110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0885 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0885  mannose-6-phosphate isomerase  100 
 
 
326 aa  669    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365127  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1081  mannose-6-phosphate isomerase  53.68 
 
 
369 aa  347  1e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3802  mannose-6-phosphate isomerase  53.68 
 
 
353 aa  335  5e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3743  mannose-6-phosphate isomerase  50.61 
 
 
323 aa  323  3e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.274174  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1723  Mannose-6-phosphate isomerase  52.17 
 
 
344 aa  323  3e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0465  Mannose-6-phosphate isomerase  39.76 
 
 
365 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0920  Mannose-6-phosphate isomerase  39.68 
 
 
321 aa  213  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0690486 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12883  putative mannose-6-phosphate isomerase  35.37 
 
 
325 aa  213  4.9999999999999996e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1319  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.47 
 
 
318 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0119683  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0467  mannose-6-phosphate isomerase  35.78 
 
 
328 aa  200  3e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21530  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.11 
 
 
353 aa  199  6e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0309  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.67 
 
 
326 aa  196  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0458  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.44 
 
 
320 aa  196  5.000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0266  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.05 
 
 
322 aa  192  5e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2255  Mannose-6-phosphate isomerase  42.25 
 
 
323 aa  191  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0223155  hitchhiker  0.00489167 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1806  mannose-6-phosphate isomerase, class I  29.45 
 
 
319 aa  189  5e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0321  mannose-6-phosphate isomerase  40.39 
 
 
316 aa  189  5.999999999999999e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000805309  hitchhiker  0.00737279 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1391  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.45 
 
 
325 aa  188  9e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1205  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.84 
 
 
325 aa  188  9e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140202  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0249  phosphomannose isomerase  36.14 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.289498  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3116  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.94 
 
 
363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0468  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.85 
 
 
336 aa  182  6e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1171  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.62 
 
 
314 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0819  mannose-6-phosphate isomerase  35.67 
 
 
315 aa  179  4e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2261  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.54 
 
 
316 aa  179  4.999999999999999e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1327  Mannose-6-phosphate isomerase  29.05 
 
 
319 aa  177  2e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2595  Mannose-6-phosphate isomerase  30.56 
 
 
325 aa  175  8e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0569  mannose-6-phosphate isomerase  34.16 
 
 
325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.114617 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1263  phosphomannose isomerase  33.23 
 
 
321 aa  171  2e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000784939  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1752  mannose-6-phosphate isomerase, class I  31.83 
 
 
312 aa  169  4e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0921565  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.83 
 
 
349 aa  168  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0511343  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3397  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.53 
 
 
318 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2149  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.54 
 
 
329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2666  mannose-6-phosphate isomerase  34.52 
 
 
312 aa  164  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2722  mannose-6-phosphate isomerase  34.52 
 
 
312 aa  164  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0314  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.31 
 
 
336 aa  163  3e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000281347  normal  0.468377 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3528  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35 
 
 
320 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3377  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.03 
 
 
310 aa  157  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.308254  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1708  mannose-6-phosphate isomerase  31.95 
 
 
315 aa  155  7e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.657704  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1769  phosphomannose isomerase  32.34 
 
 
319 aa  152  5e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  31.29 
 
 
312 aa  152  7e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2217  mannose-6-phosphate isomerase, class I  31.29 
 
 
312 aa  152  7e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.735941  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0141  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.94 
 
 
318 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1688  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.92 
 
 
315 aa  151  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.745586  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3117  mannose-6-phosphate isomerase, class I  31.54 
 
 
314 aa  135  7.000000000000001e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0284496  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0475  phosphomannose isomerase type I  30.86 
 
 
309 aa  133  3e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.282321  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1681  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.86 
 
 
312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1575  mannose-6-phosphate isomerase  41.01 
 
 
195 aa  129  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0193  mannose-6-phosphate isomerase, type I  37.05 
 
 
278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0191  mannose-6-phosphate isomerase type I  31.97 
 
 
278 aa  125  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1245  Mannose-6-phosphate isomerase  29.77 
 
 
306 aa  125  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0924  mannose-6-phosphate isomerase  37.32 
 
