannose-6-phosphate isomerase  35.42 
 
 
315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2261  mannose-6-phosphate isomerase, class I  41.67 
 
 
316 aa  169  8e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1327  Mannose-6-phosphate isomerase  31.13 
 
 
319 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1708  mannose-6-phosphate isomerase  34.67 
 
 
315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.657704  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1171  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.69 
 
 
314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0266  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.42 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1688  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.06 
 
 
315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.745586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2722  mannose-6-phosphate isomerase  43.17 
 
 
312 aa  162  6e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2666  mannose-6-phosphate isomerase  43.17 
 
 
312 aa  162  6e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0314  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.15 
 
 
336 aa  162  9e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000281347  normal  0.468377 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0569  mannose-6-phosphate isomerase  36.84 
 
 
325 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.114617 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0467  mannose-6-phosphate isomerase  34.2 
 
 
328 aa  161  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0468  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.7 
 
 
336 aa  160  2e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0309  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.94 
 
 
326 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1806  mannose-6-phosphate isomerase, class I  29.25 
 
 
319 aa  159  8e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2255  Mannose-6-phosphate isomerase  42.05 
 
 
323 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0223155  hitchhiker  0.00489167 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3397  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.28 
 
 
318 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2595  Mannose-6-phosphate isomerase  29.97 
 
 
325 aa  157  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1752  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.53 
 
 
312 aa  156  4e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0921565  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3528  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.03 
 
 
320 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1263  phosphomannose isomerase  33.13 
 
 
321 aa  153  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000784939  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12883  putative mannose-6-phosphate isomerase  30.63 
 
 
325 aa  151  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0193  mannose-6-phosphate isomerase, type I  37.86 
 
 
278 aa  149  5e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1769  phosphomannose isomerase  32.92 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1668  mannose-6-phosphate isomerase type I  34.19 
 
 
326 aa  145  6e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0844191  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0249  phosphomannose isomerase  32.73 
 
 
322 aa  145  1e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.289498  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3117  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.96 
 
 
314 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0284496  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0191  mannose-6-phosphate isomerase type I  34.26 
 
 
278 aa  144  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3377  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.6 
 
 
310 aa  143  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.308254  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2595  phosphomannose isomerase-like protein  35.58 
 
 
355 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0506616  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2217  mannose-6-phosphate isomerase, class I  28.97 
 
 
312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.735941  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  28.97 
 
 
312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0457  mannose-6-phosphate isomerase type I  29.03 
 
 
271 aa  140  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1783  hypothetical protein  34.46 
 
 
358 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.203269  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0475  phosphomannose isomerase type I  35 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.282321  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0141  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.96 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1535  mannose-6-phosphate isomerase, type I  35.54 
 
 
262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.480559  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1245  Mannose-6-phosphate isomerase  33.12 
 
 
306 aa  127  4.0000000000000003e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0882  mannose-6-phosphate isomerase type I  35.07 
 
 
273 aa  127  4.0000000000000003e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240719  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1575  mannose-6-phosphate isomerase  41.4 
 
 
195 aa  125  9e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1681  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.85 
 
 
312 aa  123  4e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0743  putative mannose-6-phosphate isomerase  35.97 
 
 
267 aa  121  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594978  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4499  phosphomannose isomerase-like protein  39.5 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0924  mannose-6-phosphate isomerase  44.72 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1592  phosphomannose isomerase-like protein  40.91 
 
 
268 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1059  mannose-6-phosphate isomerase  37.36 
 
 
315 aa  109  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191159 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28540  phosphomannose isomerase  32.52 
 
 
349 aa  89  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.188562 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3966  PfkB domain protein  33.22 
 
 
680 aa  82.4  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173743  normal  0.0415319 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4282  hypothetical protein  26.05 
 
 
598 aa  77.8  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0756  hypothetical protein  27.88 
 
 
587 aa  76.3  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.31068  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2422  mannose-6-phosphate isomerase-like protein  25.68 
 
 
618 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.167496 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1482  Phosphomannose isomerase-like protein  26.21 
 
 
505 aa  73.2  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0656  phosphomannose isomerase-like protein  32.24 
 
 
364 aa  72  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.189612  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3010  hypothetical protein  23.1 
 
 
587 aa  68.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020872  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6091  hypothetical protein  30.6 
 
 
339 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2266  hypothetical protein  27.16 
 
 
609 aa  66.6  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0860  mannose-6-phosphate isomerase, class I  40.2 
 
 
395 aa  58.9  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0639  mannose-6-phosphate isomerase-like protein  25.35 
 
 
584 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.459427  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3511  mannose-6-phosphate isomerase  31.87 
 
 
369 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3646  phosphomannose isomerase-like  25.91 
 
 
373 aa  49.7  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1116  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.51 
 
 
394 aa  47  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0922592 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1993  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.86 
 
 
421 aa  44.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4035  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.2 
 
 
408 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0762844  normal  0.148973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0902  mannose-6-phosphate isomerase, class I  41.98 
 
 
387 aa  43.5  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.942803  normal  0.0915708 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>