73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1592 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1592  phosphomannose isomerase-like protein  100 
 
 
268 aa  540  9.999999999999999e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4499  phosphomannose isomerase-like protein  46.92 
 
 
294 aa  223  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0743  putative mannose-6-phosphate isomerase  41.89 
 
 
267 aa  203  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594978  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1059  mannose-6-phosphate isomerase  41.34 
 
 
315 aa  178  7e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191159 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0924  mannose-6-phosphate isomerase  46.19 
 
 
307 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0569  mannose-6-phosphate isomerase  45.68 
 
 
325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.114617 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1723  Mannose-6-phosphate isomerase  40 
 
 
344 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0465  Mannose-6-phosphate isomerase  44.22 
 
 
365 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0920  Mannose-6-phosphate isomerase  34.96 
 
 
321 aa  122  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0690486 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2261  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.03 
 
 
316 aa  122  8e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1263  phosphomannose isomerase  40.13 
 
 
321 aa  122  8e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000784939  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1688  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.5 
 
 
315 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.745586  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0885  mannose-6-phosphate isomerase  36.41 
 
 
326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365127  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3743  mannose-6-phosphate isomerase  35.14 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.274174  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2722  mannose-6-phosphate isomerase  33.98 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2666  mannose-6-phosphate isomerase  33.98 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1171  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.2 
 
 
314 aa  115  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0458  mannose-6-phosphate isomerase, class I  31.25 
 
 
320 aa  115  7.999999999999999e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0266  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.69 
 
 
322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0309  mannose-6-phosphate isomerase, class I  42.36 
 
 
326 aa  112  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3528  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.27 
 
 
320 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0249  phosphomannose isomerase  39.24 
 
 
322 aa  111  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.289498  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21530  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.34 
 
 
353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0819  mannose-6-phosphate isomerase  37.14 
 
 
315 aa  110  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0321  mannose-6-phosphate isomerase  42.95 
 
 
316 aa  109  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000805309  hitchhiker  0.00737279 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1319  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.36 
 
 
318 aa  109  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0119683  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3117  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.43 
 
 
314 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0284496  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2255  Mannose-6-phosphate isomerase  36.36 
 
 
323 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0223155  hitchhiker  0.00489167 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1575  mannose-6-phosphate isomerase  40.3 
 
 
195 aa  106  4e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1708  mannose-6-phosphate isomerase  31.48 
 
 
315 aa  106  4e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.657704  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0468  mannose-6-phosphate isomerase, class I  40.44 
 
 
336 aa  106  4e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3397  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.24 
 
 
318 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0141  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.95 
 
 
318 aa  103  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1081  mannose-6-phosphate isomerase  39.11 
 
 
369 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0467  mannose-6-phosphate isomerase  36.84 
 
 
328 aa  103  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2149  mannose-6-phosphate isomerase, class I  28.12 
 
 
329 aa  102  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1752  mannose-6-phosphate isomerase, class I  31.31 
 
 
312 aa  102  7e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0921565  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1327  Mannose-6-phosphate isomerase  35.62 
 
 
319 aa  102  8e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0314  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.44 
 
 
336 aa  101  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000281347  normal  0.468377 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3802  mannose-6-phosphate isomerase  38.25 
 
 
353 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1769  phosphomannose isomerase  35.91 
 
 
319 aa  100  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1806  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.69 
 
 
319 aa  100  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3116  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.29 
 
 
363 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12883  putative mannose-6-phosphate isomerase  28.32 
 
 
325 aa  99.8  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3377  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.8 
 
 
310 aa  100  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.308254  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0882  mannose-6-phosphate isomerase type I  30.77 
 
 
273 aa  99.8  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240719  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0193  mannose-6-phosphate isomerase, type I  32.83 
 
 
278 aa  98.6  9e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.57 
 
 
349 aa  98.2  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0511343  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1245  Mannose-6-phosphate isomerase  41.48 
 
 
306 aa  96.7  4e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0457  mannose-6-phosphate isomerase type I  32.98 
 
 
271 aa  96.3  5e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1391  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.21 
 
 
325 aa  95.5  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1535  mannose-6-phosphate isomerase, type I  32.45 
 
 
262 aa  95.9  7e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.480559  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1205  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.21 
 
 
325 aa  95.5  7e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140202  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2595  Mannose-6-phosphate isomerase  37.14 
 
 
325 aa  94  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1681  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.33 
 
 
312 aa  94  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0191  mannose-6-phosphate isomerase type I  31.79 
 
 
278 aa  94.4  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  29.52 
 
 
312 aa  93.6  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2217  mannose-6-phosphate isomerase, class I  29.52 
 
 
312 aa  93.6  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.735941  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1668  mannose-6-phosphate isomerase type I  39.72 
 
 
326 aa  89.4  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0844191  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0475  phosphomannose isomerase type I  24.24 
 
 
309 aa  87  3e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.282321  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2595  phosphomannose isomerase-like protein  31.73 
 
 
355 aa  71.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0506616  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1783  hypothetical protein  33.6 
 
 
358 aa  69.7  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.203269  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4282  hypothetical protein  32.24 
 
 
598 aa  58.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0656  phosphomannose isomerase-like protein  33.33 
 
 
364 aa  57.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.189612  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3966  PfkB domain protein  33.33 
 
 
680 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173743  normal  0.0415319 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28540  phosphomannose isomerase  33.86 
 
 
349 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.188562 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6091  hypothetical protein  31.71 
 
 
339 aa  52.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2266  hypothetical protein  31.97 
 
 
609 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2422  mannose-6-phosphate isomerase-like protein  25.83 
 
 
618 aa  46.6  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.167496 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3010  hypothetical protein  30.92 
 
 
587 aa  45.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020872  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0639  mannose-6-phosphate isomerase-like protein  28.67 
 
 
584 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.459427  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0756  hypothetical protein  28.95 
 
 
587 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.31068  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3646  phosphomannose isomerase-like  26.05 
 
 
373 aa  43.5  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>