 
307 aa  124  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0457  mannose-6-phosphate isomerase type I  32.5 
 
 
271 aa  123  5e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2595  phosphomannose isomerase-like protein  30.98 
 
 
355 aa  122  9e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0506616  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1783  hypothetical protein  27.3 
 
 
358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.203269  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4499  phosphomannose isomerase-like protein  35.54 
 
 
294 aa  119  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1668  mannose-6-phosphate isomerase type I  31.6 
 
 
326 aa  119  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0844191  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0882  mannose-6-phosphate isomerase type I  34.5 
 
 
273 aa  119  7.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240719  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1059  mannose-6-phosphate isomerase  40.45 
 
 
315 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191159 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1592  phosphomannose isomerase-like protein  35.98 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3966  PfkB domain protein  33.86 
 
 
680 aa  107  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173743  normal  0.0415319 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1535  mannose-6-phosphate isomerase, type I  29.26 
 
 
262 aa  106  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.480559  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0743  putative mannose-6-phosphate isomerase  38.46 
 
 
267 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594978  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0656  phosphomannose isomerase-like protein  21.74 
 
 
364 aa  79.7  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.189612  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6091  hypothetical protein  29.44 
 
 
339 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28540  phosphomannose isomerase  35.11 
 
 
349 aa  76.3  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.188562 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1482  Phosphomannose isomerase-like protein  24.87 
 
 
505 aa  75.9  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4282  hypothetical protein  30.77 
 
 
598 aa  69.7  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2266  hypothetical protein  25.7 
 
 
609 aa  63.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2422  mannose-6-phosphate isomerase-like protein  26.38 
 
 
618 aa  63.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.167496 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3646  phosphomannose isomerase-like  28.24 
 
 
373 aa  60.5  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3010  hypothetical protein  22.79 
 
 
587 aa  60.1  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020872  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0756  hypothetical protein  26.59 
 
 
587 aa  58.9  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.31068  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0639  mannose-6-phosphate isomerase-like protein  24.56 
 
 
584 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.459427  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4202  mannose-6-phosphate isomerase  31.37 
 
 
412 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1116  mannose-6-phosphate isomerase, class I  40.98 
 
 
394 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0922592 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2340  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.63 
 
 
390 aa  46.6  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2098  mannose-6-phosphate isomerase  44.9 
 
 
398 aa  46.2  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.302925 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1586  mannose-6-phosphate isomerase, class I  40.32 
 
 
391 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.762503  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6006  mannose-6-phosphate isomerase class I  35.05 
 
 
402 aa  46.2  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000013531  normal  0.0800927 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2015  mannose-6-phosphate isomerase, class I  28.71 
 
 
401 aa  46.2  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000590051  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2387  mannose-6-phosphate isomerase, class I  50 
 
 
396 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.318931  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1688  mannose-6-phosphate isomerase  39.34 
 
 
391 aa  45.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2017  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.34 
 
 
391 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1799  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.34 
 
 
391 aa  45.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2138  mannose-6-phosphate isomerase, class I  27.12 
 
 
394 aa  45.4  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.952255  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3511  mannose-6-phosphate isomerase  34.43 
 
 
369 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01582  mannose-6-phosphate isomerase  39.34 
 
 
391 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2030  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.34 
 
 
391 aa  45.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0478981  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1830  mannose-6-phosphate isomerase  38.71 
 
 
391 aa  44.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00725153 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1874  mannose-6-phosphate isomerase, class I  28.1 
 
 
391 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0430449  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1821  mannose-6-phosphate isomerase  39.34 
 
 
391 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.280304  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0902  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.84 
 
 
387 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.942803  normal  0.0915708 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2269  mannose-6-phosphate isomerase  28.1 
 
 
391 aa  44.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2323  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.34 
 
 
391 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.734399  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01572  hypothetical protein  39.34 
 
 
391 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2039  mannose-6-phosphate isomerase, class I  27.73 
 
 
390 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02540  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.62 
 
 
400 aa  44.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1576  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.1 
 
 
391 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.714022  normal  0.668804 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1635  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.1 
 
 
391 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>