95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0467 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0467  mannose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 328 aa  674    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0309  mannose-6-phosphate isomerase, class I  54.94 
 
 		 326 aa  360  2e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0458  mannose-6-phosphate isomerase, class I  53.07 
 
 		 320 aa  337  9.999999999999999e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12883  putative mannose-6-phosphate isomerase  50.92 
 
 		 325 aa  325  5e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0468  mannose-6-phosphate isomerase, class I  48.78 
 
 		 336 aa  309  5e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0266  mannose-6-phosphate isomerase, class I  48.33 
 
 		 322 aa  306  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21530  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.7 
 
 		 353 aa  231  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0465  Mannose-6-phosphate isomerase  39.63 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.67 
 
 		 349 aa  210  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0511343  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1319  mannose-6-phosphate isomerase, class I  40.24 
 
 		 318 aa  209  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0119683  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2595  Mannose-6-phosphate isomerase  37.46 
 
 		 325 aa  208  1e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1806  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.79 
 
 		 319 aa  204  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3743  mannose-6-phosphate isomerase  35.26 
 
 		 323 aa  203  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.274174  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0885  mannose-6-phosphate isomerase  35.78 
 
 		 326 aa  200  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365127  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1205  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.5 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140202  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1391  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.2 
 
 		 325 aa  193  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1081  mannose-6-phosphate isomerase  36.09 
 
 		 369 aa  193  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2149  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.55 
 
 		 329 aa  189  4e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1327  Mannose-6-phosphate isomerase  37.3 
 
 		 319 aa  189  5e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1263  phosphomannose isomerase  36.94 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000784939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3116  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.14 
 
 		 363 aa  187  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1171  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.25 
 
 		 314 aa  186  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1245  Mannose-6-phosphate isomerase  33.99 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3397  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.63 
 
 		 318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1723  Mannose-6-phosphate isomerase  34.81 
 
 		 344 aa  179  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1708  mannose-6-phosphate isomerase  37.54 
 
 		 315 aa  178  1e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.657704  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0819  mannose-6-phosphate isomerase  35.78 
 
 		 315 aa  176  6e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0314  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.83 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000281347  normal  0.468377 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1688  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.51 
 
 		 315 aa  172  9e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.745586  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0249  phosphomannose isomerase  35.9 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.289498  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1752  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.66 
 
 		 312 aa  170  4e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0921565  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3802  mannose-6-phosphate isomerase  36.34 
 
 		 353 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3528  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.4 
 
 		 320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3377  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.6 
 
 		 310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.308254  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2261  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.31 
 
 		 316 aa  162  9e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0321  mannose-6-phosphate isomerase  34.2 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000805309  hitchhiker  0.00737279 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0141  mannose-6-phosphate isomerase, class I  42.93 
 
 		 318 aa  160  4e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1668  mannose-6-phosphate isomerase type I  32.03 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0844191  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2666  mannose-6-phosphate isomerase  34.27 
 
 		 312 aa  157  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2722  mannose-6-phosphate isomerase  34.27 
 
 		 312 aa  157  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3117  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.15 
 
 		 314 aa  156  4e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0284496  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.21 
 
 		 312 aa  153  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2217  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.21 
 
 		 312 aa  153  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.735941  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0569  mannose-6-phosphate isomerase  29.81 
 
 		 325 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114617 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1575  mannose-6-phosphate isomerase  41.71 
 
 		 195 aa  145  8.000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0920  Mannose-6-phosphate isomerase  31.65 
 
 		 321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0690486 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1769  phosphomannose isomerase  34.29 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1681  mannose-6-phosphate isomerase, class I  31.76 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2595  phosphomannose isomerase-like protein  27.22 
 
 		 355 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0506616  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0475  phosphomannose isomerase type I  36.32 
 
 		 309 aa  126  5e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.282321  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1059  mannose-6-phosphate isomerase  31.76 
 
