111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3966 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3966  PfkB domain protein  100 
 
 
680 aa  1293    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173743  normal  0.0415319 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6091  hypothetical protein  46.25 
 
 
339 aa  246  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28540  phosphomannose isomerase  44.51 
 
 
349 aa  246  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.188562 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2533  PfkB domain protein  41.79 
 
 
379 aa  207  6e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2598  PfkB  41.31 
 
 
382 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.098069  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0656  phosphomannose isomerase-like protein  27.08 
 
 
364 aa  120  9e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.189612  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1081  mannose-6-phosphate isomerase  36.12 
 
 
369 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.4 
 
 
349 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0511343  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3646  phosphomannose isomerase-like  32.06 
 
 
373 aa  110  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0920  Mannose-6-phosphate isomerase  33.66 
 
 
321 aa  107  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0690486 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0885  mannose-6-phosphate isomerase  33.86 
 
 
326 aa  107  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365127  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3802  mannose-6-phosphate isomerase  36.33 
 
 
353 aa  106  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0309  mannose-6-phosphate isomerase, class I  29.75 
 
 
326 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1723  Mannose-6-phosphate isomerase  35.86 
 
 
344 aa  104  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0467  mannose-6-phosphate isomerase  28.71 
 
 
328 aa  103  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3743  mannose-6-phosphate isomerase  29 
 
 
323 aa  97.4  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.274174  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12883  putative mannose-6-phosphate isomerase  25.08 
 
 
325 aa  96.7  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1319  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.77 
 
 
318 aa  97.1  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0119683  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21530  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.92 
 
 
353 aa  97.1  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2595  Mannose-6-phosphate isomerase  26.89 
 
 
325 aa  96.7  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2666  mannose-6-phosphate isomerase  26.38 
 
 
312 aa  96.3  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2722  mannose-6-phosphate isomerase  26.38 
 
 
312 aa  96.3  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1171  mannose-6-phosphate isomerase, class I  26.65 
 
 
314 aa  95.5  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0465  Mannose-6-phosphate isomerase  30.59 
 
 
365 aa  95.5  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0458  mannose-6-phosphate isomerase, class I  25.91 
 
 
320 aa  92.8  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0266  mannose-6-phosphate isomerase, class I  27.1 
 
 
322 aa  91.7  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3397  mannose-6-phosphate isomerase, class I  28.11 
 
 
318 aa  91.7  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2255  Mannose-6-phosphate isomerase  34.6 
 
 
323 aa  90.1  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0223155  hitchhiker  0.00489167 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1391  mannose-6-phosphate isomerase, class I  25.39 
 
 
325 aa  89.4  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1205  mannose-6-phosphate isomerase, class I  25.39 
 
 
325 aa  89.4  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140202  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1059  mannose-6-phosphate isomerase  39.55 
 
 
315 aa  86.7  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191159 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1688  mannose-6-phosphate isomerase, class I  41.27 
 
 
315 aa  84.7  0.000000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.745586  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0468  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.29 
 
 
336 aa  82.4  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2261  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.96 
 
 
316 aa  82.8  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3116  mannose-6-phosphate isomerase, class I  28.16 
 
 
363 aa  83.2  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4499  phosphomannose isomerase-like protein  36.28 
 
 
294 aa  82.8  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0321  mannose-6-phosphate isomerase  32.85 
 
 
316 aa  81.6  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000805309  hitchhiker  0.00737279 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1708  mannose-6-phosphate isomerase  26.07 
 
 
315 aa  81.6  0.00000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.657704  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0819  mannose-6-phosphate isomerase  26.4 
 
 
315 aa  79.7  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1752  mannose-6-phosphate isomerase, class I  24.49 
 
 
312 aa  79  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0921565  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3528  mannose-6-phosphate isomerase, class I  31.78 
 
 
320 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1263  phosphomannose isomerase  28.69 
 
 
321 aa  77  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000784939  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3377  mannose-6-phosphate isomerase, class I  25.62 
 
 
310 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.308254  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  24.23 
 
 
312 aa  75.1  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2217  mannose-6-phosphate isomerase, class I  24.23 
 
 
312 aa  75.1  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.735941  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  32.31 
 
 
317 aa  74.7  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1783  hypothetical protein  29.73 
 
 
358 aa  73.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.203269  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2149  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.22 
 
 
329 aa  73.6  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2595  phosphomannose isomerase-like protein  40 
 
