88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1668 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1668  mannose-6-phosphate isomerase type I  100 
 
 
326 aa  667    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0844191  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1245  Mannose-6-phosphate isomerase  41.19 
 
 
306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0465  Mannose-6-phosphate isomerase  38.01 
 
 
365 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21530  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.62 
 
 
353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0458  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.64 
 
 
320 aa  185  1.0000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0266  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.95 
 
 
322 aa  181  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1806  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.3 
 
 
319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  41.18 
 
 
349 aa  176  4e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0511343  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1319  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.77 
 
 
318 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0119683  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2595  Mannose-6-phosphate isomerase  32.69 
 
 
325 aa  172  6.999999999999999e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0309  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.94 
 
 
326 aa  170  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12883  putative mannose-6-phosphate isomerase  39.01 
 
 
325 aa  169  6e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1205  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.4 
 
 
325 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140202  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1391  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.02 
 
 
325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2149  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.34 
 
 
329 aa  166  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1327  Mannose-6-phosphate isomerase  40.17 
 
 
319 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0467  mannose-6-phosphate isomerase  31.99 
 
 
328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0314  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.89 
 
 
336 aa  162  7e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000281347  normal  0.468377 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3397  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.13 
 
 
318 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0468  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.16 
 
 
336 aa  159  7e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1171  mannose-6-phosphate isomerase, class I  41.36 
 
 
314 aa  155  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0569  mannose-6-phosphate isomerase  40.81 
 
 
325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.114617 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1081  mannose-6-phosphate isomerase  35.15 
 
 
369 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1688  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.6 
 
 
315 aa  147  3e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.745586  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3743  mannose-6-phosphate isomerase  33.23 
 
 
323 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.274174  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1263  phosphomannose isomerase  38.53 
 
 
321 aa  145  9e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000784939  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3802  mannose-6-phosphate isomerase  35.9 
 
 
353 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0321  mannose-6-phosphate isomerase  34.19 
 
 
316 aa  144  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000805309  hitchhiker  0.00737279 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1681  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.2 
 
 
312 aa  143  4e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3377  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.17 
 
 
310 aa  142  7e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.308254  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3528  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.54 
 
 
320 aa  142  8e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1708  mannose-6-phosphate isomerase  34.08 
 
 
315 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.657704  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2261  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.68 
 
 
316 aa  138  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0141  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.45 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0819  mannose-6-phosphate isomerase  38.53 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0249  phosphomannose isomerase  36.94 
 
 
322 aa  132  6.999999999999999e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.289498  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2666  mannose-6-phosphate isomerase  36.73 
 
 
312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2722  mannose-6-phosphate isomerase  36.73 
 
 
312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3116  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.03 
 
 
363 aa  125  9e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1752  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.22 
 
 
312 aa  125  9e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0921565  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0885  mannose-6-phosphate isomerase  32.4 
 
 
326 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365127  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1723  Mannose-6-phosphate isomerase  31.72 
 
 
344 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3117  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.88 
 
 
314 aa  123  4e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0284496  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1575  mannose-6-phosphate isomerase  38.17 
 
 
195 aa  117  3e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1769  phosphomannose isomerase  30.58 
 
 
319 aa  117  3e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0920  Mannose-6-phosphate isomerase  34.6 
 
 
321 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0690486 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0475  phosphomannose isomerase type I  29.43 
 
 
309 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.282321  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2217  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.48 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.735941  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.48 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1059  mannose-6-phosphate isomerase  35.41 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191159 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0191  mannose-6-phosphate isomerase type I  33.64 
 
 
278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0193  mannose-6-phosphate isomerase, type I  33.18 
 
 
278 aa  110  5e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0457  mannose-6-phosphate isomerase type I  30.99 
 
 
271 aa  106  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0743  putative mannose-6-phosphate isomerase  31.88 
 
 
267 aa  102  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594978  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4499  phosphomannose isomerase-like protein  30.71 
 
 
294 aa  97.1  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1783  hypothetical protein  28.87 
 
 
358 aa  96.7  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.203269  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0882  mannose-6-phosphate isomerase type I  27.98 
 
 
273 aa  95.1  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240719  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2595  phosphomannose isomerase-like protein  28.93 
 
 
355 aa  95.1  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0506616  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1592  phosphomannose isomerase-like protein  39.72 
 
 
268 aa  94.7  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1535  mannose-6-phosphate isomerase, type I  27.78 
 
 
262 aa  94.4  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.480559  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2255  Mannose-6-phosphate isomerase  36.32 
 
 
323 aa  92.4  9e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0223155  hitchhiker  0.00489167 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1482  Phosphomannose isomerase-like protein  26.95 
 
 
505 aa  87.4  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0924  mannose-6-phosphate isomerase  40.83 
 
 
307 aa  86.3  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0756  hypothetical protein  33.77 
 
 
587 aa  81.6  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.31068  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0639  mannose-6-phosphate isomerase-like protein  27.31 
 
 
584 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.459427  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2422  mannose-6-phosphate isomerase-like protein  27.02 
 
 
618 aa  79.7  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.167496 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0656  phosphomannose isomerase-like protein  29.41 
 
 
364 aa  79  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.189612  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3010  hypothetical protein  28.15 
 
 
587 aa  77  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020872  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2266  hypothetical protein  27.46 
 
 
609 aa  76.3  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3646  phosphomannose isomerase-like  27.21 
 
 
373 aa  74.3  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4282  hypothetical protein  25.74 
 
 
598 aa  70.5  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3966  PfkB domain protein  35.86 
 
 
680 aa  63.5  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173743  normal  0.0415319 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6091  hypothetical protein  35.4 
 
 
339 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05210  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.65 
 
 
414 aa  48.9  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.117407  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4035  mannose-6-phosphate isomerase, class I  29.81 
 
 
408 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0762844  normal  0.148973 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2138  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32 
 
 
394 aa  46.2  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.952255  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28540  phosphomannose isomerase  27.59 
 
 
349 aa  46.2  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.188562 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1586  mannose-6-phosphate isomerase, class I  31.58 
 
 
391 aa  44.3  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.762503  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2098  mannose-6-phosphate isomerase  36.11 
 
 
398 aa  43.9  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.302925 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2017  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.53 
 
 
391 aa  43.1  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01582  mannose-6-phosphate isomerase  30.53 
 
 
391 aa  43.1  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1799  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.53 
 
 
391 aa  43.1  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1821  mannose-6-phosphate isomerase  30.53 
 
 
391 aa  43.1  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.280304  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2323  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.53 
 
 
391 aa  42.7  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.734399  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1688  mannose-6-phosphate isomerase  30.53 
 
 
391 aa  43.1  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01572  hypothetical protein  30.53 
 
 
391 aa  43.1  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2030  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.53 
 
 
391 aa  43.1  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0478981  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1830  mannose-6-phosphate isomerase  32.04 
 
 
391 aa  42.7  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00725153 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>