74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1059 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1059  mannose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 315 aa  631  1e-180  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191159 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0924  mannose-6-phosphate isomerase  54.64 
 
 		 307 aa  290  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4499  phosphomannose isomerase-like protein  43.82 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1592  phosphomannose isomerase-like protein  41.34 
 
 		 268 aa  177  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0743  putative mannose-6-phosphate isomerase  40.78 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594978  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0569  mannose-6-phosphate isomerase  33.76 
 
 		 325 aa  142  9e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114617 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1723  Mannose-6-phosphate isomerase  38.46 
 
 		 344 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0920  Mannose-6-phosphate isomerase  36.63 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0690486 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1081  mannose-6-phosphate isomerase  41.41 
 
 		 369 aa  125  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2255  Mannose-6-phosphate isomerase  33.61 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0223155  hitchhiker  0.00489167 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0266  mannose-6-phosphate isomerase, class I  31.48 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3743  mannose-6-phosphate isomerase  33.6 
 
 		 323 aa  123  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.274174  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0467  mannose-6-phosphate isomerase  31.76 
 
 		 328 aa  123  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0465  Mannose-6-phosphate isomerase  35.15 
 
 		 365 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.14 
 
 		 349 aa  120  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0511343  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12883  putative mannose-6-phosphate isomerase  36.14 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0885  mannose-6-phosphate isomerase  40.45 
 
 		 326 aa  116  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365127  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0458  mannose-6-phosphate isomerase, class I  29.05 
 
 		 320 aa  116  3.9999999999999997e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21530  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.05 
 
 		 353 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3802  mannose-6-phosphate isomerase  35.88 
 
 		 353 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1391  mannose-6-phosphate isomerase, class I  31.9 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1205  mannose-6-phosphate isomerase, class I  31.9 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140202  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2261  mannose-6-phosphate isomerase, class I  31.06 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3116  mannose-6-phosphate isomerase, class I  43.4 
 
 		 363 aa  113  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1263  phosphomannose isomerase  31.51 
 
 		 321 aa  113  5e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000784939  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1688  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.23 
 
 		 315 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.745586  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1319  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.1 
 
 		 318 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0119683  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2149  mannose-6-phosphate isomerase, class I  29.89 
 
 		 329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0468  mannose-6-phosphate isomerase, class I  31.51 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0309  mannose-6-phosphate isomerase, class I  41.61 
 
 		 326 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1668  mannose-6-phosphate isomerase type I  35.41 
 
 		 326 aa  109  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0844191  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2666  mannose-6-phosphate isomerase  33.49 
 
 		 312 aa  109  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2722  mannose-6-phosphate isomerase  33.49 
 
 		 312 aa  109  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3528  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.75 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1752  mannose-6-phosphate isomerase, class I  29.79 
 
 		 312 aa  106  7e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0921565  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0819  mannose-6-phosphate isomerase  33.63 
 
 		 315 aa  105  7e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0321  mannose-6-phosphate isomerase  37.36 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000805309  hitchhiker  0.00737279 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1708  mannose-6-phosphate isomerase  37.21 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.657704  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1171  mannose-6-phosphate isomerase, class I  29.96 
 
 		 314 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2595  Mannose-6-phosphate isomerase  28.71 
 
 		 325 aa  102  6e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3397  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.85 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3377  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.18 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.308254  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1245  Mannose-6-phosphate isomerase  41.3 
 
 		 306 aa  100  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1535  mannose-6-phosphate isomerase, type I  34.15 
 
 		 262 aa  99.4  8e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.480559  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0249  phosphomannose isomerase  35.84 
 
 		 322 aa  99  9e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.289498  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0457  mannose-6-phosphate isomerase type I  31.19 
 
 		 271 aa  98.2  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1575  mannose-6-phosphate isomerase  40.68 
 
 		 195 aa  97.4  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0193  mannose-6-phosphate isomerase, type I  39.39 
 
 		 278 aa  96.7  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0191  mannose-6-phosphate isomerase type I  37.41 
 
 		 278 aa  96.3  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1769  phosphomannose isomerase  28.01 
 
 		 319 aa  94.4  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2217  mannose-6-phosphate isomerase, class I  28.64 
 
 		 312 aa  92.4  9e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.735941  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  28.64 
 
 		 312 aa  92.4  9e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0882  mannose-6-phosphate isomerase type I  31.05 
 
 		 273 aa  92  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240719  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0141  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.08 
 
 		 318 aa  89.7  5e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1806  mannose-6-phosphate isomerase, class I  28.37 
 
 		 319 aa  89.7  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1681  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.6 
 
 		 312 aa  87  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3966  PfkB domain protein  39.55 
 
 		 680 aa  87  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173743  normal  0.0415319 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0314  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.3 
 
 		 336 aa  86.7  5e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000281347  normal  0.468377 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0475  phosphomannose isomerase type I  31.52 
 
 		 309 aa  86.3  6e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.282321  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3117  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.58 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0284496  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1327  Mannose-6-phosphate isomerase  31.41 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2595  phosphomannose isomerase-like protein  28.75 
 
 		 355 aa  82  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0506616  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1783  hypothetical protein  34.86 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.203269  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0656  phosphomannose isomerase-like protein  31.97 
 
 		 364 aa  69.3  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.189612  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6091  hypothetical protein  37.7 
 
 		 339 aa  68.9  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0756  hypothetical protein  30.17 
 
 		 587 aa  60.1  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.31068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3646  phosphomannose isomerase-like  34.68 
 
 		 373 aa  59.3  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28540  phosphomannose isomerase  29.32 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.188562 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4282  hypothetical protein  30.25 
 
 		 598 aa  58.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2422  mannose-6-phosphate isomerase-like protein  25.74 
 
 		 618 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.167496 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2266  hypothetical protein  30.06 
 
 		 609 aa  52.8  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1482  Phosphomannose isomerase-like protein  24.32 
 
 		 505 aa  52  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3010  hypothetical protein  30.17 
 
 		 587 aa  49.3  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020872  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0639  mannose-6-phosphate isomerase-like protein  26.72 
 
 		 584 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.459427  normal  0.13799 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>