 
355 aa  72.4  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0506616  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1769  phosphomannose isomerase  32.8 
 
 
319 aa  72  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0193  mannose-6-phosphate isomerase, type I  29.29 
 
 
278 aa  71.2  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1806  mannose-6-phosphate isomerase, class I  22.32 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0191  mannose-6-phosphate isomerase type I  30.3 
 
 
278 aa  70.5  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0314  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.8 
 
 
336 aa  70.5  0.00000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000281347  normal  0.468377 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0249  phosphomannose isomerase  26.88 
 
 
322 aa  70.1  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.289498  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0141  mannose-6-phosphate isomerase, class I  23.85 
 
 
318 aa  70.1  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0882  mannose-6-phosphate isomerase type I  28.26 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240719  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0924  mannose-6-phosphate isomerase  36.05 
 
 
307 aa  66.6  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0268  PfkB domain protein  32.2 
 
 
350 aa  66.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1535  mannose-6-phosphate isomerase, type I  26.64 
 
 
262 aa  65.5  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.480559  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0569  mannose-6-phosphate isomerase  35.9 
 
 
325 aa  65.1  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.114617 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1681  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.42 
 
 
312 aa  65.1  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1706  PfkB domain protein  32.81 
 
 
319 aa  63.9  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1575  mannose-6-phosphate isomerase  32.52 
 
 
195 aa  63.5  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1245  Mannose-6-phosphate isomerase  28.51 
 
 
306 aa  63.5  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1327  Mannose-6-phosphate isomerase  22.13 
 
 
319 aa  62  0.00000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0873  ribokinase-like domain-containing protein  31.27 
 
 
315 aa  61.6  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0297  PfkB domain protein  33.33 
 
 
352 aa  61.6  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.27721  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  33.23 
 
 
304 aa  60.5  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0475  phosphomannose isomerase type I  25.77 
 
 
309 aa  60.1  0.0000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.282321  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0743  putative mannose-6-phosphate isomerase  32.85 
 
 
267 aa  58.9  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594978  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4282  hypothetical protein  27.84 
 
 
598 aa  58.5  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0457  mannose-6-phosphate isomerase type I  26.36 
 
 
271 aa  58.2  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1592  phosphomannose isomerase-like protein  33.33 
 
 
268 aa  57.4  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3117  mannose-6-phosphate isomerase, class I  24.07 
 
 
314 aa  57.4  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0284496  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  30.82 
 
 
308 aa  57.4  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1668  mannose-6-phosphate isomerase type I  35.86 
 
 
326 aa  56.6  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0844191  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  31.52 
 
 
360 aa  56.2  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2370  putative sugar kinase  27.8 
 
 
316 aa  55.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.976267  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  28.76 
 
 
303 aa  55.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2407  ribokinase-like domain-containing protein  25.67 
 
 
319 aa  55.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2306  PfkB family kinase  25.67 
 
 
319 aa  54.7  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  35.49 
 
 
300 aa  53.9  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1030  ribokinase-like domain-containing protein  27.27 
 
 
316 aa  53.9  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6006  mannose-6-phosphate isomerase class I  42.86 
 
 
402 aa  53.9  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000013531  normal  0.0800927 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4060  ribokinase-like domain-containing protein  25.69 
 
 
314 aa  52.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288269  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2365  PfkB domain-containing protein  28.52 
 
 
313 aa  52.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  29.77 
 
 
320 aa  53.1  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0756  hypothetical protein  27.1 
 
 
587 aa  52  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.31068  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2422  mannose-6-phosphate isomerase-like protein  21.62 
 
 
618 aa  52  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.167496 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  24.37 
 
 
337 aa  50.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0639  mannose-6-phosphate isomerase-like protein  24.2 
 
 
584 aa  48.9  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.459427  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5137  PfkB domain protein  25.08 
 
 
319 aa  48.5  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3397  PfkB domain protein  32.18 
 
 
309 aa  48.5  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.125463 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1421  PfkB  30.11 
 
 
284 aa  48.1  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0830137 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  29.8 
 
 
300 aa  47.8  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5796  PfkB domain protein  29.06 
 
 
337 aa  47.8  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  30.63 
 
 
316 aa  47.8  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1034  ribokinase-like domain-containing protein  27.62 
 
 
337 aa  47.8  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.347997 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  33.95 
 
 
288 aa  47.4  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>