 		 315 aa  123  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191159 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2255  Mannose-6-phosphate isomerase  30.87 
 
 		 323 aa  119  7e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0223155  hitchhiker  0.00489167 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0924  mannose-6-phosphate isomerase  37.58 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0743  putative mannose-6-phosphate isomerase  33.86 
 
 		 267 aa  114  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594978  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4499  phosphomannose isomerase-like protein  41.73 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1783  hypothetical protein  33.33 
 
 		 358 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.203269  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0193  mannose-6-phosphate isomerase, type I  30.06 
 
 		 278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1535  mannose-6-phosphate isomerase, type I  33.76 
 
 		 262 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.480559  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0191  mannose-6-phosphate isomerase type I  32.04 
 
 		 278 aa  108  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1592  phosphomannose isomerase-like protein  36.84 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3966  PfkB domain protein  28.71 
 
 		 680 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173743  normal  0.0415319 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0882  mannose-6-phosphate isomerase type I  31.85 
 
 		 273 aa  102  9e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240719  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0457  mannose-6-phosphate isomerase type I  31.12 
 
 		 271 aa  100  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1482  Phosphomannose isomerase-like protein  24.37 
 
 		 505 aa  91.3  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0656  phosphomannose isomerase-like protein  27.08 
 
 		 364 aa  88.6  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.189612  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28540  phosphomannose isomerase  28.46 
 
 		 349 aa  88.6  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.188562 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0756  hypothetical protein  23.51 
 
 		 587 aa  87  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.31068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0639  mannose-6-phosphate isomerase-like protein  29.64 
 
 		 584 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.459427  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2266  hypothetical protein  31.3 
 
 		 609 aa  79.7  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2422  mannose-6-phosphate isomerase-like protein  23.85 
 
 		 618 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.167496 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3646  phosphomannose isomerase-like  25.76 
 
 		 373 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4282  hypothetical protein  23.7 
 
 		 598 aa  77  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6091  hypothetical protein  27.65 
 
 		 339 aa  76.6  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3010  hypothetical protein  28.69 
 
 		 587 aa  76.3  0.0000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020872  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0902  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.74 
 
 		 387 aa  50.8  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.942803  normal  0.0915708 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1116  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.33 
 
 		 394 aa  50.4  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0922592 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1257  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.33 
 
 		 425 aa  50.1  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000844984 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1186  mannose-6-phosphate isomerase  25.15 
 
 		 416 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.215297  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0965  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.02 
 
 		 387 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.857697  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1172  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.26 
 
 		 399 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0791265  normal  0.965156 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0016  mannose-6-phosphate isomerase  30.56 
 
 		 423 aa  47.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.976239  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4165  mannose-6-phosphate isomerase, class I  28.7 
 
 		 406 aa  46.2  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.292455  normal  0.858964 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2015  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.93 
 
 		 401 aa  46.2  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000590051  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2098  mannose-6-phosphate isomerase  30.48 
 
 		 398 aa  45.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.302925 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6006  mannose-6-phosphate isomerase class I  31.87 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000013531  normal  0.0800927 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4035  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.64 
 
 		 408 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0762844  normal  0.148973 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0860  mannose-6-phosphate isomerase, class I  31 
 
 		 395 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4295  mannose-6-phosphate isomerase, class I  31.11 
 
 		 391 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3605  predicted protein  40 
 
 		 407 aa  43.9  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30820  mannose-6-phosphate isomerase, class I  28.35 
 
 		 415 aa  43.9  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3297  mannose-6-phosphate isomerase, class I  26.36 
 
 		 416 aa  43.9  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2543  mannose-6-phosphate isomerase, class I  27.83 
 
 		 412 aa  43.5  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3511  mannose-6-phosphate isomerase  31.31 
 
 		 369 aa  43.5  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0605  mannose-6-phosphate isomerase  27.93 
 
 		 401 aa  43.5  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2647  mannose-6-phosphate isomerase  41.38 
 
 		 399 aa  42.7  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>