77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0191 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0191  mannose-6-phosphate isomerase type I  100 
 
 
278 aa  560  1.0000000000000001e-159  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0193  mannose-6-phosphate isomerase, type I  89.93 
 
 
278 aa  513  1e-144  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1535  mannose-6-phosphate isomerase, type I  48.53 
 
 
262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.480559  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0882  mannose-6-phosphate isomerase type I  50.45 
 
 
273 aa  233  3e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240719  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0457  mannose-6-phosphate isomerase type I  40.24 
 
 
271 aa  193  3e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0321  mannose-6-phosphate isomerase  34.26 
 
 
316 aa  145  8.000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000805309  hitchhiker  0.00737279 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1708  mannose-6-phosphate isomerase  34.6 
 
 
315 aa  143  3e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.657704  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3397  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.86 
 
 
318 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0920  Mannose-6-phosphate isomerase  35.76 
 
 
321 aa  142  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0690486 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0314  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.74 
 
 
336 aa  142  5e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000281347  normal  0.468377 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1171  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.65 
 
 
314 aa  142  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1319  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.67 
 
 
318 aa  139  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0119683  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3528  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.65 
 
 
320 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21530  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.41 
 
 
353 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2149  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.65 
 
 
329 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1391  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.14 
 
 
325 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1688  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.49 
 
 
315 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.745586  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1205  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.14 
 
 
325 aa  135  8e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140202  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.84 
 
 
312 aa  135  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2217  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.84 
 
 
312 aa  135  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.735941  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0819  mannose-6-phosphate isomerase  37.5 
 
 
315 aa  133  3e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3743  mannose-6-phosphate isomerase  34.16 
 
 
323 aa  131  9e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.274174  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1681  mannose-6-phosphate isomerase, class I  40.1 
 
 
312 aa  132  9e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0475  phosphomannose isomerase type I  34.26 
 
 
309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.282321  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1752  mannose-6-phosphate isomerase, class I  31.37 
 
 
312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0921565  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3377  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.13 
 
 
310 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.308254  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0249  phosphomannose isomerase  38.76 
 
 
322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.289498  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2666  mannose-6-phosphate isomerase  30.77 
 
 
312 aa  127  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2722  mannose-6-phosphate isomerase  30.77 
 
 
312 aa  127  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0141  mannose-6-phosphate isomerase, class I  40.78 
 
 
318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0465  Mannose-6-phosphate isomerase  36.79 
 
 
365 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1263  phosphomannose isomerase  36.97 
 
 
321 aa  125  8.000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000784939  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0569  mannose-6-phosphate isomerase  34.78 
 
 
325 aa  125  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.114617 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0885  mannose-6-phosphate isomerase  31.97 
 
 
326 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365127  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0468  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.39 
 
 
336 aa  124  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2261  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.39 
 
 
316 aa  123  4e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1081  mannose-6-phosphate isomerase  34.8 
 
 
369 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1245  Mannose-6-phosphate isomerase  30.31 
 
 
306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.99 
 
 
349 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0511343  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0266  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.39 
 
 
322 aa  115  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3116  mannose-6-phosphate isomerase, class I  31.51 
 
 
363 aa  113  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0309  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.47 
 
 
326 aa  113  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2255  Mannose-6-phosphate isomerase  41.29 
 
 
323 aa  113  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0223155  hitchhiker  0.00489167 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0458  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.92 
 
 
320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1806  mannose-6-phosphate isomerase, class I  29.28 
 
 
319 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0467  mannose-6-phosphate isomerase  32.04 
 
 
328 aa  108  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3802  mannose-6-phosphate isomerase  35.94 
 
 
353 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1723  Mannose-6-phosphate isomerase  34.72 
 
 
344 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1575  mannose-6-phosphate isomerase  38.46 
 
 
195 aa  107  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3117  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.49 
 
 
314 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0284496  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1769  phosphomannose isomerase  30.61 
 
 
319 aa  107  3e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1668  mannose-6-phosphate isomerase type I  33.64 
 
 
326 aa  105  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0844191  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12883  putative mannose-6-phosphate isomerase  30.1 
 
 
325 aa  105  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0743  putative mannose-6-phosphate isomerase  36.18 
 
 
267 aa  103  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594978  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2595  Mannose-6-phosphate isomerase  33.33 
 
 
325 aa  102  5e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1327  Mannose-6-phosphate isomerase  29.93 
 
 
319 aa  100  3e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1059  mannose-6-phosphate isomerase  37.41 
 
 
315 aa  96.3  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191159 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1592  phosphomannose isomerase-like protein  31.79 
 
 
268 aa  94.4  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4499  phosphomannose isomerase-like protein  43.51 
 
 
294 aa  93.2  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1783  hypothetical protein  37.82 
 
 
358 aa  88.2  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.203269  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0924  mannose-6-phosphate isomerase  34.55 
 
 
307 aa  85.5  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2595  phosphomannose isomerase-like protein  30.57 
 
 
355 aa  79.7  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0506616  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3966  PfkB domain protein  30.3 
 
 
680 aa  70.5  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173743  normal  0.0415319 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0656  phosphomannose isomerase-like protein  35.25 
 
 
364 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.189612  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28540  phosphomannose isomerase  36.52 
 
 
349 aa  64.7  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.188562 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6091  hypothetical protein  30.42 
 
 
339 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1482  Phosphomannose isomerase-like protein  29.28 
 
 
505 aa  60.1  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3646  phosphomannose isomerase-like  30.51 
 
 
373 aa  52.8  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0756  hypothetical protein  25.7 
 
 
587 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.31068  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3010  hypothetical protein  23.74 
 
 
587 aa  49.3  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020872  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2422  mannose-6-phosphate isomerase-like protein  25 
 
 
618 aa  46.2  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.167496 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0639  mannose-6-phosphate isomerase-like protein  25 
 
 
584 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.459427  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1613  mannose-6-phosphate isomerase (phosphomannose isomerase)  33.72 
 
 
368 aa  43.9  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.194468  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6006  mannose-6-phosphate isomerase class I  32.32 
 
 
402 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000013531  normal  0.0800927 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001304  mannose-6-phosphate isomerase  28.28 
 
 
410 aa  43.5  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.604165  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02540  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.07 
 
 
400 aa  43.1  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4282  hypothetical protein  24.24 
 
 
598 aa  42.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>